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Biobank genetic data探析(三)
想摸鱼的生信小白
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Biobankgeneticdata探析(三)——GenotypingprocessandsampleQC一.总览Category100313这类数据包含了Affymetrix做Genotypecalling的pipeline的流程信息(后续分析中可能用不到),以及样本质量控制的信息(下游分析中估计是必用了)。二.数据集描述2.1Genotypingprocess查看之后发现这部分不是很重要,毕竟
快速排序法的使用 ( 超详细图解 )
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链表算法快速排序面试数据结构
快速排序法的使用快速排序法作为一种广受好评的排序方法,不仅仅因为它的排序效率很高,更因为它体现了分治的思想。因此许多广为人知的软件公司(BAT)的笔试面试都喜欢考,甚至在一些大大小小的考试如软考、考研中也能见到它的身影。因此熟练默写快速排序法的代码并掌握其核心思想对我们来说尤为重要。快速排序法的背景:快速排序由C.A.R.Hoare在1960年提出。它的基本思想是:通过一趟排序将要排序的数据分割成
GBase8c aes_encrypt和aes_decrypt函数
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在数据库中,aes_encrypt和aes_decrypt函数进行加解密时使用的块加密模式。GBase8c与MySQL的aes_encrypt和aes_decrypt函数区别:1、GBase8c中的初始化向量init_vector不能为空2、MySQL的加密模块block_encryption_mode为aes-128-ecb,GBase8c不支持aes-128-ecb,默认加密模块为aes-12
C#—【特性详解以及自定义特性和通过反射读取特性】
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C#基础-高阶-实战知识点c#开发语言特性反射自定义特性
C#—【特性详解以及自定义特性和通过反射读取特性】目录C#—【特性详解以及自定义特性和通过反射读取特性】介绍:特性可以用于多种用途,包括但不限于:特性的分类:特性的主要用途(举一些直观例子)1.标记代码,让框架自动处理2.数据验证(表单/模型校验)3.控制序列化行为4.生成文档(如API接口说明)5.实现AOP(面向切面编程)为什么用特性而不用其他方法?日常开发中的高频场景一句话总结常见预定义特性
Python在生物信息学中的应用:基因组学与蛋白质组学
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Python教程-基础python
摘要:本文主要介绍了Python在生物信息学中的应用,特别是在基因组学和蛋白质组学领域。文章详细讲述了各个原理,并以代码实例展示了实际应用。我们将探讨如何利用Python分析基因组数据,解析蛋白质序列,以及进行比对分析等。文章目录1.引言2.分析基因组数据2.1读取和解析FASTA文件2.2基因频率分析2.3代码实例3.蛋白质组学3.1解析蛋白质序列3.2蛋白质序列比对3.3代码实例4.总结1.引
yaml常见的读取和写入
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allow_unicode=True:遇到中文不转换为unicode编码sort_keys=False:不进行排序,默认按照字母abcd排序importyamldefwrite_yaml_template():"""统一的yaml模板:return:"""yaml_template=[{'feature':None,'story':None,'title':None,'request':{'met
队列在计算机系统中的应用
