首先，百奥智汇优化了适用于单细胞转录组测序的样本冻存方法，使得这一冻存方法保存的单细胞悬液能够有效用于10x Genomics单细胞测序实验和分析。

其次，百奥智汇还验证了组织储存液处理样本的有效性，发现新鲜样本和经组织储存液保存的样本在数据质量、聚类、差异基因表达等方面无明显差异。对于绝大多数研究目的，百奥智汇使用储存液短时间保存的组织样本都能够有效用于10x Genomics单细胞测序实验和分析。

适用于单细胞转录组测序的样本冻存优化

近年来，单细胞测序技术发展迅速，应用广泛。基于微液滴的单细胞测序技术已经可以对成千上万个单细胞同时进行高通量组学鉴定。

但是，此类技术一般应用于新鲜细胞或组织样本，而很多研究的应用场景需要处理一段时间收集的样本，或者在不同的时间和地点准备的样本。传统的基因组学技术手段一般将细胞或组织冻存后送至基因组测序中心开展检测，而单细胞悬液冻存后用于单细胞转录组测序的表现尚存在争议。

为此，百奥智汇优化了适用于单细胞转录组测序的样本冻存方法，并考察了这一冻存方法保存的单细胞悬液能否用于10x Genomics单细胞测序实验和分析。

实验及分析结果显示：

数据质量基本信息

1. 冻存细胞与新鲜细胞得到的数据质量并无明显差异，对照组与冻存组细胞在检测到的细胞数、每个细胞平均检测到的基因数以及累积检测基因数等方面差异不显著。

对照组与冻存组单独聚类结果

SciBet分析细胞类型的对应关系

2. 冻存对主要的细胞类型鉴定无影响，绝大多数对照组细胞能够在冻存的细胞中被捕获到。

对照组和冻存组数据整合后的聚类结果

同一种类型细胞中基因表达在两组间的差异气泡图

每个细胞类群基因表达的相关性

细胞类群比例的相关性

3. 对照组与冻存组单细胞测序数据间并未因细胞冻存而产生批次效应，同一种细胞类型中对照组与冻存组几乎不存在差异表达基因，每种细胞类型中对照组与冻存组检出的细胞数量存在较强的相关性。

上述结果证明，百奥智汇优化的样本冻存方法能够有效用于10x Genomics单细胞测序实验和分析。

组织储存液处理样本的有效性验证

在单细胞测序实验中，如果需要在不同时间或者不同地点收集研究材料，或者不能直接进行单细胞测序研究，需要储存器官/组织样本。在储存期间，需要避免细胞坏死和凋亡，防止细胞丧失功能，以及避免免疫细胞的激活，以免下游分析产生偏差。

此前，有公司曾开发了组织储存液，为短时间保存组织提供了可能。但该组织储存液所储存的样本用于单细胞测序实验和分析的有效性尚未得到充分验证。

因此，百奥智汇考察了该组织储存液处理的组织样本能否用于10x Genomics单细胞测序实验和分析。

实验及分析结果显示：

数据质量基本信息

1.新鲜样本与组织储存液处理样本得到的数据质量无明显差异。

对照组与处理组单独聚类结果

SciBet分析细胞类型的对应关系

2. 组织储存液处理对主要的细胞类型鉴定无影响，绝大多数对照组细胞能够在组织储存液处理细胞中被捕获到。

将对照组和处理组数据整合后的聚类结果

同一种类型细胞中基因表达在两组间的差异气泡图

对照组和处理组每个细胞类群基因表达的相关性

对照组和处理组细胞类群比例的相关性

3. 组织储存液处理对特征基因表达无明显影响，同种细胞类型的全部基因的表达量在处理组与对照组间具有显著相关性，组织储存液处理后细胞中热休克蛋白（HSP）家族基因相对高表达，表明该处理导致细胞产生应激反应；每种细胞类型中对照组与组织储存液处理组检出的细胞数量存在较强的相关性。

上述结果证明，对于绝大多数研究目的，百奥智汇使用储存液短时间保存的组织样本能够有效用于10x Genomics单细胞测序实验和分析。

欲了解更多实验细节，请关注公众号后续消息，或直接与百奥智汇取得联系。