VEP

数据库下载链接:
ftp://ftp.ensembl.org/pub/release-98/variation/vep

运行命令行:
vep -i examples/homo_sapiens_GRCh37.vcf
--format vcf -o test.out
--cache --offline --hgvs
--fasta /database/hg19/ucsc.hg19.fasta --force_overwrite
--cache_version 92 --symbol --numbers --domains --protein \

option:
--sift b, --polyphen b, --ccds, --uniprot, --hgvs, --symbol, --numbers,
--domains, --regulatory, --canonical, --protein, --biotype, --uniprot, --tsl,
--appris, --gene_phenotype --af, --af_1kg, --af_esp, --af_gnomad, --max_af, --pubmed, --variant_class, --mane

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