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队列在计算机系统中有广泛的应用,主要用于管理任务和处理数据流。以下是队列的一些常见应用场景:1.任务调度操作系统:操作系统使用队列管理进程调度,如先来先服务(FCFS)调度算法。线程池:线程池通过队列管理待执行任务,确保任务按顺序处理。2.数据缓冲I/O操作:队列用于缓冲输入输出数据,平衡生产者和消费者速度。网络通信:网络数据包通过队列缓冲,确保按顺序处理。3.消息传递消息队列:在分布式系统中,消
Leetcode32 最长有效括号深度解析
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问题描述找出字符串s中最长的有效括号子串的长度。核心思路动态规划:定义dp[i]为以字符s[i]结尾的最长有效括号子串长度。分情况讨论:根据当前字符是否为)以及前面的字符情况,推导状态转移方程。状态转移方程详解Case1:当前字符)与前一个字符(直接匹配场景:形如...()的结构。转移方程:if(s.charAt(i-1)=='('){dp[i]=dp[i-2]+2;//前i-2个字符的有效长度+
锁的策略)
康kang
synchronized锁的分类
一、锁的分类第一组:乐观锁和悲观锁这是两种不同的锁的实现方式。乐观锁:在加锁之前,预估当前出现锁冲突的概率不大,因此在进行加锁的时候就不会做太多的工作。悲观锁:在加锁之前,预估到当前锁冲突出现的概率比较大,因此加锁的时候就会做更多的工作,做的事情更多,加锁的速度可能会更慢,但整个过程中不容易出现其他问题。第二组:轻量级锁和重量级锁轻量级锁:加锁的开销小,加锁的速度更快=>一般为乐观锁重量级锁:加锁
request+pytest根据yaml文件发送请求
等枝桠~成繁花
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request怎么跟pytest结合起来,然后根据yaml文件去发一个基本的请求呢?下面是一个简单的示例。1、先新建一个名为“demo.yaml”的yaml文件,用来存放测试数据的。-name:G广州研发中心parentid:1#第一次用例的数据正常expect:60008#对请求结果进行断言-name:""parentid:1#第二次用例的数据name为空expect:40058#对请求结果进行
实战篇:GBase 8a MPP Cluster 安装部署过程
Lucifer三思而后行
DBA实战系列数据库gbasecluster
目录前言☀️环境准备安装介质下载操作系统安装安装前准备1、关闭防火墙2、禁用Selinux3、创建gbase用户4、创建目录并授权5、重启主机❤️GBase8aMPPCluster安装主节点上传安装介质主节点解压安装包分发配置文件配置环境变量修改主节点安装配置文件主节点执行安装命令检查集群状态申请和导入授权①导出集群各节点的指纹信息②邮件申请授权③主节点导入授权④检查授权情况所有节点启动集群服务主
Spring Boot项目中集成sa-token实现认证授权和OAuth 2.0第三方登录
山高自有客行路
#Springbootspringboot
OAuth2.0第三方登录OAuth2.0是一种授权协议,允许第三方应用在不暴露用户密码的情况下访问用户的资源。它通常用于第三方登录场景,例如使用GitHub、Google等社交平台进行登录。在sa-token框架中,OAuth2.0第三方登录可以通过集成sa-token-oauth2模块来实现,并且可以结合sa-token的安全特性来增强安全性。导入依赖首先,在你的pom.xml文件中添加必要的
C语言中的结构体指针
812503533
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一、什么是结构体指针?在C语言中,结构体是一种用户自定义的数据类型,可以将不同类型的变量组合在一起形成一个更复杂的数据结构。而结构体指针则是指向结构体变量地址的指针。通过结构体指针,我们可以动态访问结构体成员、传递结构体到函数以及进行内存管理等操作。结构体指针提供了一个更加灵活和高效的方式来操作结构体,特别是在处理大型数据结构时,指针的使用可以节省内存并提高程序性能。二、如何声明结构体指针?结构体
40岁重启人生学python,今天搞明白了,啥是循环结构?
