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11的雾
3.genCov画每个突变位点附件的coverage,跟igv有点相似。这个操作起来很复杂,但是图还是挺有用的。可以考虑。由于我的referencegenomebuild是hg38BiocManager::install(c("TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene","BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38"))library(TxDb.Hsapien
- Linux dmesg命令:显示开机信息
fafadsj666
linux数据库数据挖掘机器学习大数据
通过学习《Linux启动管理》一章可以知道,在系统启动过程中,内核还会进行一次系统检测(第一次是BIOS进行加测),但是检测的过程不是没有显示在屏幕上,就是会快速的在屏幕上一闪而过那么,如果开机时来不及查看相关信息,我们是否可以在开机后查看呢?答案是肯定的,使用dmesg命令就可以。无论是系统启动过程中,还是系统运行过程中,只要是内核产生的信息,都会被存储在系统缓冲区中,已经为大家精心准备了大数据
- 佳音之日更葡萄酒I Day20 特别篇 - 天堂园 Il Paradiso di Manfredi
葡萄酒一杯靈
#佳音OneDayWine#IlParadisodiManfredi#BrunellodiMontalcino#Biodynamie#意大利#每日一酒曾任经典奇昂蒂葡萄酒协会(ConsorziodelVinoChiantiClassico)的主席,意大利CastelloDiAma”阿玛堡”庄主MarcoPallanti说过一句话﹕“Today,allwineisgood;thedifference
- Biopython提取和分离复合体PDB文件中所有链的结构信息
qq_27390023
生物信息学python
从蛋白质复合体的PDB文件中提取每个链的结构信息,并保存成单独的pdb文件。示例代码fromBioimportPDBdefextract_chain_sequences(pdb_file,output_dir):"""从PDB文件中提取所有链的序列,并保存为独立的PDB文件。:parampdb_file:蛋白质复合体PDB文件路径:paramoutput_dir:输出目录,用于保存各链的PDB文件
- Netty权威指南:Netty总结-高性能与可靠性
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第二十二章高性能之道22.1RPC调用性能模型分析22.1.1传统RPC调用性能差三宗罪:网络传输采用同步阻塞I/O导致经常性阻塞序列化性能差线程模型问题22.1.2I/O通信性能三要素传输:BIO、NIO或者AIO协议:HTTP公有协议,内部私有协议线程:数据报如何读取,Reactor线程模型22.2Netty高性能之道22.2.1异步非阻塞通信I/O多路复用技术22.2.2高效的Reactor
- iOS GCD底层分析(2)--同步异步函数、死锁、GCD单例
冼同学
前言上一篇文章iOSGCD底层分析(1)留下了四个问题,分别是:死锁底层是怎么样子产生的?如果是异步函数,线程是怎样子创建的?底层通过_dispatch_worker_thread2方法完成任务的回调执行,那么触发调用的位置在哪?单例的底层原理是什么?准备工作libdispatch.dylibiOSGCD底层分析(1)1.同步函数上一篇文章中分系同步函数时进入了_dispatch_sync_f_i
- SeuratObject转h5ad格式
星星醉了
笔记
Python的MetaCells版本输入貌似一定要h5ad格式,所以就探索了一下~这个是最方便的:SeuratDisk#安装这个包,试了直接installl和biomanager都不行,只能githubremotes::install_github("mojaveazure/seurat-disk")#载入library(SeuratDisk)library(Seurat)#一个叫seurat.h
- VMware Fusion 13.6 OEM BIOS 2.7 - 在 macOS 中运行 Windows 虚拟机的最佳方式
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VMwareFusion13.6OEMBIOS2.7-在macOS中运行Windows虚拟机的最佳方式VMwareFusion13原版App中集成OEMBIOS请访问原文链接:https://sysin.cn/blog/vmware-fusion-13-oem/,查看最新版。原创作品,转载请保留出处。作者主页:sysin.org2024-09-03,版本13.6更新,支持macOSSequoia作
- HP电脑如何启动硬件检测
哲伦贼稳妥
电脑硬件电脑经验分享windows其他
