《学习小组Day2笔记--大大不留跟》

1.关于linux及服务器

linux是一种独立于Windows和macOS的操作系统，具有开源、免费以及安全稳定等优点。目前个人用户较少，主要应用领域在服务器上。

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2.为什么生信要用linux

生物软件基于linux，系统开源、免费，不需要图形界面，有效节约资源。可以批量高效的处理文件以满足数据分析的需求。

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3.怎么召唤linux

mac端无需安装软件，使用原生terminal即可；服务器可以选择本地服务器或云服务器。

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4.使用terminal登陆服务器

mac系统可以使用terminal来登陆服务器。打开Mac terminal,输入ssh [email protected]回车后弹出是否确定继续链接，type yes。

成功登陆ubuntu

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5.linux基本操作练习

• pwd: print working directory (显示当前路径)
  
  显示当前路径
• mkdir : make directory (创建自己的目录)

#生信软件 mkdir biosoftware
#数据 mkdir data
#临时文件 mkdir tmp
#源代码 mkdir src

• ls: 显示列表，将文件和目录一一显示
  
  ls显示列表
• rm 、rmdir、rm -r
  1.rm+文件名 对应删除文件
  2.rmdir+文件名 对应删除空目录
  3.rm -r+文件名 对应删除非空目录
  4.rm -rf 樯橹灰飞烟灭（慎用，会删除服务器上个人的全部文件）
  
  练习删除命令
• cd ：cd+文件名进入目录
  cd -: 返回上一次操作目录
  cd : 主目录
  
  练习
• vi : 新建脚本或文本文档（vi为linux系统下的文本编辑器）

cd tmp
vi hello_linux.txt
# type " i "  to edit 进入编辑模式
Esc #退出编辑模式
:x #保存并退出文本编辑器

• cat : 查看编辑内容并输出
  head : 输出前10行
  tail : 输出后10行
  -n : 自定义输出的行数 （head -n 5 hello_linux.txt）(可以利用tab键快捷键入，类似R)
  
  查看文本命令
• cp : 复制文件
  cp 文件1 文件2 (文件2为文件1的copy,可以直接用新的名字)
  
  复制并重命名copy文件
• mv : 将文件移动入文件夹或者重命名
  mv file directory
  
  移动文件
• ls -al : 以长列表形式显示所有目录及文件详细信息
  （1）第一列drwxr-xr-x 代表文件的类型及权限。d开头表示为文件夹；-开头表示文件；l开头为连接文件
  （2）第二列为文件的链接数
  （3）第三、四列为拥有文件的用户及组
  （4）第五列为文件的大小
  （5）第六列为文件最后修改时间
  （6）第七列为文件名
  
  ls -al
• ls -s : 可以在每个文件名后输出该文件的大小
• mkdir -p : 可以创建多级目录
  mkdir -p tmp/tmp1/tmp1.1
  ls -R 使用这个命令来查看目录的层级关系
  
  ls -R命令
• rm -r : 连同root目录下全部删除
  
  image.png
• cat /proc/cpuinfo | grep 'model name' |uniq : 查看CPU型号
  cat /proc/meminfo | grep MemTotal : 查看内存
  fdisk -l | grep Disk : 查看硬盘大小（在此服务器下，查询失败）
  cat /proc/cpuinfo | grep "cpu cores" | uniq : 查看CPU核数
  cat /proc/cpuinfo | grep "physical id" | uniq | wc -l ：查看CPU个数 faith默默

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内容来源--微信公众号生信星球