2020年10月19日，第19届人类蛋白质组组织世界网络大会（hupo2020.org）上，新一代4D蛋白质组学技术因捕集离子淌度技术（TIMS）和平行积累连续碎裂（PASEF®）方法的成功商业化而获得HUPO科学技术奖。该奖项以表彰新的方法改变了科学家研究蛋白质组学的方式，验证了timsTOF Pro使用短梯度的大队列深度4D-蛋白质组学在转化医学中的应用。
同年2020年12月，蛋白质组领域领军科学家Matthias Mann团队(Max Planck Institute of Biochemistry)、Hannes Röst团队(University of Toronto)、Ben Collins团队（ETH Zurich）以及Ruedi Aebersold团队（ETH Zurich）在Nature methods（IF:30.822）发表题为“diaPASEF: parallel accumulation–serial fragmentation combined with data-independent acquisition”的文章，其共同开发的基于4D平台的DIA技术——diaPASEF，能够全面提升蛋白质鉴定覆盖率、重现性和定量准确性。
近年来，随着组学技术在各个领域的不断发展，研究者们对于各种组学技术的需求和要求越来越高，希望能同时兼顾检测的通量、灵敏度及准确性，并能从不同分子层面系统地进行整合分析，从更全面更多维更深层次的角度去挖掘生命现象背后的机制及意义。
我们鹿明生物也在后基因组时代的多组学浪潮中，针对我们已有的蛋白组技术、代谢组技术不断地迭代升级，组合创新，希望以最好的技术为科学家们服务，为生命科学研究助力。下面一起来了解一下我们的最新技术及最新福利活动吧！
1.4D-DIA技术
●技术介绍
离子淌度分离概念的引入使得蛋白质组学进入了4D新时代。4D-Proteomics™是在3D分离即保留时间（retention time）、质荷比（m/z）、离子强度（intensity）这三个维度的基础之上增加了第四个维度，离子淌度（mobility）的分离，进而大幅度的提高扫描速度和检测灵敏度，带来蛋白质组学在鉴定深度、检测周期、定量准确性等性能的全面提升。
图1 | 新一代4D-蛋白质组学示意图
DIA（Data-Independent Acquisition，数据非依赖采集）相较于DDA（Data-Dependent Acquisition，数据依赖采集）的方法通过将整个全扫描范围分为若干个窗口，并循环地对每个窗口中的所有离子进行碎裂和检测，减少了缺失值，信息更全面，定量准确且更稳定，有望在大样本队列中实现可重复和准确的蛋白质组定量。
4D-DIA同时集合了4D蛋白质组和DIA技术的优势，能够全面提升蛋白质鉴定能力、检测灵敏度和数据完整性，展现了其在蛋白质组学领域的强大功能和广泛应用前景，具有划时代的重大意义。
●技术优势
1.近乎100%的离子利用率，提升检测灵敏度；
2.更高的检测深度和覆盖度；
3.定量重复性、完整性、可靠性全面提升。
2.LC-MS&GC-MS非靶向代谢组学双平台
●技术介绍
不同的质谱平台灵敏度及偏向性都不一样，而且不同平台之间具有互补性。LC-MS平台对代谢物的覆盖最广、灵敏度更高，相比于GC-MS，无需衍生处理。LC-MS平台可以检测到的物质峰可以达到几千甚至上万，有定性信息的物质在1000个以上。GC-MS可以作为LC-MS热稳定化合物的一种补充，一般GC-MS平台可以定性到的代谢物在200个以上。
鹿明生物通过优化的前处理方法并结合GCMS和LCMS平台各自优势，同时配套多年积累的拥有自主产权的自建数据库，实现一份样本双平台检测，极大地提高了代谢物鉴定的数量和准确性，为您提供更全面更精准的代谢组学服务。
●平台优势
1.性价比高，一份价格双平台结果；
2.覆盖度广，从初级到次级代谢物全面覆盖；
3.数据库全，拥有自主产权GCMS LUG库（2000+）&医学类LCMS自建库EMDB（3600+）&植物类LCMS自建库PMDB（6000+）；
4.质控严格，从样本前处理质控，到残留评估、组间质控、组内质控、数据处理质控五大质控过程为结果保驾护航；
5.分析丰富，单/多维统计分析、相关性分析、通路分析、个性化分析。
3.蛋白组代谢组联合分析
对蛋白组和代谢组两个分子层次的组学数据进行整合分析，一方面可以结合两个组学的分析结果，进行相互验证，提高后续实验验证成功率；另一方面也有助于相互补充，并且使研究更加系统。最终实现对生物变化大趋势与方向的综合了解，提出分子生物学变化机制模型，并筛选出重点代谢通路相关的蛋白质或者代谢产物，从而为后续进行深入实验与分析提供数据基础。
●案例报告（部分）展示：
基于新一代4D蛋白质组学，研究者将能够对复杂样品的分子机制进行更深入的研究、提高发现低丰度生物学重要蛋白质的可能性，并在转化医学、临床蛋白质组学等研究中具有广泛的应用前景，也标志着蛋白质组学正式进入“4D 新时代”。
