Matlab之批量提取数据

写在前面的,软件不太强大,每次保存都需要生成rec和dark的文件,在处理是只需要一个就行了,所有网上查看了下运用批处理的命令去掉多余的文件:

解决办法:windows命令模式下CMD进入文件的目录,输入命令:del /q *rec*.csv(*rec*就是需要删除的包含rec的文件)

昨天下午搞了一个下午的数据提取,想过了用多种方法包括java,delphi等,最后还是想到用Matlab比较方便,选对工具真的很重要啊

我的数据格式:有多个csv文件,对我有用的只有B15:B270的数据,如何提取,看下面代码:

 

wave = csvread('.\dark\dark.csv',14,0,[14,0,269,0]);%看参数,具体参数的功能参考相应的Matlab书籍

dark =csvread('.\dark\dark.csv',14,1,[14,1,269,1]);%获取背景参数,当前目录的下级目录

ref = csvread('.\ref\ref.csv',14,1,[14,1,269,1]);%获取参比

B = ref-dark;

files = dir('*.csv');%获取当前目录的文件数,注意读取的是csv文件

l = length(files);

C = [];

for i = 1:l

    filename = files(i).name;%获得文件名

    A=csvread(filename,14,1,[14,1,269,1]);%读入指定列的数据,详细参数功能参考对应的代码

    D = B./(A-dark);%矩阵对应的数相除

    C = [C D];%矩阵列合并

end

E = [wave log10(C)];

%dlmwrite('result.txt',C,'delimiter','\t');%以文本的形式输出,注意指定精确度'precision','%f32'

xlswrite('result.xlsx',E,'Sheet1');%xls的形式输出

msgbox(['complete! ' num2str(l) ' xls files.']);


 


后来跑数据不好,分析原因是没有去三次的平均值,我是每一个位置光谱扫了三次,但是对应的化学只有一个值(一开始我的办法是三次都是取同一个化学值,但是这样的做法是不对的),所有在原有的基础上,每隔3列取一次平均值,算法如下(代码比较简单):

 

 

A = xlsread('result.xlsx','Sheet1','B3:PE258');

[m,n]=size(A);

B=[];

for i=3:3:n%第二个参数是步长

    temp = A(:,i-2:i);

    C = mean(temp,2);

    B=[B C];

end

xlswrite('mean_3.xlsx',B,'Sheet1');%xls的形式输出

msgbox(['complete! ']);


 

以上就提取完成了,但是化学值是必须自己手动写的,那个真叫一个辛苦,420个数据还好吗,真的还好吗?

 

方法是通用的,以后读取xls的文件可以对应的用xlsread和xlswrite方法来写,类似能读的文本还有txt、dat......

关于常见的光谱数据的处理,对于同一个点的三次的取平均值的matlab的算法:

B=[];%产生一个空矩阵,

for i=0:14

data=zeros(396,1);%生成一个行*列为396*1的零矩阵     

for j=1:3

    s=strcat(num2str(i),'-',num2str(j),'.txt');%'-'是取得i和j之间的链接符。如果是1.2那就是'.'。

    k=importdata(s);

    t=k(:,2);%如果原数据的第一列是光的波数,第二列才是吸光度,那么这里写2

    data=data+t;%注意矩阵的相加

end

    data=data/3;%举证的除法运算,其中每个点都除以3

    B=[B,data];

end

 关于近红外光谱的吸光度的算法,偶然在一个java程序中看见的计算方法:

result[i] = Math.abs(Math.round(((resultQ[i] - resultDark[i]) / (double)(resultLight[i] - resultDark[i])) * 10000) / 10000.0);//此处得到的是透射率T%

result[i] = -Math.log10(result[i]);//得到吸光度abs

 

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