许多人都在使用HP电脑,但是当出现问题时候,不知道该如何测试,本文来分享一下,如何在电脑能开机但是有问题时进行检测。使用F2键进行组件测试步骤:开机后不停敲击键盘上【F2】的按键,进入BIOS设置界面,点击【组件测试】,然后选择想要检测的硬件组件(如鼠标/触摸板、键盘、网络、风扇等)。注意事项:不同型号的HP电脑进入BIOS的按键可能不同,通常为F2、F10、F12或Delete键。使用UEFI诊
- 常用时间命令和同步时间服务
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1.时间命令在Linux系统中,有很多与时间相关的命令,这些命令可以帮助用户查看系统时间、设置系统时间、计划任务等。命令功能说明date显示或设置系统日期和时间hwclock显示或设置硬件时钟(BIOS时间)ntpdate同步本地系统时间与远程NTP服务器上的时间timedatectl查询或修改系统时钟和时区设置1.1date命令【功能说明】date命令用于显示当前的系统时间或设置系统时间。【语法
- 2022-04-17
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NatBiotech|组织中单细胞转录组的空间图谱原创图灵基因图灵基因2022-04-1707:03收录于话题#前沿生物大数据分析单细胞RNA测序(scRNA-seq)已经彻底改变了单细胞水平上的基因表达研究。最近,空间技术通过添加空间信息将转录组学提升到了一个新的水平。但是,它缺乏单细胞分辨率。现在,来自德克萨斯大学MD安德森癌症中心的一个小组开发了一种名为CellTrek的计算方法,将这两个数
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背景:某目录下一堆py文件和相应的资源文件(文件夹),app.py是入口(启动)文件,资源文件通过相对路径调用。Windows10,2022.7.161、通过conda命令进入虚拟环境(命令提示符界面)2、cd/d将操作路径切换到py文件所在位置,即前文所说“某目录”(命令提示符界面)3、pyi-makespec-capp.py建立spec文件(命令提示符界面)!这里我的pywebio采用pywe
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1.JAVA中的IOIO是Input/Output的简称,经常写作I/O即输入/输出。通常指数据在内存和硬盘之间的输入和输出。输入/输出是信息处理系统与外部世界之间的通信,比如计算机和人类之间。输入是系统接收的信号或数据,输出则是从其发送的信号或数据。JAVA中提供了一些API,可以提供开给发者来读写外部数据或文件,通常称这些API为JavaIO。随着JAVA的不断发展,目前有三种IO,分别是BI
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- Biotin-PEG12-NHS ester,NHS-PEO12-Biotin,365441-71-0,生物素-PEG12-活性酯
陕西新研博美
365441-71-0
英文名称:Biotin-PEG12-NHSesterNHS-PEO12-BiotinNHS-dPEG12-Biotin中文名称:生物素-PEG12-活性酯分子式:C41H72N4O18S分子量:941.1CAS:365441-71-0纯度:≥95%结构式:用途:仅供科研实验使用,不用于诊治外观:粘稠液体或者固体粉末,取决于分子量注意事项:取用一定要干燥,避免频繁的溶解和冻干溶解性:溶于大部分有机溶
- Biotin-PEG5-Thalidomide|生物素-五聚乙二醇-沙利度胺
星贝爱科
生物素-五聚乙二醇-沙利度胺
生物素-五聚乙二醇-沙利度胺(Biotin-PEG5-Thalidomide)是一种化合物,它由生物素、五个乙二醇单元(PEG5)以及沙利度胺三部分组成。以下是对该化合物的详细解析:一、基本信息中文名:生物素-五聚乙二醇-沙利度胺英文名:Biotin-PEG5-Thalidomide分子式:C35H49N5O11S分子量:747.86结构式:二、组成成分及特性生物素(Biotin):一种水溶性B族
- 875770-34-6|Biotin-PEG3-azide|生物素-三聚乙二醇-叠氮
星贝爱科
875770-34-6
描述Biotin-PEG3-azide是一种基于PEG结构的PROTAClinker,可用于PROTAC的合成。它含有Azide基团,可以和含有Alkyne基团的分子发生铜催化的叠氮-炔环加成反应(CuAAc)。还可以和含有DBCO或BCN基团的分子发生菌株促进的炔-叠氮环加成反应(SPAAC)。基本信息中文名称:生物素-三聚乙二醇-叠氮英文名称:Biotin-PEG3-Azide分子式:C18H
- Biotin-PEG2-SH,生物素-二聚乙二醇-巯基,Thiol-PEG2-Biotin 的应用分享
kaixinsw123456
其他
英文名称:Biotin-PEG2-SH,Biotin-PEG2-Thiol中文名:生物素-二聚乙二醇-巯基分子式:C16H29N3O4S2分子量:391.55纯度:≥95存储条件:-20°C,避光,避湿结构式:Biotin-PEG2-SH是一种PROTAClinker,属于PEG类。可用于合成PROTAC分子。应用:应用于医学研究、药物释放、纳米技术和新材料研究、细胞培养。在研究配体、多肽合成载体