大家是否有以下困惑：
4D-DIA技术如何助力您的科研，玩转热点研究？
4D-DIA技术目前的进展与应用如何？国自然项目有哪些热点？
蛋白组学4D-DIA技术如何结合代谢组学技术做联合研究？
为此鹿明生物特邀布鲁克应用工程师杜潇贤老师和大家一起实时分享4D-DIA实战应用~
（讲座内还有礼品抽奖环节不容错过哦~）
特邀嘉宾
嘉宾简介
杜潇贤
毕业于复旦大学。从事基于质谱的蛋白质组学研究，具有丰富的组学实验，质谱和数据分析经验，现任布鲁克应用工程师。
报告介绍：
1、4D-蛋白质组学原理和技术优势；
2、dia-PASEF®技术原理介绍和技术进展；
3、4D-蛋白质组学最新技术进展；
嘉宾简介
方后琴
毕业于同济大学，从事蛋白质组学行业8年，具有丰富的蛋白组研究经验，熟悉DIA、标记定量及Labelfree等多种类型的质谱实验及数据分析方法，以一作在《Analytical Chemistry》期刊上发表学术论文1篇，获得国家发明专利授权2项。
报告介绍：
1、DIA原理、技术特点及研究流程；
2、4D-DIA技术及最新研究进展；
3、4D-DIA技术在蛋白质组学中的应用；
嘉宾简介
钟晓彬
鹿明生物华南区产品经理，负责华南区科研服务市场推广运营，从事多组学实验研究6年，擅长代谢组实验方案设计、数据分析，协助客户发表文章、申报基金，地方项目以及科研成果转化等；
报告介绍：
1、蛋白代谢国自然项目梳理和思路介绍，蛋白代谢项目市场前景分析；
2、4D-DIA技术介绍、实验流程、高分文章研究思路和应用；
3、GC-MS和LC-MS双平台技术介绍、实验操作、案例展示；
4、多组学技术联合分析思路；
报名方式
1.关注鹿明生物公众号；
长按扫码添加“小鹿老师”微信报名
4D-DIA 参考文献
平行累积连续碎裂技术与数据非依赖性采集模式相结合
DIA PASEF: parallel accumulation–serial fragmentation
combined with data-independent acquisition
发表期刊：Nature Methods
影响因子：30.822
发表时间：2020.11.30
新冠肺炎早期的免疫抑制
Immune suppression in the early stage of COVID-19 disease
发表期刊：Nature Communications
影响因子：12.121
发表时间：2020.11.17
分布式多中心蛋白表型分析结果的稳定一致性支持精准治疗研究
Standardization and harmonization of distributed multi-center
proteotype analysis supporting precision medicine studies
发表期刊：Nature Communications
影响因子：12.121
发表时间：2020.10.16
无需光谱库，通过DIA技术实现快速、深度的磷酸化蛋白质组特异位点分析
Rapid and site-specific deep phosphoproteome profiling by
data-independent acquisition without the need for spectral
libraries
发表期刊：Nature Communications
影响因子：12.121
发表时间：2020.02.07
通过蛋白质组可稳健地揭示基于基因组和转录组分析前列腺癌疾病进展过程中的偏差
Integrative proteomics in prostate cancer uncovers robustness
against genomic and transcriptomic aberrations during disease
progression
发表期刊：Nature Communications
影响因子：12.121
发表时间：2018.03.21
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◆4D-DIA技术：4D-DIA技术 | 蛋白质组学领军科学家带您走进4D组学新时代
◆4D-DIA技术："稳中带皮"跨实验室比较展示基于DIA的质谱工作流程稳定性及潜力
◆GC/LC双平台技术：项目文章| Circulation,IF=23.054复旦大学重点实验室发表颗粒物暴露与应激激素水平试验研究
◆GC/LC双平台技术：项目文章 | 中国农科院茶叶研究所陈亮博士对白化茶和绿茶品种代谢变化的研究
◆4D-DIA蛋白组学 | 鹿明生物
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文章来源于鹿明生物