Spark-000讲:What is Spark ?

Apache Spark是一个围绕速度、易用性和复杂分析构建的大数据处理框架。最初在2009年由加州大学伯克利分校的AMPLab开发,并于2010年成为Apache的开源项目之一。Spark 启用了内存分布数据集,除了能够提供交互式查询外,它还可以优化迭代工作负载。目前正朝着数据科学的OS发展。

下面我们从以下三个方面,为大家彻底解密What is Spark?

1.Spark生态系统


Spark 生态圈以 Spark Core 为核心,从 HDFS Amazon S3 HBase 等持久层读取数据,以 MESOS YARN 和自身携带的 Standalone 为资源管理器调度 Job 完成 Spark 应用程序的计算。 这些应用程序可以来自于不同的组件,如 Spark Shell/Spark Submit 的批处理、 Spark Streaming 的实时处理应用、 Spark SQL 查询 、Spark  MLlib 机器学习、Spark  GraphX 图处理和 Spark R 数学计算等等。
如下图所示:
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通过上图我们可以很直观的了解到,Spark生态圈已经涉及到机器学习、数据挖掘、数据库、信息检索、自然语言处理和语音识别等多个领域。
Spark SQL查询
       Spark SQL 可以通过JDBC API将Spark数据集暴露出去,而且还可以用传统的BI和可视化工具在Spark数据上执行类似SQL的查询。用户还可以用Spark SQL对不同格式的数据(如JSON,Parquet以及数据库等)执行ETL,将其转化,然后暴露给特定的查询。
主要sparkSQL在下面几点做了优化:

1. 内存列存储(In-Memory Columnar Storage) sparkSQL的表数据在内存中存储不是采用原生态的JVM对象存储方式,而是采用内存列存储;

2. 字节码生成技术(Bytecode Generation) Spark1.1.0在Catalyst模块的expressions增加了codegen模块,使用动态字节码生成技术,对匹配的表达式采用特定的代码动态编译。另外对SQL表达式都作了CG优化, CG优化的实现主要还是依靠Scala2.10的运行时放射机制(runtime reflection);

3. Scala代码优化 SparkSQL在使用Scala编写代码的时候,尽量避免低效的、容易GC的代码;尽管增加了编写代码的难度,但对于用户来说接口统一。


Spark Streaming的实时处理应用
    SparkStreaming是一个对实时数据流进行高通量、容错处理的流式处理系统,可以对多种数据源(如KdfkaFlumeTwitterZeroTCP 套接字)进行类似MapReduceJoin等复杂操作,并将结果保存到外部文件系统、数据库或应用到实时仪表盘。

计算流程: Spark Streaming 是将流式计算分解成一系列短小的批处理作业。这里的批处理引擎是 Spark Core ,也就是把 Spark Streaming 的输入数据按照 batch size (如 1 秒)分成一段一段的数据( Discretized Stream ),每一段数据都转换成 Spark 中的 RDD Resilient Distributed Dataset ),然后将 Spark Streaming 中对 DStream Transformation 操作变为针对 Spark 中对 RDD Transformation 操作,将 RDD 经过操作变成中间结果保存在内存中。整个流式计算根据业务的需求可以对中间的结果进行叠加或者存储到外部设备。下图显示了 Spark Streaming 的整个流程。
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容容错性:对于流式计算来说,容错性至关重要。首先我们要明确一下Spark中RDD的容错机制。每一个RDD都是一个不可变的分布式可重算的数据集,其记录着确定性的操作继承关系(lineage),所以只要输入数据是可容错的,那么任意一个RDD的分区(Partition)出错或不可用,都是可以利用原始输入数据通过转换操作而重新算出的。  

对于Spark Streaming来说,其RDD的传承关系如下图所示,图中的每一个椭圆形表示一个RDD,椭圆形中的每个圆形代表一个RDD中的一个Partition,图中的每一列的多个RDD表示一个DStream(图中有三个DStream),而每一行最后一个RDD则表示每一个Batch Size所产生的中间结果RDD。我们可以看到图中的每一个RDD都是通过lineage相连接的,由于Spark Streaming输入数据可以来自于磁盘,例如HDFS(多份拷贝)或是来自于网络的数据流(Spark Streaming会将网络输入数据的每一个数据流拷贝两份到其他的机器)都能保证容错性,所以RDD中任意的Partition出错,都可以并行地在其他机器上将缺失的Partition计算出来。这个容错恢复方式比连续计算模型(如Storm)的效率更高。

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实时性:对于实时性的讨论,会牵涉到流式处理框架的应用场景。Spark Streaming将流式计算分解成多个Spark Job,对于每一段数据的处理都会经过Spark DAG图分解以及Spark的任务集的调度过程。对于目前版本的Spark Streaming而言,其最小的Batch Size的选取在0.5~2秒钟之间(Storm目前最小的延迟是100ms左右),所以Spark Streaming能够满足除对实时性要求非常高(如高频实时交易)之外的所有流式准实时计算场景。
扩展性与吞吐量:Spark目前在EC2上已能够线性扩展到100个节点(每个节点4Core),可以以数秒的延迟处理6GB/s的数据量(60M records/s),其吞吐量也比流行的Storm25倍,图4Berkeley利用WordCountGrep两个用例所做的测试,在Grep这个测试中,Spark Streaming中的每个节点的吞吐量是670k records/s,而Storm115k records/s


Spark MLlib机器学习
MLlibSpark实现一些常见的机器学习算法和实用程序,包括分类、回归、聚类、协同过滤、降维以及底层优化,该算法可以进行可扩充; MLRuntime 基于Spark计算框架,将Spark的分布式计算应用到机器学习领域。
MLlib基于RDD,天生就可以与Spark SQLGraphXSpark Streaming无缝集成,以RDD为基石,4个子框架可联手构建大数据计算中心!

