3DSlicer相关介绍

官网：https://www.slicer.org/
什么是3DSlicer？
一个开源医学影像分析和可视化平台。

3D切片机是一款免费的开源软件，用于医学、生物医学和其他3D图像和网格的可视化、处理、分割、配准和分析;以及规划和导航图像引导的程序。

桌面软件，用于解决高级图像计算挑战，专注于临床和生物医学应用。
开发平台，使用免费的开源软件快速构建和部署用于研究和商业产品的自定义解决方案。
知识渊博的用户和开发人员社区共同努力改进医疗计算。（摘自官网）

3DSlicer可以做什么？
图像分割、手术导航、针对新冠肺炎的肺部 CT 分析、实时3D超声重建、手术导航等等。

应用领域：
Image segmentation 图像分割
Lung CT analysis for COVID-19 新冠肺部CT
Surgical navigation 手术导航
AI-assisted segmentation using NVidia Clara 人工智能辅助分割
Robot-assisted interventions 机器人的三维模型，解剖结构和可视化
Tractography 示踪成像
Tracked ultrasound for needle guidance 跟踪超声引导针头
Adaptive radiation therapy 自适应放射性治疗
Real-time 3D ultrasound reconstruction 实时三维超声重建
Virtual reality 虚拟现实
FreeSurfer support FreeSurfer支持

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Freesurfer是用于MRI图像处理和分析的一款开源软件，可以进行多种模态数据的预处理、皮层重建、volume与surface的互相 之间的配准等。

Freesurfer许多功能都可以利用软件包中集成好的pipeline来实现，可以参考官网进行了解，也可以调用一些单独的命令来实现自己的需求，比如查看.mgz/.nii.gz等格式文件的信息时用到的mri_info等。

具体介绍可以参考官网：[http://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/](http://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/)，或者豆瓣上一个科技科普类的专栏（中文）：FreeSurfer使用手册

3DSlicer中自带了Python交互器可以方便研发人员进行简单的测试，但不推荐使用此交互器做插件开发，因为测试者一旦关闭slicer，下面的脚本代码就会自动清空，您所生成的控件也将不复存在。