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宏基因组做在线组间差异Anosim分析与结果解读

写在前面

需求是返回的结果每组样本数量比较多，但组间差异不明显，挑出来重分析。详情请参考 [组间差异分析：Anosim]([组间差异分析：Anosim - 知乎 (zhihu.com))， 当然亲测更简便的方法可以借助云平台工具：

步骤

表格准备

  • 不同样本属水平的丰度表

宏基因组做在线组间差异Anosim分析与结果解读_第1张图片

  • 分组信息表

宏基因组做在线组间差异Anosim分析与结果解读_第2张图片

云平台分析

  • 上传云平台
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  • 结果分析与下载，这个很快

宏基因组做在线组间差异Anosim分析与结果解读_第4张图片

  • 调整：pdf格式拖进AI里改色

宏基因组做在线组间差异Anosim分析与结果解读_第5张图片

结果解读

宏基因组做在线组间差异Anosim分析与结果解读_第6张图片

**图形解读：**盒型图纵轴表示距离排名，横轴between表示组间距离，其他表示对应分组组内距离。R值表示组间与组内的差异程度。R的范围为[-1,1]。R<0组间差异小于组内差异；R>0组间差异大于组内差异；R=0组间差异等于组内差异。

盒型图参数解释：

N：样本数；

Median：中位数

Q3：上四分位数

Q1：下四分位数

IOR：四分位距，interquartile range，即Q3-Q1

max：Q3+1.5IQR范围内的最大值

min：Q1-1.5IOR范围内的最小值

outlier：异常值/离群值，即小于Q1-1.5IOR或Q3+1.5IQR的值

notch：中位数95%置信区间（confidence intervals）的范围

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