快速安装miniconda3并配置国内源

#软件管理器miniconda3

wget -c https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh

bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh

安装时许可协议可打yes，默认目录为~/miniconda3，默认不运行conda直接回车

conda init #c初始化conda命令
conda -V # 查看版本号 4.6.14
python --version # 2.7.16

添加生物频道，才能找到生物学软件

conda config --add channels conda-forge
conda config --add channels bioconda
conda config --add channels r
conda config --add channels biobackery

#添加清华源

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda 
conda config --set show_channel_urls yes

conda默认配置文件为 ~/.condarc ，如不存在使用 conda config --show-sources 查看配置文件位置

cat ~/.condarc

#检测命令是否可用

if test -f .bashrc ; then
source .bashrc 
fi

#不可用则修改环境变量

vim ~/.bashrc

#在最下面添加如下信息

export PATH=$PATH:/home/zlab/miniconda3/bin

#当前用户名，如zlab，这里需要替换成你的用户名
如有疑问欢迎留言，或者访问我的github仓库

https://github.com/zlabx