ggplot做对角线火山图---与单细胞差异基因可视化更配哦

火山图又双叒叕来了,之前做的火山图已经很精美了。

1、绝美!差异基因火山图大全!

2、让火山图躺下来:倾斜45°的火山图

3、跟着Cell学单细胞转录组分析(八):单细胞转录组差异基因分析及多组结果可视化

4、ggplot做火山图---添加任意基因标签|||突出显示标记基因

但是最近在做单细胞差异基因可视化火山图的时候,发现了一个问题,有些基因显著性也就是P值超级低,那么LOG之后数值甚至达到500以上,但是这毕竟是少数,大多数基因还是正常范围,作图的时候就会出现点溢出的情况,如果更改坐标轴范围,图很难看,上边顶天了,下面堆成一堆。

所以,这时候最好的呈现方式就是采用倾斜火山图,这样就不会出现上述问题。之前的文章讲过的倾斜45°火山图可以制作,但是最近感觉不太完美。

故而,在此推出ggplot做的对角线火山图,也是可以标签任意想要展示的基因,上下调基因。效果如下图:

image.png

我们此处以单细胞数据为例,转录组或者其他数据作图也是适用的。

详细内容请至我的公众号《KS科研分享与服务》,谢谢。

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