【农业生产系统模型】基于R语言APSIM模型进阶应用与参数优化、批量模拟实践技术

    随着数字农业和智慧农业的发展,基于过程的农业生产系统模型在模拟作物对气候变化的响应与适应、农田管理优化、作物品种和株型筛选、农田固碳和温室气体排放等领域扮演着越来越重要的作用。APSIM (Agricultural Production Systems sIMulator)模型是世界知名的作物生长模拟模型之一。APSIM模型有Classic和Next Generation两个系列模型,能模拟几十种农作物、牧草和树木的土壤-植物-大气过程,被广泛应用于精细农业、水肥管理、气候变化、粮食安全、土壤碳周转、环境影响、农业可持续性、农业生态等诸多与农业生产和科研有关的领域。APSIM模型内核算法是基于Fortran语言开发的,软件界面是基于C#进行开发,组件式驱动,各个模块可以自由组合。了解和熟悉APSIM模型的关键算法和软件的操作是学习APSIM模型的基础。此外,想要成为一名优秀的作物模型使用者与科研团队不可或缺的人才,除了掌握对作物模型相关知识之外,还要掌握模型的快速模拟和高效数据分析能力。R语言是一门应用场景广泛、简单易学的程序语言,APSIM模型开发了许多R语言辅助包,在APSIM模型的气候、土壤、管理措施等数据准备,自动化模拟,参数优化和结果分析上都发挥着重要的作用。

因此,为辅助提高作物模型工作者的APSIM模型使用技术,系统学习如何利用R语言来快速使用APSIM模型。本次我们精选大量作物模型应用案例,全程干货,全面熟悉APSIM这一综合型农业生态系统模型,提高模型应用能力、数据分析和图表制作技能。

【内容简介】:

专题一APSIM模型应用与R语言数据清洗

  1. 作物生长模型的概念
  2. 作物生长模型的发展现状
  3. APSIM模型的开发历程
  4. APSIM模型的模块及模拟流程
  5. APSIM模型操作

APSIM的安装

APSIM模型操作界面讲解

R语言编程与数据清洗(数据筛选、合并、切片、重复值、缺失值处理)

专题二、APSIM气象文件准备与R语言融合应用

APSIM自带的气象数据的准备

  1. APSIM气象文件.met的介绍
  2. 日照转辐射算法
  3. APSIM气象文件转化
  4. APSIM模型陆气交换和能量平衡过程
  5. 案例一:使用R语言进行气象文件的生成
  6. 案例二:使用R语言将气象共享网数据/NC等数据批量生产APSIM气象文件
  7. 案例三:使用R语言批量修改气象文件及调用APSIM文件

专题三、APSIM模型的物候发育和光合生产模块

APSIM物候发育和光合生产

  1. APSIM模型的生育期尺度
  2. APSIM模型的积温计算
  3. APSIM模型的生育期算法
  4. APSIM模型的生育期影响因子及算法
  5. APSIM模型光合生产算法
  6. 案例一:使用APSIM classic 和NG版本模拟生育期和生物量

专题四、APSIM物质分配与产量模拟

APSIM模型的物质分配算法

APSIM模型产量模拟模块 

  1. APSIM模型的穗粒数模拟
  2. APSIM模型的产量模拟
  3. APSIM模型的产量相关参数
  4. 案例一:作物潜在生物量和潜在产量的模拟

  5. 案例二:不同品种参数下作物产量的模拟

专题五APSIM土壤水平衡模块

APSIM模型的土壤水分平衡算法

  1. 土壤水蒸散和植物蒸腾算法
  2. 土壤水径流和排水算法
  3. 土壤水力参数的测试
  4. 案例一:APSIM模型输入参数和土壤文件的制备
  5. 案例二:APSIM模型土壤参数在数据缺失情况下的近似估算
  6. 案例三:使用R语言批量修改APSIM模型土壤参数

 专题六、APSIM土壤碳、氮平衡模块

APSIM模型土壤养分动态过程模拟及温室气体排放的模拟

  1. 氮素的矿化和固定过程
  2. 氮素的硝化作用与反硝化作用
  3. 土壤N2O的模拟
  4. 案例一:APSIM模型N2O排放模拟

  5. 案例二:APSIM模型模拟土壤No3和NH4的动态变化

专题七、APSIM土壤碳、氮平衡模块、

APSIM模型土壤碳库模型及土壤有机碳SOC的模拟

  1. 土壤碳库模型的发展历程
  2. 土壤碳的周转模型
  3. 土壤有机碳的模拟
  4. 案例一:APSIM模型土壤碳库模型参数率定 

  5. 案例二:APSIM模型模拟秸秆还田对土壤碳库变化的影响

专题八APSIM农田管理模块与情景模拟 

APSIM模型的农田管理措施的准备

  1. APSIM模型播期和播种密度设置
  2. APSIM模型施肥设置(化肥+有机肥)
  3. APSIM模型的灌溉设置
  4. APSIM模型秸秆还田设置
  5. APSIM模型多年模拟和轮作模拟
  6. 案例一:APSIM模型模拟气候变化对作物生长的影响

  7. 案例二:APSIM模型模拟多年轮作下土壤有机碳和温室气体排放的影响

  8. 案例三:APSIM模型模拟作物单做、连作和轮作

  9. 案例四:APSIM模型模拟玉米大豆复合种植(间作)

  10. 案例五:使用R语言对APSIM管理文件进行批量修改及批量运行

 

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