《生物信息学》阅读笔记 （一）：生物信息学的概念及发展历史

《生物信息学》第三版 （陈铭 主编）

• 表1-1 生命科学、计算机科学及生物信息学相关大事记，可以查阅此表了解相关历史。学习一门学科一个很重要的point就是了解这门学科的历史。

生物信息学的研究领域有：

1. 分子生物学与细胞生物学
2. 生物物理学
3. 脑和神经科学
4. 医药学
5. 农林牧渔学
6. 分子和生态进化

生物信息学的主要应用：

（一）生物信息学数据库

• 数据库建设
• 数据库整合和数据挖掘

（二）序列分析

• 序列比对
• 基因序列注释

（三）其他主要应用

• 比较基因组学
• 基因和蛋白质的表达分析
• 生物芯片大规模功能表达谱的分析
• 蛋白质结构的预测
• 蛋白质与蛋白质相互作用
• 生物系统模拟
• 代谢网络建模分析

1. 预测调控网络
2. 网络普遍性分析
3. 建立模型分析

• 计算进化生物学
• 生物多样性研究
• 合成生物学

生物信息学面临的挑战：

• 生物信息学是基于分子生物学与多种学科交叉而成的新学科，现有的形势仍表现为各种学科的简单堆砌，相互之间的联系并不是特别紧密。
• 在处理大规模数据方面，没有行之有效的一般性方法，而对于大规模数据内在的生成机制也没有完全明了，这使得生物信息学的研究短期内很难有突破性的结果。
• 面临的这些挑战要得到真正的解决，不能从计算机科学得到，真正的解决方法可能还是得从生物学自身，从数学上的新思路来获得本质性的动力。
• 人类科学研究史表明，科学数据的大量积累将导致重大的科学规律的发现。
• 统计学原理表明，在一定程度上，统计结果的显著性与数据量的对数成正比。