遗传算法的基本原理和matlab实现

         遗传算法解决全局优化(即为最值点如图中C,D),而局部最优解决的是极值点问题(如图中A,B

1.       遗传算法流程;

 

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  1. %遗传算法的伪代码描述:  
  2. %Procedure GA  
  3. %Begin  
  4. %       T=0;  
  5. %       Initialize  p(t) ; //p(t)表示 t代种群  
  6. %       Evaluate p(t);  //评估第t代种群  
  7. %       While not finished do  
  8. %       Begin  
  9. %            T=t+1;  
  10. %            Select p(t) from p(t-1); //从上代种群众选择较优秀的个体到下代子群  
  11. %            Reproduce pairs in p(t);  
  12. %            Evaluate p(t);  
  13. %       End  
  14. %End  

生物

算法

选择、交叉、变异

者生存

适应度

 

故遗传算法主要过程及流程图如下

1)编码(适应度函数,产生初始种群)

2)遗传算子(选择、交叉、变异)

3)繁衍种群

2.       参数初始化,编码阶段

假设目标函数为 

a.      定义个体基因,基因是遗传密码,这里自变量就是基因所携带的信息,即用2进制来表示自变量的可能取值。基因序列的长度由自变量取值范围确定。

b.     定义适应度函数,目标函数是,适应度函数就定义为。

c.      由a,b可知,我们定义好了个体(基因)与适应度函数,现初始化种群,定义种群大小,及繁衍代数。

1M:种群规模

2T:遗传运算的终止进化代数

3Pc:交叉概率

4Pm:变异概率


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  1. %% @authors Keung Charteris & T.s.road CZQ  
  2. % @version 1.0 ($Revision$)  
  3. % @date 7/9/2016 $LastChangedDate$  
  4. % @addr. GUET, Gui Lin, 540001,  P.R.China  
  5. % @contact : [email protected]  
  6. % @date Copyright(c) 2016-2020,  All rights reserved.  
  7. % This is an open access code distributed under theCreative Commons Attribution License, which permits  
  8. % unrestricted use, distribution, and reproduction in anymedium, provided the original work is properly cited.  
  9.   
  10. functionTestGA0904()  
  11.   
  12. clc;  %清除所有  
  13. clear all;%清除变量  
  14. close all;%关闭图片  
  15. format long  
  16.   
  17. %  step 1 编写目标函数  
  18. FUN =@(x) (x)^2+81*sin(x);  
  19.   
  20. %  step 2 生成初始种群,大小为100  
  21. initPop={[0, 9],100,10};  
  22.   
  23. [BestPop,Trace]=fga(FUN,initPop{1,1}(1),initPop{1,1}(2),initPop{1,2},initPop{1,3});  

 

3.       遗传算子

         遗传算法使用选择运算来实现对群体中的个体进行优胜劣汰操作:适应度高的个体被遗传到下一代群体中的概率大;适应度低的个体,被遗传到下一代群体中的概率小。选择操作的任务就是按某种方法从父代群体中选取一些个体,遗传到下一代群体。

a.         轮盘赌选择又称比例选择算子,它的基本思想是:各个个体被选中的概率与其适应度函数值大小成正比。设群体大小为n,个体i 的适应度为 Fi,则个体i 被选中遗传到下一代群体的概率为:

 