飞哥知行录
中年人python经验分享开发语言
今天学习了循环结构,其实说心里话,不是太明白,尤其是老师讲了那些高深的理论之后,就更加糊涂了。后来还是借助deepseek,它说:循环结构就是让计算机重复执行某段代码,直到满足特定条件(比如吃饱了就停止吃饭)。吃饱了就停止吃饭,多么简单的一句话,我一下就明白了,忽然觉得那些讲课喜欢高深理论的人,他们真的好可悲。总是抱着概念和教条的东西,不知道你们是怎么听明白的。循环结构的三种常见类型是`for循环
一份C#的笔试题及答案
网际游侠
c#面试笔试
C#笔试题一、基础知识OOP的基本概念面向对象编程的核心思想包括四个主要特性:继承、多态、封装和信息隐藏。请简述这四个特性的具体内容。值类型与引用类型的区别值类型(如int,string)在内存中直接存储数据,而引用类型(如object,ref)通过引用间接存储,指出值的位置。请举例说明两者的不同。静态与非静态关键字的作用静态和非静态关键字用于区分依赖于实例还是不依赖于实例的成员。请分别解释它们的
Lumberyard:Lumberyard物理系统详解_2024-07-13_20-00-57.Tex
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Lumberyard:Lumberyard物理系统详解Lumberyard物理系统概述物理引擎介绍Lumberyard,亚马逊的游戏引擎,集成了强大的物理引擎,用于模拟游戏世界中的真实物理行为。其物理引擎基于PhysX,一个由NVIDIA开发的物理模拟技术,广泛应用于游戏开发中。PhysX支持复杂的物理交互,包括刚体动力学、软体物理、流体动力学等,能够为游戏提供逼真的物理效果。物理系统在Lumbe
数据结构-稀疏矩阵-十字链表存储
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当矩阵的非零元个数与位置在操作中变化较大时,就不宜用顺序存储结构来表示三元组的线性表。在链表中,每个非零元可用一个含5个域的结点表示,其中i,j,e这三个域分别表示该非零元所在的行的值,向右域right用以链接同一行中下一个非零元,向下域down用以链接同一列中下一个非零元,向右域right用以链接同一行中下一个非零元,向下域down用以链接同一列中下一个非零元。同一行的非零元通过right域链接
Spring Boot拦截器(Interceptor)与过滤器(Filter)深度解析:区别、实现与实战指南
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SpringBoot拦截器(Interceptor)与过滤器(Filter)深度解析:区别、实现与实战指南一、核心概念对比1.本质区别维度过滤器(Filter)拦截器(Interceptor)规范层级Servlet规范(J2EE标准)SpringMVC框架机制作用范围所有请求(包括静态资源)只处理Controller请求依赖关系不依赖Spring容器完全集成SpringIOC容器执行顺序最先执行(
GBASE 8C——SQL参考6 sql语法(14)
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ROLLBACKPREPARED功能描述取消一个先前为两阶段提交准备好的事务。语法格式ROLLBACKPREPAREDtransaction_id参数说明transaction_id:待提交事务的标识符。它不能和任何当前预备事务已经使用了的标识符同名。注意事项要想回滚一个预备事务,必须是最初发起事务的用户,或者是系统管理员。pg_prepared_xacts系统视图中列出了当前可用的所有准备好的事
GBASE 8C——SQL参考6 sql语法(5)
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COMMIT功能描述提交当前事务。语法格式COMMIT[WORK|TRANSACTION]参数说明WORK|TRANSACTION:可选的关键词,没有具体效果。注意事项执行COMMIT这个命令的时候,命令执行者必须是该事务的创建者或系统管理员,且创建和提交操作可以不在同一个会话中。语法兼容符合SQL标准。相关语法BEGIN,ROLLBACK,ENDCOMMITPREPARED功能描述提交一个预先为
GBASE 8C——SQL参考6 sql语法(2)
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数据库sql
ALTERINDEX功能描述修改一个索引的参数。语法格式ALTERINDEX[IFEXISTS]nameRENAMETOnew_nameALTERINDEX[IFEXISTS]nameSETTABLESPACEtablespace_nameALTERINDEXnameDEPENDSONEXTENSIONextension_nameALTERINDEX[IFEXISTS]nameSET(storag
python基于django/flask网上书城系统Django-SpringBoot-php-Node.js-flask
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目录技术栈介绍具体实现截图系统设计研究方法:设计步骤设计流程核心代码部分展示研究方法详细视频演示试验方案论文大纲源码获取/详细视频演示技术栈介绍Django-SpringBoot-php-Node.js-flask本课题的研究方法和研