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一、产品简介:BIOG游离DNA富集提取试剂盒是常州百代生物科技股份有限公司研制的专门用于提取较大量液体样本中低浓度DNA的富集提取试剂盒。血清、血浆等液体样本中游离DNA的高效提取一直是个难题,由于提取原理上的缺陷,磁珠法的提取富集度和灵敏度远不如离心柱法,而即使是离心柱法,目前也存在富集倍数偏低的问题。使用较小的样本量,如目前常用的0.2-0.3ml,则提取的DNA量少,洗脱液DNA浓度较低,
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使用Biopython的PDB模块可以方便地解析PDB文件并提取你需要的信息。下面是一个示例代码,用于提取PDB文件中的链名称、序列和长度:示例代码fromBioimportPDB#读取PDB文件pdb_file="/Users/zhengxueming/Downloads/1a0h.pdb"parser=PDB.PDBParser(QUIET=True)structure=parser.get_
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http://refgenie.databio.org/HereweprovideawebinterfaceandaRESTfulAPItoaccessgenomeassetsforpopularreferencegenomeassemblies.refgenie提供了人、鼠等常见物种的参考基因组以及注释文件等信息(fasta、gtf...)以及常用fastq比对工具的(star、hisat2..
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GitHub项目推荐开源
谷歌开源!AI4S平台:生物医学平台源代码bigscience-workshop/biomedical:Toolsforcuratingbiomedicaltrainingdataforlarge-scalelanguagemodeling(github.com)谷歌在人工智能和生物医学领域的贡献确实显著,而AI4S(AIforScience)平台作为生物医学平台,通过人工智能技术的应用,能够为生
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链接是https://bioinformatics.uconn.edu/resources-and-events/tutorials-2/这个是康涅狄格大学(UniversityofConnecticut)提供的一份教程,主要的内容包括1、生物信息学中经常用到的文件格式image.png2、linux操作系统和R语言的基础知识image.png3、转录组数据的处理流程image.png这里包括有参
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BIOS(BasicInput/OutputSystem,基本输入输出系统)是电脑的基础固件,它控制着电脑的启动过程并提供了一些低级别的硬件配置选项。通常在电脑启动时,你可以通过按特定的键(如`DEL`、`F2`、`ESC`、`F10`等)进入BIOS设置界面。以下是BIOS设置的一些常见选项及其详细解释:###1.**Boot(启动)选项**BIOS的`Boot`选项允许你设置启动顺序和设备的优
- BIOS开发之路(三)——UEFI的概念及启动阶段
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一、UEFI概述1、UEFI的全称是UnifiedExtensibleFirmwareInterface,统一可扩展固件接口,定义了操作系统和平台固件之间的接口,可以让PC从预启动的操作环境,加载到操作系统上,是BIOS的替代者。UEFI提供给操作系统的接口包括启动时服务和运行时服务。2、UEFI相对于BIOS的改进:(1)UEFI对硬件的支持超过BIOS。UEFI可以使用2.2TB以上的硬盘作为
- esp32通过NBIoT模块连入MQTT服务器
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- Psychology 心理学
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- Linux内核0.11学习
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Linux内核0.11学习文章目录Linux内核0.11学习一、计算机开机的过程1、启动BIOS2、BIOS在内存中加载中断向量表和中断服务程序Linux内核最新已经版本已经到5.18了,代码量千万行的级别,一天看五百行也要看两万天,然而很多程序员能不能活到两万天都是个大问题,所以不可能看得完。Linux0.11内核虽然是三十多年前的产物,就像孙子兵法、黄帝内经等古书一样,不代表它们没有学习的价值
