R语言安装包下载相关问题

1.设置CRAN镜像

options("repos"="https://mirrors.ustc.edu.cn/CRAN/")

2.安装BiocManager

if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
  install.packages("")
BiocManager::install(version = "3.12")

注意:BiocManager与Rstudio版本的对应关系,version = "3.12"适用于Rstudio4.0以上的版本
2.1 BiocManager安装R包

BiocManager::install("GEOquery")

2.2联网问题

## 打不开的  options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/")
连接打不开,所以直接用默认的会比较好

3 无法联网,配置网络

options(download.file.method = 'libcurl')#第一种

options(download.file.method = 'libcurl')#第二种
options(url.method='libcurl')

4 批量安装R包,由于依赖包的关系,出现错误。
实在安装不上的就手动安装啦


搜索R包名称,推荐使用bing搜索

选择相应的版本进行下载,推荐Motrix或迅雷下载

点击Rstudio的install

选择完成后点击install,等待安装即可

我的问题是下载R包显示无法联网,试了很多方法,换了多个镜像也不可以,最后直接重装Rstudio按照上述的版本就可以了。不过下载速度还是有些慢,还有部分无法安装的就直接手动安装了。

还有就是由多个依赖包的时候,根据提示就缺啥补啥啦。

弄了好久,有点心塞,允悲。

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