rdkit&python | 基于类药性规则对分子进行筛选

类药性

类药性指化合物与已知药物的相似性。具有类药性的化合物并不是药物,但是具有成为药物的可能,这一类化合物称为类药性分子或药物类似物分子。类药性是一个模糊的概念,在药物研发中,类药性研究基于先导化合物之上,可以说类药性分子是高质量的先导化合物。

Lipinski五规则

类药五原则,是辉瑞公司资深药物化学家Christopher A. Lipinski在1997年提出的筛选类药分子的基本法则,符合Lipinski规则的化合物会有更好的药代动力学性质,在生物体内代谢过程中会有更高的生物利用度,因而也更有可能成为口服药物。

类药五原则(rule of five)也称为Lipinski规则,一个小分子药物中要具备以下性质:
1.分子量小于500;
2.氢键给体数目小于5;
3.氢键受体数目小于10;
4.脂水分配系数小于5;
5.可旋转键的数量不超过10个。

定量评估类药性

QED代表药物相似性的定量估计,测量的经验原理反映了分子性质的潜在分布,包括分子量、logP、拓扑极性表面积、氢键供体和受体的数量、芳香环和可旋转键的数量以及不需要的化学功能的存在。药物相似性量化为介于0和1之间,越靠近1类药性越高。

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