ubuntu windows 分别安装openslide

为了读图，分别在ubuntu 和 windows 下安装openslide。亲测成功

ubuntu

Openslide是医学图像一个重要的库，这里给出三条命令进行安装

sudo apt-get install openslide-tools

sudo apt-get install python-openslide

pip install openslide-python

可以参考我的另一篇博文 https://blog.csdn.net/weixin_37485708/article/details/86416208 其中有一步是安装openslide

（ 参考 http://www.bubuko.com/infodetail-2316068.html）

windows

(参考： https://blog.csdn.net/m0_37151059/article/details/79114735)

电脑里应该有 visual studio！！！否则pip时会报错，说Microsoft Visual C++14.0 is required.....我笔记本安装的2013版本，电脑里是2015版本，都有这个

就可以按照下面的步骤顺利安装啦！ 

1、首先在 https://openslide.org/download/  下载openslide的二进制文件

注意计算机的位数，下载好后解压即可，然后把 bin 和 lib 加入环境变量的path中，我的如图所示：

 

2、pip install openslide-python

 可以导入啦！

下面写的是第一次失败的尝试，只作为记录，大家不要看！！

1、下载openslide

https://openslide.org/download/

安装openslide-python 直接参考这博客，几句命令即可 https://www.linuxidc.com/Linux/2017-09/147188.htm?utm_source=tuicool

sudo apt-get install openslide-tools

sudo apt-get install python-openslide

import openslide 

我选择openslide3.4.1,下载好后解压 tar -xvzf openslide-3.4.1.tar.gz -C openslide （指定解压在openslide文件夹内）

2、安装一些库

参考 https://blog.csdn.net/caicai2526/article/details/71366326

1. sudo apt-get install libopenjpeg-dev libsqlite3-dev 
2. sudo apt-get install openslide-tools 
3. sudo apt-get install python-openslide 
4. sudo apt-get install python3-openslide

3、make 安装openslide

cd /home/cassiel/文档/openslide/openslide-3.4.1 

./configure

出现error ：configure: error: in `/home/cassiel/文档/openslide/openslide-3.4.1':configure: error: cannot find libjpeg

想起来，前面那一堆库忘了安装

1、下载安装jpeg

 http://www.ijg.org/ 同样解压到openslide了 tar -xvzf jpegsrc.v9c.tar.gz -C openslide 

从终端进入到 libjpeg 所在目录，用常规方法即可安装，命令如下：
        ./configure
         make
         sudo make install        （注意！一定要用sudo安装！否则make通过make install通不过）
        ＃make test                  （用于测试）

2、安装zlib https://blog.csdn.net/qq_21383435/article/details/79539034 

tar -xvzf zlib-1.2.11.tar.gz -C openslide

进入解压后的文件夹 ./configure ; make ; sudo make install 

3、安装libtiff http://download.osgeo.org/libtiff/  同上 ; libtiff 使用  https://www.cnblogs.com/hujianhua/p/3261013.html

4、安装 libpng https://sourceforge.net/projects/libpng/files/ 我选择的版本：1.5.30

 

库还没有完全安装好，但是现在python里面是可以import openslide的（我也很奇怪）明明下载的openslide还没有make成功呀。

https://blog.csdn.net/weixin_41787032/article/details/79817926

https://blog.csdn.net/weixin_41787032/article/details/79845912

按照这两个教程，读出了一个图片，但是我的opencv还没有安装好。

先把环境搞定叭。

如果你也在学习医学图像处理，欢迎留言讨论！一起学习

另一个在ubuntu下安装的方法

先下载tar.gz文件，解压 tar -zxvf .....tar.gz

进入python虚拟环境 source activate tf-gpu

cd 解压后的文件，里面有个setup.py

python setup,py build

python setup.py install 

安装结束