- Java常用排序算法/程序员必须掌握的8大排序算法
cugfy
java
分类:
1)插入排序(直接插入排序、希尔排序)
2)交换排序(冒泡排序、快速排序)
3)选择排序(直接选择排序、堆排序)
4)归并排序
5)分配排序(基数排序)
所需辅助空间最多:归并排序
所需辅助空间最少:堆排序
平均速度最快:快速排序
不稳定:快速排序,希尔排序,堆排序。
先来看看8种排序之间的关系:
1.直接插入排序
(1
- 【Spark102】Spark存储模块BlockManager剖析
bit1129
manager
Spark围绕着BlockManager构建了存储模块,包括RDD,Shuffle,Broadcast的存储都使用了BlockManager。而BlockManager在实现上是一个针对每个应用的Master/Executor结构,即Driver上BlockManager充当了Master角色,而各个Slave上(具体到应用范围,就是Executor)的BlockManager充当了Slave角色
- linux 查看端口被占用情况详解
daizj
linux端口占用netstatlsof
经常在启动一个程序会碰到端口被占用,这里讲一下怎么查看端口是否被占用,及哪个程序占用,怎么Kill掉已占用端口的程序
1、lsof -i:port
port为端口号
[root@slave /data/spark-1.4.0-bin-cdh4]# lsof -i:8080
COMMAND PID USER FD TY
- Hosts文件使用
周凡杨
hostslocahost
一切都要从localhost说起,经常在tomcat容器起动后,访问页面时输入http://localhost:8088/index.jsp,大家都知道localhost代表本机地址,如果本机IP是10.10.134.21,那就相当于http://10.10.134.21:8088/index.jsp,有时候也会看到http: 127.0.0.1:
- java excel工具
g21121
Java excel
直接上代码,一看就懂,利用的是jxl:
import java.io.File;
import java.io.IOException;
import jxl.Cell;
import jxl.Sheet;
import jxl.Workbook;
import jxl.read.biff.BiffException;
import jxl.write.Label;
import
- web报表工具finereport常用函数的用法总结(数组函数)
老A不折腾
finereportweb报表函数总结
ADD2ARRAY
ADDARRAY(array,insertArray, start):在数组第start个位置插入insertArray中的所有元素,再返回该数组。
示例:
ADDARRAY([3,4, 1, 5, 7], [23, 43, 22], 3)返回[3, 4, 23, 43, 22, 1, 5, 7].
ADDARRAY([3,4, 1, 5, 7], "测试&q
- 游戏服务器网络带宽负载计算
墙头上一根草
服务器
家庭所安装的4M,8M宽带。其中M是指,Mbits/S
其中要提前说明的是:
8bits = 1Byte
即8位等于1字节。我们硬盘大小50G。意思是50*1024M字节,约为 50000多字节。但是网宽是以“位”为单位的,所以,8Mbits就是1M字节。是容积体积的单位。
8Mbits/s后面的S是秒。8Mbits/s意思是 每秒8M位,即每秒1M字节。
我是在计算我们网络流量时想到的
- 我的spring学习笔记2-IoC(反向控制 依赖注入)
aijuans
Spring 3 系列
IoC(反向控制 依赖注入)这是Spring提出来了,这也是Spring一大特色。这里我不用多说,我们看Spring教程就可以了解。当然我们不用Spring也可以用IoC,下面我将介绍不用Spring的IoC。
IoC不是框架,她是java的技术,如今大多数轻量级的容器都会用到IoC技术。这里我就用一个例子来说明:
如:程序中有 Mysql.calss 、Oracle.class 、SqlSe
- 高性能mysql 之 选择存储引擎(一)
annan211
mysqlInnoDBMySQL引擎存储引擎
1 没有特殊情况,应尽可能使用InnoDB存储引擎。 原因:InnoDB 和 MYIsAM 是mysql 最常用、使用最普遍的存储引擎。其中InnoDB是最重要、最广泛的存储引擎。她 被设计用来处理大量的短期事务。短期事务大部分情况下是正常提交的,很少有回滚的情况。InnoDB的性能和自动崩溃 恢复特性使得她在非事务型存储的需求中也非常流行,除非有非常
- UDP网络编程
百合不是茶
UDP编程局域网组播
UDP是基于无连接的,不可靠的传输 与TCP/IP相反
UDP实现私聊,发送方式客户端,接受方式服务器
package netUDP_sc;
import java.net.DatagramPacket;
import java.net.DatagramSocket;
import java.net.Ine
