毒鸡蛋
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R语言---生信分析---count转换成TPM、FPKM

R语言---生信分析---count转换成TPM、FPKM

  • 背景介绍
  • 代码
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      • 1. 读取 reads count 的数据
      • 2. 下载基因长度的数据，并读取
      • 3. count 和 gene length 进行矩阵合并，便于套用公式
      • 4. 定义转换函数
      • 5. count => TPM/FPKM

背景介绍

我们进行分析的时候经常会遇到使用TPM的情况，而我们手中只有 reads count 数据时，就需要把count 的数据转换成 TPM

代码

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setwd('D:\\Desktop\\GEO分析')
# ===

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