学习小组Day7笔记--大羽

一、教程思维导图

生信星球公众号教程

二、知识点

1.三种测序方法的区别及特点

对比

根据优缺点联想各种测序的应用。

2.三种测序方法的过程和原理
根据原理的方法名，记忆三种测序方法的过程，记忆原理。
文字版的原理,总结的比较全
图片版原理
视频版原理 密码：bxsry4

3.测序类型（根据组学分类）
信息流各个阶段：总结-来自生信星球公众号
基因组→转录组→蛋白组→代谢组

4.测序相关的概念
高通量测序、
基因组测序（无参重头测序，有参重测序）、
测序中间产物（read、Contig、scafford）

5.常用数据格式
1️⃣Fastq & Fasta

Fastq

Fasta

转换

FASTX-Toolkit
•一款用于处理Short-Reads FASTA/FASTQ文件的程序，里面包含了丰富的Fasta/Fastq文件格式转换、统计等命令。
http://hannonlab.cshl.edu/fastx_toolkit/

2️⃣GenBank & EMBL

GenBank

EMBL

转换
EMBL → Fasta格式转换（在线工具）：
http://www.geneinfinity.org/sms/sms_embltofasta.html

3️⃣常见测序文件格式解析网站
网站包含了各种各样的测序文件格式说明，可以了解文件格式各行各列的含义。