生信R语言第7页

可以用 Python 编程语言做哪些神奇好玩的事情？

目前的数据工作中，数据科学家使用最多的工具语言就是Python，排在第二的工具语言是R语言。但这里有一个有趣的现象，那就是同时使用Python或者R语言的人，推荐别人使用Python的却远高于R语言。

交大全栈智能工程师·2024-02-10 20:15

MySQL数据库应用实验报告——实验1 表结构创建

数据库GXGL包含下列六个表:(1)Students:学生信息表(2)Departments:教学院系信息表(3)major:专业信息表(4)Courses:课程信息表(5)Teacher:教职工人事信息表

NLxxxxX·2024-02-10 20:41

单细胞分析之细胞注释工具Garnett

本文摘自公众号【生信诊断所】原文链接：https://mp.weixin.qq.com/s/eV0m1H6a9gyf4FMZjqQnzA摘要Garnett是一个单细胞自动注释软件包，输入数据包括一个单细胞数据集和细胞类型定义文件

11的雾·2024-02-10 19:00

跟着ISEM学作图：R语言ggtree+ggplot2组合进化树和气泡图

论文Conservedandreproduciblebacterialcommunitiesassociatewithextraradicalhyphaeofarbuscularmycorrhizalfungiimage.png今天的推文我们来重复一下论文中的Figure2image.png没有找到论文提供的原始数据，这里数据我自己构造一份首先是左侧的进化树文件(((A8:0.9735669859

小明的数据分析笔记本·2024-02-10 17:59

R语言编程-Tidyverse 书籍 - 第三章 - 统计建模

1整洁模型结果-broom包tidyverse主张以‘‘整洁的”数据框作为输入，但是lm,nls,t.test,kmeans等模型的输出结果，却是‘‘不整洁的”列表。broom包实现将模型输出结果转化为整洁的tibble，且列名规范一致，方便后续取用；另外，与tidyr包中的nest()/unnest()函数以及purrr包中的map_*()系列函数连用，非常便于批量建模和批量整合模型结果。bro

Hello育种·2024-02-10 16:12

信号部分知识总结

主要受阻塞（屏蔽）影响递达内核产生信号后提送并且送达进程。递达的

编程小公举·2024-02-10 15:37

生信小白如何在半年收到核心期刊录用证明顺利毕业！！！（投稿）

前期推文为本人生信文章的大部分内容，此外还有顺势作用元件的分析，实验qRT-PCR等，可根据需求自行调整。

Charon_7db5·2024-02-10 13:49

学习小组Day2笔记-Dandelion

Day2notesLinux常用语句1.pwd(printworkingdirectory)2.mkdir创建空目录/文件夹eg:mkdirDandelion(创建一个“Dandelion”的文件夹)biosoft:生信软件

Dandelion_ed32·2024-02-10 13:47

IOBR:一个R包带你走进数据挖掘的殿堂

鉴于前一段时间有小伙伴私聊Immugent说生信宝库是不是专门只写单细胞相关的推文呀，其实，这只是凑巧最近发的都是单细胞相关的。

生信宝库·2024-02-10 08:36

在Python和R语言中使用Auto ARIMA构建高性能时间序列模型

想象一下，你的任务是预测下一部iPhone的价格，并提供了历史数据。这包括季度销售、月度支出，以及苹果资产负债表上的一大堆东西。作为一个数据科学家，你会把这个问题归类为什么？当然是时间序列建模。从预测产品的销售到估计家庭的用电量，时间序列预测是任何数据科学家都应该知道的核心技能之一，如果不是精通的话。有很多不同的技术可供您使用，在本文中，我们将介绍一种最有效的技术，称为AutoARIMA。我们将首

公子曼步·2024-02-10 07:17

华为OD机试 - 智能成绩表（ Python & C & C++ & Java&Go & JS & PHP）

0#include#include#includeusingnamespacestd;//学生信息结构体structStudent{stringname;vectorscores;inttotalScore

偶然i·2024-02-10 07:00

我的天呀，纯生信SCI被8本期刊秒拒

最近有粉丝就要这样的经历：自己写了一篇纯生信的文章，投了8本期刊都秒拒了，都是没有送审的，投稿投得自己都要绝望了。很显然，投的期刊基本都是对纯

SCI狂人团队·2024-02-10 07:33

单细胞数据挖掘(10a)-基于FPKM标准化的单细胞差异分析

本笔记来源于B站@生信技能树-jimmy；学习视频链接:「生信技能树」单细胞数据挖掘以下内容是我拷贝自学习资料里的markdown文件，作者信息如文件所示。本人在学习的过程中做了一些注释、删减和改动。

