肺实质分割python实现

肺实质分割python实现

最近在做医学图像处理项目,是一个分类任务,输入是肺部CT图像,看到好多大佬的第一步都是肺实质分割,减少噪声。经过几天的努力终于实现了,在这里做一个简单的记录。
找代码的时候发现好多都是用 Matlab 传统方法实现的,效果也很不错。但是项目是python的,只好舍弃继续找,终于在github上找到了一个大佬的开源代码:
https://github.com/JoHof/lungmask
实现时注意的一些点:输入是dcm格式的图像,输出png
分割效果如下图所示:

肺实质分割python实现_第1张图片
此时得到的mask图中的像素值为0,255
再让原图和mask点乘,点乘前记得将255的值改为1在img2[img2 > 254] = 1
此时得到的图像为:肺实质分割python实现_第2张图片
接下来就可以进行分类任务啦!!!

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