##规划##

1, Linux进阶

2,高于入门级的统计学知识,以及一门统计语言,比如 R

3,Python,进阶使用C语言。

4,生物学知识,也需要知道目前人们在这个领域里都用什么其他软件。

5, 数据可视化

6,数据库构建——————mysql

a) 生信基础软件(blast++套件,fastqc,flash,blast,solexaQA,NGS-QC-toolkit,SRA-toolkit,fastx-toolkit)b) snp-calling相关软件(bwa,bowtie,samtools,GATK,VarScan.jar,annovar)c) 基因组相关软件(velvet,SOAPdenovo2,repeatmasker,repeatscount,piler,orthMCL,inparanoid,clustw,muscle,MAFFT,quickparanoid,blast2go,RAxML,phyML)d) 转录组相关软件(trinity,tophat,cufflinks,RseQC,RNAseq,GOseq,MISO,RSEM,khmer,screed,trimmomatic,transDecoder,vast-tools,picard-tools,htseq,cuffdiff,edgeR,DEseq,funnet,davidgo,wego,kobas,KEGG,Amigo,go)

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