基因在癌组织中表达水平的生存性分析

基因表达的生存性分析

数据格式

数据格式如下
A:样本名称;
B:基因表达水平;
C:样品类型;
D:肿瘤类型;
E:随访时间;
F:生存状态(0=生存,1=死亡)

基因在癌组织中表达水平的生存性分析_第1张图片

乳腺癌处理

  1. 高表达和低表达水平的划分:中位数方法:取表达水平的中位数。以中位数为标准划分为高表达和低表达(EXCEL中中位数函数是MEDIAN())。
  2. prism软件列标题分为survival timeHighLow
  3. 将高表达组的生存时间复制到prism的survival time中然后在把与之对应的生存状态复制到High一列。
  4. 在高表达组的survival time数据下继续添加低表达组。然后在以之对应的Low一列添加生存状态,形式如图。
    基因在癌组织中表达水平的生存性分析_第2张图片
  5. 生成生存曲线图。
  6. 调整生存曲线,设置颜色等。
    基因在癌组织中表达水平的生存性分析_第3张图片

你可能感兴趣的:(生信笔记,TCGA,基因表达,生存曲线,prism)