分子对接软件（薛定谔Schrodinger) 使用

文章来源：公众号“科研讨论圈”

1.蛋白-配体相互作用

2.柔性对接及基于结构的虚拟筛选

3.基于药效团虚拟筛选

4.构效关系模型预测分子活性

Schrodinger是药物发现的完整软件包，包括：基于受体和配体结构的诱导契合和柔性对接模式；基于受体结构及配体极性的对接模式；基于受体结构及溶液环境性质的对接模式；组合化学库设计及基于组合库的对接模式；基于配体结构的药物设计，药效团和3D-QSAR；生物分子结构模拟，蛋白、糖、核酸、小肽等；基于靶点的药物设计；ADME性质预测

在进行分子对接之前，如果需对接的小分子为1D或2D结构，我们首先要将小分子转换为三维结构并进行加氢、加电荷、生成分子构象等标准化处理。这里我们