- JQuery对象的val()方法执行结果分析
bijian1013
JavaScriptjsjquery
JavaScript中,如果id对应的标签不存在(同理JAVA中,如果对象不存在),则调用它的方法会报错或抛异常。在实际开发中,发现JQuery在id对应的标签不存在时,调其val()方法不会报错,结果是undefined。
- http请求测试实例(采用json-lib解析)
bijian1013
jsonhttp
由于fastjson只支持JDK1.5版本,因些对于JDK1.4的项目,可以采用json-lib来解析JSON数据。如下是http请求的另外一种写法,仅供参考。
package com;
import java.util.HashMap;
import java.util.Map;
import
- 【RPC框架Hessian四】Hessian与Spring集成
bit1129
hessian
在【RPC框架Hessian二】Hessian 对象序列化和反序列化一文中介绍了基于Hessian的RPC服务的实现步骤,在那里使用Hessian提供的API完成基于Hessian的RPC服务开发和客户端调用,本文使用Spring对Hessian的集成来实现Hessian的RPC调用。
定义模型、接口和服务器端代码
|---Model
&nb
- 【Mahout三】基于Mahout CBayes算法的20newsgroup流程分析
bit1129
Mahout
1.Mahout环境搭建
1.下载Mahout
http://mirror.bit.edu.cn/apache/mahout/0.10.0/mahout-distribution-0.10.0.tar.gz
2.解压Mahout
3. 配置环境变量
vim /etc/profile
export HADOOP_HOME=/home
- nginx负载tomcat遇非80时的转发问题
ronin47
nginx负载后端容器是tomcat(其它容器如WAS,JBOSS暂没发现这个问题)非80端口,遇到跳转异常问题。解决的思路是:$host:port
详细如下:
该问题是最先发现的,由于之前对nginx不是特别的熟悉所以该问题是个入门级别的:
? 1 2 3 4 5
- java-17-在一个字符串中找到第一个只出现一次的字符
bylijinnan
java
public class FirstShowOnlyOnceElement {
/**Q17.在一个字符串中找到第一个只出现一次的字符。如输入abaccdeff,则输出b
* 1.int[] count:count[i]表示i对应字符出现的次数
* 2.将26个英文字母映射:a-z <--> 0-25
* 3.假设全部字母都是小写
*/
pu
- mongoDB 复制集
开窍的石头
mongodb
mongo的复制集就像mysql的主从数据库,当你往其中的主复制集(primary)写数据的时候,副复制集(secondary)会自动同步主复制集(Primary)的数据,当主复制集挂掉以后其中的一个副复制集会自动成为主复制集。提供服务器的可用性。和防止当机问题
mo
- [宇宙与天文]宇宙时代的经济学
comsci
经济
宇宙尺度的交通工具一般都体型巨大,造价高昂。。。。。
在宇宙中进行航行,近程采用反作用力类型的发动机,需要消耗少量矿石燃料,中远程航行要采用量子或者聚变反应堆发动机,进行超空间跳跃,要消耗大量高纯度水晶体能源
以目前地球上国家的经济发展水平来讲,
- Git忽略文件
Cwind
git
有很多文件不必使用git管理。例如Eclipse或其他IDE生成的项目文件,编译生成的各种目标或临时文件等。使用git status时,会在Untracked files里面看到这些文件列表,在一次需要添加的文件比较多时(使用git add . / git add -u),会把这些所有的未跟踪文件添加进索引。
==== ==== ==== 一些牢骚
- MySQL连接数据库的必须配置
dashuaifu
mysql连接数据库配置
MySQL连接数据库的必须配置
1.driverClass:com.mysql.jdbc.Driver
2.jdbcUrl:jdbc:mysql://localhost:3306/dbname
3.user:username
4.password:password
其中1是驱动名;2是url,这里的‘dbna
- 一生要养成的60个习惯
dcj3sjt126com
习惯
一生要养成的60个习惯
第1篇 让你更受大家欢迎的习惯
1 守时,不准时赴约,让别人等,会失去很多机会。
如何做到:
①该起床时就起床,
②养成任何事情都提前15分钟的习惯。
③带本可以随时阅读的书,如果早了就拿出来读读。
④有条理,生活没条理最容易耽误时间。
⑤提前计划:将重要和不重要的事情岔开。
⑥今天就准备好明天要穿的衣服。
⑦按时睡觉,这会让按时起床更容易。
2 注重
- [介绍]Yii 是什么
dcj3sjt126com
PHPyii2
Yii 是一个高性能,基于组件的 PHP 框架,用于快速开发现代 Web 应用程序。名字 Yii (读作 易)在中文里有“极致简单与不断演变”两重含义,也可看作 Yes It Is! 的缩写。
Yii 最适合做什么?
