GEO数据集中有不同平台的数据该怎么处理2021-01-28

eSet <- getGEO("GSE.....", 
               destdir = '.', 
               getGPL = F)
exp <- exprs(eSet[[1]])

这样的代码是不是很熟悉？没错就是下载GEO数据集，那如果一个GEO数据集里面有2个平台或者更多呢？
开始没想明白，其实很简单啊，eSet 里面包含的是列表啊，通常只有一个数据集，所以代码就是exprs(eSet[[1]])，如果有2个或者多个的话，length（eSet）就知道有多少个数据集，想取那个就选对应的数据编号（1,2,3.。。）就好了