Java流程控制
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Java流程控制用户交互Scannerjava.util.Scanner使用这个包中Scanner类获取用户的输出基本语法 Scanners=newScanner(System.in);通过Scanner类的next()与nextLine()方法获取输入的字符串,在读取前我们要使用hasNext()与hasNextLine()判断用户是否还有输入的数据next():一定要读取到有效字符后才可以结束
Node.js系列(1)--架构设计指南
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Node.jsnode.jsvim编辑器
Node.js架构设计指南️引言Node.js作为一个高性能的JavaScript运行时环境,其架构设计对于构建可扩展的服务端应用至关重要。本文将深入探讨Node.js的架构设计原则、最佳实践和实现方案。架构概述Node.js架构主要包括以下方面:事件驱动:基于事件循环的异步非阻塞架构模块系统:CommonJS和ES模块系统进程模型:单线程主进程与工作线程流处理:基于Stream的数据处理错误处理
C# 线程池 ThreadPool 的深入解析与应用
墨夶
C#学习资料1c#算法
在多线程编程中,线程池(ThreadPool)是一种高效利用系统资源的方式。通过合理使用线程池,可以显著提高应用程序的性能和响应能力。本文将深入解析C#中的ThreadPool类,并展示如何在实际应用中有效地使用它。你是否曾经面临过创建过多线程导致系统资源耗尽的问题?C#提供的ThreadPool类可以帮助你优雅地管理线程,避免这些问题。本文将带你一步步深入了解ThreadPool并展示其在实际项
Nginx负载均衡
510888780
nginx应用服务器
Nginx负载均衡一些基础知识:
nginx 的 upstream目前支持 4 种方式的分配
1)、轮询(默认)
每个请求按时间顺序逐一分配到不同的后端服务器,如果后端服务器down掉,能自动剔除。
2)、weight
指定轮询几率,weight和访问比率成正比
RedHat 6.4 安装 rabbitmq
bylijinnan
erlangrabbitmqredhat
在 linux 下安装软件就是折腾,首先是测试机不能上外网要找运维开通,开通后发现测试机的 yum 不能使用于是又要配置 yum 源,最后安装 rabbitmq 时也尝试了两种方法最后才安装成功
机器版本:
[root@redhat1 rabbitmq]# lsb_release
LSB Version: :base-4.0-amd64:base-4.0-noarch:core
FilenameUtils工具类
eksliang
FilenameUtilscommon-io
转载请出自出处:http://eksliang.iteye.com/blog/2217081 一、概述
这是一个Java操作文件的常用库,是Apache对java的IO包的封装,这里面有两个非常核心的类FilenameUtils跟FileUtils,其中FilenameUtils是对文件名操作的封装;FileUtils是文件封装,开发中对文件的操作,几乎都可以在这个框架里面找到。 非常的好用。
xml文件解析SAX
不懂事的小屁孩
xml
xml文件解析:xml文件解析有四种方式,
1.DOM生成和解析XML文档(SAX是基于事件流的解析)
2.SAX生成和解析XML文档(基于XML文档树结构的解析)
3.DOM4J生成和解析XML文档
4.JDOM生成和解析XML
本文章用第一种方法进行解析,使用android常用的DefaultHandler
import org.xml.sax.Attributes;
通过定时任务执行mysql的定期删除和新建分区,此处是按日分区
酷的飞上天空
mysql
使用python脚本作为命令脚本,linux的定时任务来每天定时执行
#!/usr/bin/python
# -*- coding: utf8 -*-
import pymysql
import datetime
import calendar
#要分区的表
table_name = 'my_table'
#连接数据库的信息
host,user,passwd,db =
如何搭建数据湖架构?听听专家的意见
蓝儿唯美
架构
Edo Interactive在几年前遇到一个大问题:公司使用交易数据来帮助零售商和餐馆进行个性化促销,但其数据仓库没有足够时间去处理所有的信用卡和借记卡交易数据
“我们要花费27小时来处理每日的数据量,”Edo主管基础设施和信息系统的高级副总裁Tim Garnto说道:“所以在2013年,我们放弃了现有的基于PostgreSQL的关系型数据库系统,使用了Hadoop集群作为公司的数
spring学习——控制反转与依赖注入
a-john
spring
控制反转(Inversion of Control,英文缩写为IoC)是一个重要的面向对象编程的法则来削减计算机程序的耦合问题,也是轻量级的Spring框架的核心。 控制反转一般分为两种类型,依赖注入(Dependency Injection,简称DI)和依赖查找(Dependency Lookup)。依赖注入应用比较广泛。
用spool+unixshell生成文本文件的方法
aijuans
xshell
