Amber计算MM能量

如果是需要计算蛋白质等体系的MM能量，不需要进行结构优化，即单点MM能量，在隐式环境中的输入脚本为：

energy minimization
 &cntrl
  imin=1,
  ntb=0,
  maxcyc=1,
  cut=9999.0,
 /

然后运行命令：

sander -O -i min.in -o md1.out -p prmtop -c inpcrd1

md1.out的结果