R note for Bioinfo :选择调用的列是未定义的

R note for Bioinfo :选择调用的列是未定义的

出现的问题:

根据GPL号下载返回的对象,用Table命令处理时,
输入:Table(gpl号)[1:选取的行数,c(“ID”,”其他列属性”,。。。)]
出现报错:
Error in [.data.frame… undefined columns selected

解决问题的方案:
Table(gpl号)[1:选取的行数,c(“ID”,”其他列属性”,。。。)]
注意将这里的其他列属性与原数据库进行比对,看是否一致
将不一致的列属性进行修改成与原数据库的列字段一致后
报错消失,正确运行

解决问题的具体命令:

Table(gpl号)[1:10,c(“ID”,”GB_ACC”,”Gene Title”,”Gene Symbol”,”ENTREZ_GENE_ID”)]

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