例如我们把scott.dept表生成文本文件的语句写成dept.sql,内容如下:
set pages 50000;
set lines 200;
set trims on;
set heading off;
spool /oracle_backup/log/test/dept.lst;
select deptno||','||dname||','||loc
1、基础--名词解析(OOA/OOD/OOP)
asia007
学习基础知识
OOA:Object-Oriented Analysis(面向对象分析方法)
是在一个系统的开发过程中进行了系统业务调查以后,按照面向对象的思想来分析问题。OOA与结构化分析有较大的区别。OOA所强调的是在系统调查资料的基础上,针对OO方法所需要的素材进行的归类分析和整理,而不是对管理业务现状和方法的分析。
OOA(面向对象的分析)模型由5个层次(主题层、对象类层、结构层、属性层和服务层)
浅谈java转成json编码格式技术
百合不是茶
json编码java转成json编码
json编码;是一个轻量级的数据存储和传输的语言
在java中需要引入json相关的包,引包方式在工程的lib下就可以了
JSON与JAVA数据的转换(JSON 即 JavaScript Object Natation,它是一种轻量级的数据交换格式,非
常适合于服务器与 JavaScript 之间的数据的交
web.xml之Spring配置(基于Spring+Struts+Ibatis)
bijian1013
javaweb.xmlSSIspring配置
指定Spring配置文件位置
<context-param>
<param-name>contextConfigLocation</param-name>
<param-value>
/WEB-INF/spring-dao-bean.xml,/WEB-INF/spring-resources.xml,
/WEB-INF/
Installing SonarQube(Fail to download libraries from server)
sunjing
InstallSonar
1. Download and unzip the SonarQube distribution
2. Starting the Web Server
The default port is "9000" and the context path is "/". These values can be changed in &l
【MongoDB学习笔记十一】Mongo副本集基本的增删查
bit1129
mongodb
一、创建复本集
假设mongod,mongo已经配置在系统路径变量上,启动三个命令行窗口,分别执行如下命令:
mongod --port 27017 --dbpath data1 --replSet rs0
mongod --port 27018 --dbpath data2 --replSet rs0
mongod --port 27019 -
Anychart图表系列二之执行Flash和HTML5渲染
白糖_
Flash
今天介绍Anychart的Flash和HTML5渲染功能
HTML5
Anychart从6.0第一个版本起,已经逐渐开始支持各种图的HTML5渲染效果了,也就是说即使你没有安装Flash插件,只要浏览器支持HTML5,也能看到Anychart的图形(不过这些是需要做一些配置的)。
这里要提醒下大家,Anychart6.0版本对HTML5的支持还不算很成熟,目前还处于
Laravel版本更新异常4.2.8-> 4.2.9 Declaration of ... CompilerEngine ... should be compa
bozch
laravel
昨天在为了把laravel升级到最新的版本,突然之间就出现了如下错误:
ErrorException thrown with message "Declaration of Illuminate\View\Engines\CompilerEngine::handleViewException() should be compatible with Illuminate\View\Eng
编程之美-NIM游戏分析-石头总数为奇数时如何保证先动手者必胜
bylijinnan
编程之美
import java.util.Arrays;
import java.util.Random;
public class Nim {
/**编程之美 NIM游戏分析
问题:
有N块石头和两个玩家A和B,玩家A先将石头随机分成若干堆,然后按照BABA...的顺序不断轮流取石头,
能将剩下的石头一次取光的玩家获胜,每次取石头时,每个玩家只能从若干堆石头中任选一堆,
lunce创建索引及简单查询
chengxuyuancsdn
查询创建索引lunce
import java.io.File;
import java.io.IOException;
import org.apache.lucene.analysis.Analyzer;
import org.apache.lucene.analysis.standard.StandardAnalyzer;
import org.apache.lucene.document.Docume
[IT与投资]坚持独立自主的研究核心技术
comsci
it
和别人合作开发某项产品....如果互相之间的技术水平不同,那么这种合作很难进行,一般都会成为强者控制弱者的方法和手段.....