Yii 是一个通用的 Web 编程框架,即可以用于开发各种用 PHP 构建的 Web 应用。因为基于组件的框架结构和设计精巧的缓存支持,它特别适合开发大型应
- Linux SSH常用总结
eksliang
linux sshSSHD
转载请出自出处:http://eksliang.iteye.com/blog/2186931 一、连接到远程主机
格式:
ssh name@remoteserver
例如:
ssh
[email protected]
二、连接到远程主机指定的端口
格式:
ssh name@remoteserver -p 22
例如:
ssh i
- 快速上传头像到服务端工具类FaceUtil
gundumw100
android
快速迭代用
import java.io.DataOutputStream;
import java.io.File;
import java.io.FileInputStream;
import java.io.FileNotFoundException;
import java.io.FileOutputStream;
import java.io.IOExceptio
- jQuery入门之怎么使用
ini
JavaScripthtmljqueryWebcss
jQuery的强大我何问起(个人主页:hovertree.com)就不用多说了,那么怎么使用jQuery呢?
首先,下载jquery。下载地址:http://hovertree.com/hvtart/bjae/b8627323101a4994.htm,一个是压缩版本,一个是未压缩版本,如果在开发测试阶段,可以使用未压缩版本,实际应用一般使用压缩版本(min)。然后就在页面上引用。
- 带filter的hbase查询优化
kane_xie
查询优化hbaseRandomRowFilter
问题描述
hbase scan数据缓慢,server端出现LeaseException。hbase写入缓慢。
问题原因
直接原因是: hbase client端每次和regionserver交互的时候,都会在服务器端生成一个Lease,Lease的有效期由参数hbase.regionserver.lease.period确定。如果hbase scan需
- java设计模式-单例模式
men4661273
java单例枚举反射IOC
单例模式1,饿汉模式
//饿汉式单例类.在类初始化时,已经自行实例化
public class Singleton1 {
//私有的默认构造函数
private Singleton1() {}
//已经自行实例化
private static final Singleton1 singl
- mongodb 查询某一天所有信息的3种方法,根据日期查询
qiaolevip
每天进步一点点学习永无止境mongodb纵观千象
// mongodb的查询真让人难以琢磨,就查询单天信息,都需要花费一番功夫才行。
// 第一种方式:
coll.aggregate([
{$project:{sendDate: {$substr: ['$sendTime', 0, 10]}, sendTime: 1, content:1}},
{$match:{sendDate: '2015-
- 二维数组转换成JSON
tangqi609567707
java二维数组json
原文出处:http://blog.csdn.net/springsen/article/details/7833596
public class Demo {
public static void main(String[] args) { String[][] blogL
- erlang supervisor
wudixiaotie
erlang
定义supervisor时,如果是监控celuesimple_one_for_one则删除children的时候就用supervisor:terminate_child (SupModuleName, ChildPid),如果shutdown策略选择的是brutal_kill,那么supervisor会调用exit(ChildPid, kill),这样的话如果Child的behavior是gen_