2021-09-13 从转录到翻译要多久？——nRibo-seq

  一直以为蛋白编码基因被转录加工成熟后会很快（感觉应该是以秒计）进行翻译，但实际上并不是。今天分享的这项研究，则是通过开发nRibo-seq（Nascent Ribo-Seq），解析RNA从转录到翻译的时间——滞后时间。针对小鼠巨噬细胞的分析表明，其滞后时间约20-22min；而小鼠胚胎干细胞的滞后时间则达到了35-38min，不同细胞中，滞后时间存在差异。

nRibo-seq

nRibo-seq原理：常规的Ribo-seq主要用于分析mRNA的翻译效率，而nRibo-seq则借助转录过程中参入的核苷酸类似物（例如4SU）追踪RNA从转录到翻译的过程。通过对不同时间点的细胞样本进行nRibo-seq分析，可以计算RNA从转录到翻译的滞后时间。

Reference
Schott, J. et al. Nascent Ribo-Seq measures ribosomal loading time and reveals kinetic impact on ribosome density. Nat Methods (2021).