所以弱者,在遇到技术难题的时候,最好不要一开始就去寻求强者的帮助,因为在我们这颗星球上,生物都有一种控制其
flashback transaction闪回事务查询
daizj
oraclesql闪回事务
闪回事务查询有别于闪回查询的特点有以下3个:
(1)其正常工作不但需要利用撤销数据,还需要事先启用最小补充日志。
(2)返回的结果不是以前的“旧”数据,而是能够将当前数据修改为以前的样子的撤销SQL(Undo SQL)语句。
(3)集中地在名为flashback_transaction_query表上查询,而不是在各个表上通过“as of”或“vers
Java I/O之FilenameFilter类列举出指定路径下某个扩展名的文件
游其是你
FilenameFilter
这是一个FilenameFilter类用法的例子,实现的列举出“c:\\folder“路径下所有以“.jpg”扩展名的文件。 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28
C语言学习五函数,函数的前置声明以及如何在软件开发中合理的设计函数来解决实际问题
dcj3sjt126com
c
# include <stdio.h>
int f(void) //括号中的void表示该函数不能接受数据,int表示返回的类型为int类型
{
return 10; //向主调函数返回10
}
void g(void) //函数名前面的void表示该函数没有返回值
{
//return 10; //error 与第8行行首的void相矛盾
}
in
今天在测试环境使用yum安装,遇到一个问题: Error: Cannot retrieve metalink for repository: epel. Pl
dcj3sjt126com
centos
今天在测试环境使用yum安装,遇到一个问题:
Error: Cannot retrieve metalink for repository: epel. Please verify its path and try again
处理很简单,修改文件“/etc/yum.repos.d/epel.repo”, 将baseurl的注释取消, mirrorlist注释掉。即可。
&n
单例模式
shuizhaosi888
单例模式
单例模式 懒汉式
public class RunMain {
/**
* 私有构造
*/
private RunMain() {
}
/**
* 内部类,用于占位,只有
*/
private static class SingletonRunMain {
priv
Spring Security(09)——Filter
234390216
Spring Security
Filter
目录
1.1 Filter顺序
1.2 添加Filter到FilterChain
1.3 DelegatingFilterProxy
1.4 FilterChainProxy
1.5
公司项目NODEJS实践0.1
逐行分析JS源代码
mongodbnginxubuntunodejs
一、前言
前端如何独立用nodeJs实现一个简单的注册、登录功能,是不是只用nodejs+sql就可以了?其实是可以实现,但离实际应用还有距离,那要怎么做才是实际可用的。
网上有很多nod
java.lang.Math
liuhaibo_ljf
javaMathlang
System.out.println(Math.PI);
System.out.println(Math.abs(1.2));
System.out.println(Math.abs(1.2));
System.out.println(Math.abs(1));
System.out.println(Math.abs(111111111));
System.out.println(Mat
linux下时间同步
nonobaba
ntp
今天在linux下做hbase集群的时候,发现hmaster启动成功了,但是用hbase命令进入shell的时候报了一个错误 PleaseHoldException: Master is initializing,查看了日志,大致意思是说master和slave时间不同步,没办法,只好找一种手动同步一下,后来发现一共部署了10来台机器,手动同步偏差又比较大,所以还是从网上找现成的解决方
ZooKeeper3.4.6的集群部署
roadrunners
zookeeper集群部署
ZooKeeper是Apache的一个开源项目,在分布式服务中应用比较广泛。它主要用来解决分布式应用中经常遇到的一些数据管理问题,如:统一命名服务、状态同步、集群管理、配置文件管理、同步锁、队列等。这里主要讲集群中ZooKeeper的部署。
1、准备工作
我们准备3台机器做ZooKeeper集群,分别在3台机器上创建ZooKeeper需要的目录。
数据存储目录
Java高效读取大文件
tomcat_oracle
java
读取文件行的标准方式是在内存中读取,Guava 和Apache Commons IO都提供了如下所示快速读取文件行的方法: Files.readLines(new File(path), Charsets.UTF_8); FileUtils.readLines(new File(path)); 这种方法带来的问题是文件的所有行都被存放在内存中,当文件足够大时很快就会导致
微信支付api返回的xml转换为Map的方法
xu3508620
xmlmap微信api
举例如下:
<xml>
<return_code><![CDATA[SUCCESS]]></return_code>
<return_msg><![CDATA[OK]]></return_msg>
<appid><