R的极客理想系列文章,涵盖了R的思想,使用,工具,创新等的一系列要点,以我个人的学习和体验去诠释R的强大。
R语言作为统计学一门语言,一直在小众领域闪耀着光芒。直到大数据的爆发,R语言变成了一门炙手可热的数据分析的利器。随着越来越多的工程背景的人的加入,R语言的社区在迅速扩大成长。现在已不仅仅是统计领域,教育,银行,电商,互联网….都在使用R语言。
要成为有理想的极客,我们不能停留在语法上,要掌握牢固的数学,概率,统计知识,同时还要有创新精神,把R语言发挥到各个领域。让我们一起动起来吧,开始R的极客理想。
关于作者:
- 张丹(Conan), 程序员Java,R,PHP,Javascript
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http://blog.fens.me/r-cairo/
前言
R语言不仅在统计分析,数据挖掘领域,计算能力强大。在数据可视化上,也不逊于昂贵的商业。当然,背后离不开各种开源软件包的支持,Cairo就是这样一个用于矢量图形处理的类库。
Cairo可以创建高质量的矢量图形(PDF, PostScript, SVG) 和 位图(PNG, JPEG, TIFF),同时支持在后台程序中高质量渲染!
本文将介绍,Cairo在R语言中的使用。
目录
- Cairo介绍
- Cairo安装
- Cairo使用
1. Cairo介绍
在信息领域中,cairo 是一个让用于提供矢量图形绘图的免费库,cairo 提供在多个背景下做 2D 的绘图,高级的更可以使用硬件加速功能。
虽然 cairo 是使用C语言撰写的,但是当使用 cairo 时,可以用许多其他种语言来使用,包括有 C++、C#、Java、Python、Perl、Ruby、Scheme、Smalltalk 以及许多种语言,cairo 在 GNU LGPL 与 Mozilla Public License (MPL) 两个认证下发布。
上文介绍,摘自:http://zh.wikipedia.org/wiki/Cairo_(绘图)
R语言Cairo接口的官方发布页:http://www.rforge.net/Cairo/
2. Cairo安装
系统环境
- Linux: Ubuntu 12.04.2 LTS 64bit
- R: 3.0.1 x86_64-pc-linux-gnu
Cairo基本库安装
~ sudo apt-get install libcairo2-dev
~ sudo apt-get install libxt-dev
~ R
> install.packages("Cairo")
** R
** preparing package for lazy loading
** help
*** installing help indices
** building package indices
** testing if installed package can be loaded
Warning: ignoring .First.lib() for package ‘Cairo’
* DONE (Cairo)
3. Cairo使用
Cairo使用起来非常简单,和基础包grDevices中的函数对应。
- CairoPNG: 对应grDevices:png()
- CairoJPEG: 对应grDevices:jpeg()
- CairoTIFF: 对应grDevices:tiff()
- CairoSVG: 对应grDevices:svg()
- CairoPDF: 对应grDevices:pdf()
我常用的图形输出,就是png和svg。
检查Cairo的兼容性:
~ R
> library(Cairo)
> Cairo.capabilities()
png jpeg tiff pdf svg ps x11 win raster
TRUE TRUE FALSE TRUE TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE
下面比较一下 CairoPNG() 和 png() 输出效果。
1). 散点图
x<-rnorm(6000)
y<-rnorm(6000)
# PNG图
png(file="plot4.png",width=640,height=480)
plot(x,y,col="#ff000018",pch=19,cex=2,main = "plot")
dev.off()
CairoPNG(file="Cairo4.png",width=640,height=480)
plot(x,y,col="#ff000018",pch=19,cex=2,main = "Cairo")
dev.off()
# SVG图
svg(file="plot-svg4.svg",width=6,height=6)
plot(x,y,col="#ff000018",pch=19,cex=2,main = "plot-svg")
dev.off()
CairoSVG(file="Cairo-svg4.svg",width=6,height=6)
plot(x,y,col="#ff000018",pch=19,cex=2,main = "Cairo-svg")
dev.off()
以下为PNG图:
2). 三维截面图
x <- seq(-10, 10, length= 30)
y <- x
f <- function(x,y) { r <- sqrt(x^2+y^2); 10 * sin(r)/r }
z <- outer(x, y, f)
z[is.na(z)] <- 1
# PNG图
png(file="plot2.png",width=640,height=480)
op <- par(bg = "white", mar=c(0,2,3,0)+.1)
persp(x, y, z,
theta = 30, phi = 30,
expand = 0.5,
col = "lightblue",
ltheta = 120,
shade = 0.75,
ticktype = "detailed",
xlab = "X", ylab = "Y", zlab = "Sinc(r)",
main = "Plot"
)
par(op)
dev.off()
CairoPNG(file="Cairo2.png",width=640,height=480)
op <- par(bg = "white", mar=c(0,2,3,0)+.1)
persp(x, y, z,
theta = 30, phi = 30,
expand = 0.5,
col = "lightblue",
ltheta = 120,
shade = 0.75,
ticktype = "detailed",
xlab = "X", ylab = "Y", zlab = "Sinc(r)",
main = "Cairo"
)
par(op)
dev.off()
以下为PNG图:
3). 文字显示
library(MASS)
data(HairEyeColor)
x <- HairEyeColor[,,1]+HairEyeColor[,,2]
n <- 100
m <- matrix(sample(c(T,F),n^2,replace=T), nr=n, nc=n)
# PNG图
png(file="plot5.png",width=640,height=480)
biplot(corresp(m, nf=2), main="Plot")
dev.off()
CairoPNG(file="Cairo5.png",width=640,height=480)
biplot(corresp(m, nf=2), main="Cairo")
dev.off()
# SVG图
svg(file="plot-svg5.svg",width=6,height=6)
biplot(corresp(m, nf=2), main="Plot-svg")
dev.off()
CairoSVG(file="Cairo-svg5.svg",width=6,height=6)
biplot(corresp(m, nf=2), main="Cairo-svg")
dev.off()
以下为PNG图:
我们查看两个文件的属性:以png直接生成的图54KB,以CairoPNG生成的图43.8KB。
综上的3个例子,我分辨不出太大区别,只是Cairo感觉更淡、更柔和一些。
大家不妨找一些更复杂的图形来尝试着比较。
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