DNA 匹配

脱氧核糖核酸即常说的DNA，是一类带有遗传信息的生物大分子。它由4种主要的脱氧核苷酸(dAMP、dGMP、dCMT和dTMP)通过磷酸二酯键连接而成。这4种核苷酸可以分别记为：A、G、C、T。

DNA携带的遗传信息可以用形如：AGGTCGACTCCA.... 的串来表示。DNA在转录复制的过程中可能会发生随机的偏差，这才最终造就了生物的多样性。

为了简化问题，我们假设，DNA在复制的时候可能出现的偏差是（理论上，对每个碱基被复制时，都可能出现偏差）：

　　1. 漏掉某个脱氧核苷酸。例如把 AGGT 复制成为：AGT

2. 错码，例如把 AGGT 复制成了：AGCT

3. 重码，例如把 AGGT 复制成了：AAGGT

如果某DNA串a，最少要经过 n 次出错，才能变为DNA串b，则称这两个DNA串的距离为 n。

例如：AGGTCATATTCC 与 CGGTCATATTC 的距离为 2

你的任务是：编写程序，找到两个DNA串的距离。

【输入、输出格式要求】

用户先输入整数n(n<100)，表示接下来有2n行数据。

接下来输入的2n行每2行表示一组要比对的DNA。（每行数据长度<10000）

程序则输出n行，表示这n组DNA的距离。

例如：用户输入：
3
AGCTAAGGCCTT
AGCTAAGGCCT
AGCTAAGGCCTT
AGGCTAAGGCCTT
AGCTAAGGCCTT
AGCTTAAGGCTT

则程序应输出：
1
1
2

 

 1 #include<stdio.h>

 2 #include<string.h>

 3 

 4 char a[110];

 5 char b[110];

 6 int dp[110][110];

 7 

 8 int main()

 9 {

10     int i,j,t,n,m;

11     scanf("%d",&t);

12     while(t--)

13     {

14         scanf("%s%s",a,b);

15         n=strlen(a);

16         m=strlen(b);

17         memset(dp,0,sizeof(dp));

18         for(i=0;i<=n;i++)

19             dp[i][0]=i;

20         for(i=0;i<=m;i++)

21             dp[0][i]=i;

22         for(i=1;i<=n;i++)

23             for(j=1;j<=m;j++)

24             {

25                 if(a[i-1]==b[j-1]) dp[i][j]=dp[i-1][j-1];

26                 else 

27                 {

28                     dp[i][j]=dp[i-1][j]+1<dp[i][j-1]+1?dp[i-1][j]+1:dp[i][j-1]+1;

29                     dp[i][j]=dp[i][j]<dp[i-1][j-1]+1?dp[i][j]:dp[i-1][j-1]+1;

30                 }

31             }

32             printf("%d\n",dp[n][m]);

33     }

34     return 0;

35 }