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For all possible tables (with the observed marginal counts), calculate the relevant hypergeometric probability.
Use that probability as a statistic.
P-value (for Fisher’s exact test of independence) = the sum of the probabilities for all tables having a probability equal to or smaller than that observed.
2,
阳性 阴性
非预防组 18 2
预防注射组 11 9
fisher
's Exact Test for Count Data
function
[1] 0.03095031
install.packages("ggplot2")
library(ggplot2)
dhdata <- data.frame(x=factor(c(9:20)),y=dhyper(9:20,29,11,20))dhdata$group<-factor(ifelse(dhdata$x==18,"x=18","other"))ggplot(dhdata,aes(x=x,y=y,color=group))+geom_point(size=5) +geom_segment(aes(xend=x,y=0,yend=y),size=1.5,linetype="solid")+geom_text(aes(label = round(y,3), y=y+0.01))+theme_bw(base_size = 14)
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