清空不同Resolution分群走向的历史信息

单细胞系列教程目录索引,持续更新...

---

在对大类注释好的数据集进行亚群提取后，往往需要重新对子集进行聚类分群，但在使用下述代码对新子集进行不同粒度分群走向时绘图会混入meta.data中原始大类数据集的粒度分群走向信息。

sce <- FindClusters(
  object = sce,
  resolution = c(seq(.2,1,.2)) #起始粒度，结束粒度，间隔
)
clustree([email protected], prefix = "SCT_snn_res.")

因此在运行前，需清除不同Resolution分群走向的历史信息，并重新运行上述代码。

以下为清除历史信息代码：

[email protected][email protected][,!(grepl("^SCT_snn_res.",colnames([email protected])))]

注意：这里我是用的SCT标准化，如果为传统方法标准化需更改SCT_snn_res.为RNA_snn_res.

---

问题交流：
Email: [email protected]