生信星球学习小组Day4笔记-柠萌

Day4-R语言基础

思维导图如下:

R语言基础.png

1.下载R和Rstudio

用搜狗微信搜索：“果子学生信 给自己一个全新的R语言环境”

2.认识R和Rstudio

R：是一种编程语言，也是统计计算和绘图的环境，它汇集了许多函数，能够提供强大的功能。
R语言软件: 界面简陋，通常不直接使用，而是用图形界面的Rstudio。
RStudio软件： 是免费提供的开源集成开发环境（IDE）。RStudio提供了一个具有很多功能的环境，使R更容易使用，是在终端中使用R的绝佳选择。R语言的使用通常在该软件中实现。

Rstudio软件界面如图：

Rstudio界面.png

• 嘿嘿，特意设置的黑色背景
• 以上四个方块的功能如下表格

脚本编辑器	对象变量列表、历史命令
控制台（脚本运行和结果显示）	文本、图片、包、帮助

3.R语言基本操作

3.1 用Rproject管理工作目录

• 详细推文见https://mp.weixin.qq.com/s/G-LXN9P2HVLv9v0cvyFJMA
• 主要为了解决并行多个项目，也就是多个工作目录。

• 新建project

• 界面上数第二行的图标，左数第二个绿色小加号，点击新建→New directory→New project→填写新文件夹名和路径→点击create project(新建了wmh0708命名的project)

• 打开Rproject

• 在文件夹中找到这个R project，双击打开即可，管理多个项目不成问题

设置工作目录：setwd()
查看工作目录：getwd()

3.2 显示文件列表

• 显示默认路径，即工作目录
  dir()
  页面如下图所示：
  显示文件列表.png

3.3 加减乘除

• 1+2 回车，以此类推，界面如图：
  加减乘除.png

3.4 赋值

赋值符号用<-,例如
x<- 1+2
输入x回车，便可显示x数值，同时x会显示在Environment里的Value列表里

• 界面如图所示
  赋值.png

3.5 删除变量

所有的变量可以通过使用rm()和 ls()函数来一起删除。
清除单个变量：使用 rm(object) 函数
清除内存中所有的变量：rm(list = ls())

• 举例界面如下
  删除变量.png

3.6 列出历史命令

history()

• 界面如图，显示在右上角的history，
  列出历史命令.png

3.7 清空控制台

快捷键ctrl+l，即可清空控制台，或者使用控制台右上角的小扫帚

4.R语言作图实战

4.1 作图初体验

runif()函数用于生成从0到1区间范围内的服从正态分布的随机数
plot()函数是R中基本的画x-y两个变量的函数

plot(rnorm(50))界面显示如下：

plot函数.png

iris是一个R语言自带的数据框，通常用作示例。iris$Sepal.Length表示iris数据框的Sepal.Length这一列数据。以此类推。

boxplot(iris$Sepal.Length~iris$Species,col=c("lightblue","lightyellow","lightpink"))演示界面如图：

boxplot图.png

4.2 ggplot2包作图

详细教程https://mp.weixin.qq.com/s/jOIJLpCN4qTznPH0b-qJdw

• 安装ggplot2包，并加载包

install.packages("ggplot2")
library(ggplot2)

4.2.1 mpg数据框

数据框是变量（列）和观测（行）的矩形集合。mpg是ggplot2的内置数据框。数据框是作图的数据。

4.2.2 入门级绘图模板

4.2.3 图形映射属性

4.2.4 分面

4.2.5 几何对象

4.2.6 统计变换

4.2.7 位置调整-position

4.2.8 坐标系

4.2.9 完整的绘图模板

额，内容挺多，改天再深入钻研，今天先学到这里吧~