北欧森林·2024-02-10 06:08

R语言|CMplot包绘制环形曼哈顿图

R包-CMplot绘制环形曼哈顿图今天小编给大家分享的是R语言绘制环形曼哈顿图的方法，主要用到的是CMplot包，它是绘制SNP密度、曼哈顿图和QQ图的一个很实用的R包。大家感兴趣的话可以瞅瞅。

维凡生物·2024-02-10 05:10

基于R语言的微生物群落组成多样性分析——物种丰度计算及可视化

引言在对样本的微生物群落组成多样性分析过程中，除了Alpha多样性与Beta多样性的分析，最重要的一个部分就是对样本中微生物具体的群落结构组成情况进行分析。一般我们从门水平及属水平上计算优势物种的相对丰度并通过表格或者柱状堆积图进行展示。正文—代码设置工作目录并加载包rm(list=ls())#clearGlobalEnvironmentsetwd('D:\\桌面\\物种丰度计算及可视化'

科研那点事儿·2024-02-10 01:26

TCGA新版数据库表达矩阵提取

本文首发于公众号：医学和生信笔记医学和生信笔记，专注R语言在临床医学中的使用，R语言数据分析和可视化。主要分享R语言做医学统计学、meta分析、网络药理学、临床预测模型、机器学习、生物信息学等。

医学和生信笔记·2024-02-10 00:22

2022-11-26

生信记录11.fastqc路径/root/anaconda3/bin/FastQC/执行.

fb6697f26c1b·2024-02-09 23:38

社区盈利三板斧之自动化内容系统总结

客户购买的永远是一种感觉，并且买的是未来，在购买的当下他是无法体会到产品真正的价值的，当我们把这种诱惑，这种未来的好处的感觉，传输到他的大脑中，破碎他，同频共振就会自然的对我们产生信任3，产品线布局。

梵天说·2024-02-09 23:25

Meta分析入门工具介绍

主要目的是先能够简单的复现一些论文的研究方法，按照计划是了解Revman，stata与R语言的相关分析方法即可。

Jabes·2024-02-09 22:00

DAY5-zzw

内容源自生信星球一些基础1.R的赋值符号不是等号，而是<-2.在Console控制台输入命令，相当于Linux的命令行3.R的代码都是带括号的，括号必须是英文的。

张纸薇·2024-02-09 21:39

R语言可视化学习笔记之ggridges包

作者：严涛浙江大学作物遗传育种在读研究生（生物信息学方向）伪码农，R语言爱好者，爱开源。严涛老师的绘图教程还有：gganimate|诺奖文章里面的动图布局教程来了！！

生信宝典·2024-02-09 21:25

基于R语言如何实现偏最小二乘法判别分析（PLS-DA）？

偏最小二乘法判别分析，即我常说的PLS-DA（PartialLeastSquaresDiscriminantAnalysis），经常被用来处理分类和判别问题。这种方法和PCA分析方法是比较类似的，区别在于二者是否有监督，一般PCA是无监督的，而PLS-DA是有监督的。当碰到样本组间差异大而组内差异小的情况，常见的PCA分析方法是可以很好地区分组间差异的，但是遇到样本组间差异不大的情

科研那点事儿·2024-02-09 17:27

何谓真正的教育-电影《孩子王》观影日志

一位好的老师，一定是让学生信服的老师。影片的主人公老杆是一名下乡青年，他只读到高一就赶上“上山下乡”运动，来到偏僻的广西山村任教初三。对于从

上官元浪·2024-02-09 17:48

R语言ggplot2：第九章数据操作

第9章数据操作9.1plyr包简介plyr包中的ddply()函数能够同时在数据的多个子集上做统计汇总。ddply(.data,.variables,.fun,...):data是用来作图的数据，variables是对数据取子集的分组变量，fun是要在各子集上运行的统计汇总函数。subset()用来对数据取子集的函数，选择数据中前n个（x%）个观测值，或者再某个阈值之上或下的观测值。transfo

王叽叽的小心情·2024-02-09 15:45

70天坚持萌姐60S+努力成为更好的自己

我的人生信条就是:每天进步一点点，努力只为更好的自己！不求和别人比，只选择和自己比，只要今天的自己比昨天的自己有进步！简单介绍一下自己，我认为可以用两个标签来说明:爱健身的吃货快乐的淘气包。