Spark之所以在机器学习方面具有得天独厚的优势,有以下几点原因:

(1)机器学习算法一般都有很多个步骤迭代计算的过程,机器学习的计算需要在多次迭代后获得足够小的误差或者足够收敛才会停止,迭代时如果使用Hadoop的MapReduce计算框架,每次计算都要读/写磁盘以及任务的启动等工作,这回导致非常大的I/O和CPU消耗。而Spark基于内存的计算模型天生就擅长迭代计算,多个步骤计算直接在内存中完成,只有在必要时才会操作磁盘和网络,所以说Spark正是机器学习的理想的平台。

(2)从通信的角度讲,如果使用Hadoop的MapReduce计算框架,JobTracker和TaskTracker之间由于是通过heartbeat的方式来进行的通信和传递数据,会导致非常慢的执行速度,而Spark具有出色而高效的Akka和Netty通信系统,通信效率极高。

MLlib(Machine Learnig lib) 是Spark对常用的机器学习算法的实现库,同时包括相关的测试和数据生成器。Spark的设计初衷就是为了支持一些迭代的Job, 这正好符合很多机器学习算法的特点。在Spark官方首页中展示了Logistic Regression算法在Spark和Hadoop中运行的性能比较,如图下图所示。


Spark GraphX的图处理

GraphX是Spark中用于图(e.g., Web-Graphs and Social Networks)和图并行计算(e.g., PageRank and Collaborative Filtering)的API,可以认为是GraphLab(C++)和Pregel(C++)在Spark(Scala)上的重写及优化,跟其他分布式图计算框架相比,GraphX最大的贡献是,在Spark之上提供一栈式数据解决方案,可以方便且高效地完成图计算的一整套流水作业。GraphX最先是伯克利AMPLAB的一个分布式图计算框架项目,后来整合到Spark中成为一个核心组件。

GraphX的核心抽象是Resilient Distributed Property Graph,一种点和边都带属性的有向多重图。它扩展了Spark RDD的抽象,有Table和Graph两种视图,而只需要一份物理存储。两种视图都有自己独有的操作符,从而获得了灵活操作和执行效率。如同Spark,GraphX的代码非常简洁。GraphX的核心代码只有3千多行,而在此之上实现的Pregel模型,只要短短的20多行。GraphX的代码结构整体下图所示,其中大部分的实现,都是围绕Partition的优化进行的。这在某种程度上说明了点分割的存储和相应的计算优化的确是图计算框架的重点和难点。


GraphX的底层设计有以下几个关键点。

1.对Graph视图的所有操作,最终都会转换成其关联的Table视图的RDD操作来完成。这样对一个图的计算,最终在逻辑上,等价于一系列RDD的转换过程。因此,Graph最终具备了RDD的3个关键特性:Immutable、Distributed和Fault-Tolerant。其中最关键的是Immutable(不变性)。逻辑上,所有图的转换和操作都产生了一个新图;物理上,GraphX会有一定程度的不变顶点和边的复用优化,对用户透明。

2.两种视图底层共用的物理数据,由RDD[Vertex-Partition]和RDD[EdgePartition]这两个RDD组成。点和边实际都不是以表Collection[tuple]的形式存储的,而是由VertexPartition/EdgePartition在内部存储一个带索引结构的分片数据块,以加速不同视图下的遍历速度。不变的索引结构在RDD转换过程中是共用的,降低了计算和存储开销。

3.图的分布式存储采用点分割模式,而且使用partitionBy方法,由用户指定不同的划分策略(PartitionStrategy)。划分策略会将边分配到各个EdgePartition,顶点Master分配到各个VertexPartition,EdgePartition也会缓存本地边关联点的Ghost副本。划分策略的不同会影响到所需要缓存的Ghost副本数量,以及每个EdgePartition分配的边的均衡程度,需要根据图的结构特征选取最佳策略。目前有EdgePartition2d、EdgePartition1d、RandomVertexCut和CanonicalRandomVertexCut这四种策略。在淘宝大部分场景下,EdgePartition2d效果最好。


Spark R的数学计算  

SparkR是AMPLab发布的一个R开发包,使得R摆脱单机运行的命运,可以作为Spark的job运行在集群上,极大得扩展了R的数据处理能力。

SparkR的几个特性:

l  提供了Spark中弹性分布式数据集(RDD)的API,用户可以在集群上通过R shell交互性的运行Spark job。

l  支持序化闭包功能,可以将用户定义函数中所引用到的变量自动序化发送到集群中其他的机器上。

l  SparkR还可以很容易地调用R开发包,只需要在集群上执行操作前用includePackage读取R开发包就可以了,当然集群上要安装R开发包。

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2.Spark特性

日后补充

3.Spark体系架构

Spark体系架构包括如下三个主要组件:

  • 数据存储
  • API
  • 管理框架

接下来让我们详细了解一下这些组件。

数据存储:

Spark用HDFS文件系统存储数据。它可用于存储任何兼容于Hadoop的数据源,包括HDFS,HBase,Cassandra等。

API:

利用API,应用开发者可以用标准的API接口创建基于Spark的应用。Spark提供Scala,Java和Python三种程序设计语言的API。

下面是三种语言Spark API的网站链接。

  • Scala API
  • Java
  • Python

资源管理:

Spark既可以部署在一个单独的服务器也可以部署在像Mesos或YARN这样的分布式计算框架之上。

下图展示了Spark体系架构模型中的各个组件。

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