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  1. %% @authorsKeung Charteris & T.s.road CZQ  
  2. % @version1.0 ($Revision$)  
  3. % @date6/9/2016 $LastChangedDate$  
  4. % @addr.GUET, Gui Lin, 540001,  P.R.China  
  5. % @contact :[email protected]  
  6. % @dateCopyright(c)  2016-2020,  All rights reserved.  
  7. % This is anopen access code distributed under the Creative Commons Attribution License,which permits  
  8. %unrestricted use, distribution, and reproduction in any medium, provided theoriginal work is properly cited.  
  9.    
  10. %选择操作  
  11. %采用基于轮盘赌法的非线性排名选择  
  12. %各个体成员按适应值从大到小分配选择概率:  
  13. %P(i)=(q/1-(1-q)^n)*(1-q)^i,  其中 P(0)>P(1)>...>P(n), sum(P(i))=1  
  14.    
  15. function [selectpop]=NonlinearRankSelect(FUN,pop,bounds,bits)  
  16.   
  17. global m n  
  18. selectpop=zeros(m,n);  
  19. fit=zeros(m,1);  
  20. for i=1:m  
  21.        fit(i)=feval(FUN(1,:),(b2f(pop(i,:),bounds,bits)));%以函数值为适应值做排名依据  
  22. end  
  23. selectprob=fit/sum(fit);%计算各个体相对适应度(0,1)  
  24. q=max(selectprob);%选择最优的概率  
  25. x=zeros(m,2);  
  26. x(:,1)=[m:-1:1]';  
  27. [yx(:,2)]=sort(selectprob);  
  28. r=q/(1-(1-q)^m);%标准分布基值  
  29. newfit(x(:,2))=r*(1-q).^(x(:,1)-1);%生成选择概率  
  30. newfit=cumsum(newfit);%计算各选择概率之和  
  31. rNums=sort(rand(m,1));  
  32. fitIn=1;newIn=1;  
  33. while newIn<=m  
  34.         ifrNums(newIn)
  35.                selectpop(newIn,:)=pop(fitIn,:);  
  36.                 newIn=newIn+1;  
  37.         else  
  38.                 fitIn=fitIn+1;  
  39.         end  
  40. end  


b.        交叉运算,是指对两个相互配对的染色体依据交叉概率 Pc 按某种方式相互交换其部分基因,从而形成两个新的个体。交叉运算是遗传算法区别于其他进化算法的重要特征,它在遗传算法中起关键作用,是产生新个体的主要方法。 SGA中交叉算子采用单点交叉算子。

交叉前

交叉后

00000|01110000000010000

11100|00000111111000101

00000|00000111111000101

11100|01110000000010000

 

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  8. %unrestricted use, distribution, and reproduction in any medium, provided theoriginal work is properly cited.  
  9.   
  10. %交叉操作  
  11.   
  12. function [NewPop]=CrossOver(OldPop,pCross,opts)  
  13. %OldPop为父代种群,pcross为交叉概率  
  14.   
  15. global m NewPop  
  16. r=rand(1,m);  
  17. y1=find(r
  18. y2=find(r>=pCross);  
  19. len=length(y1);  
  20. if len>2&&mod(len,2)==1%如果用来进行交叉的染色体的条数为奇数,将其调整为偶数  
  21.     y2(length(y2)+1)=y1(len);  
  22.     y1(len)=[];  
  23. end  
  24.   
  25. if length(y1)>=2  
  26.    for i=0:2:length(y1)-2  
  27.        ifopts==0  
  28.           [NewPop(y1(i+1),:),NewPop(y1(i+2),:)]=EqualCrossOver(OldPop(y1(i+1),:),OldPop(y1(i+2),:));  
  29.        else  
  30.           [NewPop(y1(i+1),:),NewPop(y1(i+2),:)]=MultiPointCross(OldPop(y1(i+1),:),OldPop(y1(i+2),:));  
  31.        end  
  32.    end      
  33. end  
  34. NewPop(y2,:)=OldPop(y2,:);  

 

c.         所谓变异运算,是指依据变异概率 Pm 将个体编码串中的某些基因值用其它基因值来替换,从而形成一个新的个体。遗传算法中的变异运算是产生新个体的辅助方法,它决定了遗传算法的局部搜索能力,同时保持种群的多样性。交叉运算和变异运算的相互配合,共同完成对搜索空间的全局搜索和局部搜索。 SGA中变异算子采用基本位变异算子。

变异前

变异后

000001110000000010000

000001110001000010000

 

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  9.   
  10. %变异操作  
  11. function [NewPop]=Mutation(OldPop,pMutation,VarNum)  
  12.   
  13. global m n NewPop  
  14. r=rand(1,m);  
  15. position=find(r<=pMutation);  
  16. len=length(position);  
  17. if len>=1  
  18.         fori=1:len  
  19.                 k=unidrnd(n,1,VarNum); %设置变异点数,一般设置1点  
  20.                 forj=1:length(k)  
  21.                         ifOldPop(position(i),k(j))==1  
  22.                                OldPop(position(i),k(j))=0;  
  23.                         else  
  24.                                OldPop(position(i),k(j))=1;  
  25.                         end  
  26.                 end  
  27.         end  
  28. end  
  29. NewPop=OldPop;  


结果如下:

 

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