在法国的历史上，曾经有这么一场的内战，是法国天主教势力和新教胡格诺派（即加尔文派）之间进行的一场长期战争。它虽然带有明显的宗教的色彩，但性质和内容而言，则是法国的一场内战。
在中世纪的法国，王权和贵族割据势力不断斗争，由于经济利益和宗教信仰的不同，反对王权专制的贵族逐渐分成了两个集团：一个是以王室近亲吉斯公爵和洛林红衣主教查理为首的强大的天主教集团，他们对国王有举足轻重的影响；
一个是以波旁家族的孔代亲王、纳瓦尔国王亨利、海军上将科利尼为代表的新教胡格诺派集团。
胡格诺派战争的直接的导火索是“瓦西镇屠杀”。早在16世纪40年代，亨利二世就曾让特别法庭以惩办异端为名，将大批胡格诺派教徒处以火刑。
1559年，佛朗索瓦二世继位后，因为他的年纪太轻，大权旁落到了吉斯家族手中，致使新旧教派冲突更加加剧。
1562年3月1日，胡格诺派教徒正在瓦西镇举行宗教仪式，吉斯公爵率军队赶到，大肆屠杀，胡格诺派死伤将近200人。
1562年12月，天主教和胡格诺派在德勒交战，这一战中，天主教徒的将领蒙朗西被俘，元帅安德烈战死。
1563年2月，在奥尔良一战中，吉斯公爵被暗杀，而胡格诺派的纳瓦尔国王安托万在鲁昂之围中战死。
1563年3月，王后卡特琳发布“安布瓦斯敕令”，给了新教徒信仰自由和在指定地区举行宗教仪式的自由。
1567年9月，新教胡格诺派包围了巴黎，11月，双方在圣德尼交战，德国新教派兵驰援法国新教，使胡格诺派兵力得以增强，战胜了天主教。
1568年，法国天主教和宫廷被迫签订了《隆朱莫条约》。9月，在天主教的压力下，查理九世撤销了宗教宽容敕令。
1569年3月，新教军队在雅尔纳克被天主教军队击败，孔代战死。
1570年，为了缓和两派的关系，太后卡特琳签署“日尔曼敕令”，新教徒又获得了有限的信教自由。
1572年8月23日，吉斯公爵之子亨利乘胡格诺派的重要人物聚集巴黎庆祝起领袖亨利婚礼之机，以巴黎各教堂的钟声为号，率军对胡格诺派进行突然袭击，杀死胡格诺派教徒2000多人。
由于24日正值圣巴托罗缪节，因此这一血腥的夜晚在历史上被称为“圣巴托罗缪之夜”。
这次大屠杀后，胡格诺派在法国南部和西南部组成联邦共和国，并于1575年发动全面的起义，很快席卷了法国南部的大部分地区。
1576年5月，法王亨利三世签署“博利厄敕令”，给予新教在一切的城市举行宗教仪式的自由。
天主教对此强烈的不满，吉斯公爵亨利成立天主教神圣同盟，两派战争又起。
1577年9月，战败的胡格诺派与天主教派缔结“贝日拉克和约”，使“博利厄敕令”给予新教的自由和权力得到了限制。
1585年，得到西班牙支持的吉斯公爵亨利在南特重建天主教同盟，亨利三世也撤销两次敕令，胡格诺派则在波旁家庭的纳瓦尔国王亨利的带领下，于1587年在库拉特击败了天主教的军队。
1588年5月，吉斯公爵亨利进入巴黎城，包围王室所在的卢浮宫，亨利三世逃出巴黎，并签署敕令满足天主教的一切要求。
同年的12月，吉斯公爵和天主教所有的首领被国王近卫军暗杀，巴黎发生了暴乱，成立了以吉斯家族为首的新政权，亨利三世不得不与波旁家族结盟。
1589年，纳瓦尔国王亨利在亨利三世被刺杀后成为法王亨利四世。
天主教拒不承认亨利四世的法王地位，所以亨利四世无法进入巴黎，而当时法国百分之九十以上的人口信仰天主教。
1593年7月25日，在重压和形式的逼迫下，亨利四世在圣德尼大教堂改信天主教，并与天主教达成休战的协定。
1594年3月22日，亨利四世进入巴黎，并于1598年4月颁布“南特敕令”，宣布天主教为国教，胡格诺派在法国全境有信仰的自由，“南特敕令”保留了胡格诺派的一些特权，打破了天主教一统天下的局面，而至此，持续了30多年的胡格诺战争结束了。