努力只为更好的你·2024-02-09 15:34

思路清奇SCI:15.ECM相关基因+gliomas(1.5分)

无意中发现一篇纯生信文章，虽然发表在神刊Medcine，但还是有一定参考价值的。

高大石头·2024-02-09 14:40

智慧校园：可视化大屏“织就”校园监测数据网。

首先，以智慧校园为背景，学校可以通过大屏来收集、整合、分析和应用各种类型的数据，覆盖教学、管理、服务等多个方面，例如学生信息、教师信息、课程信息、成绩、考试情况、课程表

千汇数据的老司机·2024-02-09 13:41

Day01--不，他没有正在输入

没想到加入生信星球学习第1天的作业就是，索性以此为契机探索一下，顺便完成作业。

对方正在输入_9696·2024-02-09 12:20

（附源码）springboot社区养老医疗服务平台毕业设计 041148

社区养老医疗服务平台，主要的模块包括查看首页、站点内容（轮播图、公告栏）系统用户（管理员、普通用户）公共内容（交流中心、交流中心分类、活动资讯、活动分类）模块管理（医生信息、药品信息、预约信息、健康档案

WeiXin_DZbishe·2024-02-09 08:39

生信学习小组Day2-康康

学习内容1.Linux是什么？1.1Linux是操作系统，与Windows和Mac一样1.2Linux是一个服务器，支持很多用户同时使用，且互不干扰2.云服务器上的Linux操作系统的使用2.1安装：Putty软件https://www.chiark.greenend.org.uk/~sgtatham/putty/latest.html2.2登录：通过Putty软件远程登录服务器2.3操作：一些高

康康_0142·2024-02-09 07:25

8.4分非肿瘤生信，免疫浸润+机器学习+动物模型验证。可谓是非肿瘤生信结合实验验证的范文，值得收藏！

影响因子：8.44研究背景：冠状动脉疾病(CAD)仍是全球主要死亡原因之一。动脉粥样硬化病变通常导致进行性冠脉狭窄、心肌缺血、坏死，最终累积急性心血管综合征(ACS)的风险。外周生物标记物是监测冠状动脉疾病(CAD)进展的越来越重要的非侵入性方法。近年来的证据表明，免疫紊乱在CAD病理过程的启动和发展中起着决定性作用。研究结果：一、外周血中差异mRNA表达的鉴别1、本研究中一共有199例CAD患者

生信小课堂·2024-02-09 06:48

两会有委员建议延长公务员考试年龄

两会正在热火朝天的开展着，今天很多会员都提出了许多不少的建议：如取消中小学英语的主科地位、开婚前辅导班、建议取消学生信用卡使用权、延长公务员考试年限等等。

白开水_e0cd·2024-02-09 06:04

R语言中,cbind和rbind区别

cbind：根据列进行合并，即叠加所有列，m列的矩阵与n列的矩阵cbind()最后变成m+n列，合并前提：cbind(a,c)中矩阵a、c的行数必需相符rbind：根据行进行合并，就是行的叠加，m行的矩阵与n行的矩阵rbind()最后变成m+n行，合并前提：rbind(a,c)中矩阵a、c的列数必需相符————————————————Rversion3.6.2(2019-12-12)--"Dark

Seurat_·2024-02-09 06:55

R语言rmarkdown使用

1、安装install.packages('rmarkdown')library(rmarkdown)install.packages('tinytex')tinytex::install_tinytex()2、新建RMarkdown3、基本框架红色框内为YAML：包括标题、作者和日期等黄色框内为代码块：执行后面的代码，并可以设置展示的结果。蓝色框内为Markdown文本4、运行代码产出结果5、导

weixin_49320263·2024-02-09 05:50

由内而外释放R的力量||摘自《R大数据分析实用指南》

数据必须读入内存R核心是单线程的R是一种解释语言使用ff和ffbase超越内存限制主要用于大数据的转换聚合与建模：深入ffandffbaseR语言操作my

周运来就是我·2024-02-09 05:37

原来启发是这么来的

陌生信息：从外部接收到一个陌生信息，并且受到陌生信息的冲击。新感受：获得新的感受，或者是结论。罗胖的这种拆解也给我带来了启发。通常我们讲启发，其实是说的第三个要素，新感受，是最终的结果。有果必有因。

易门新思·2024-02-09 05:25

【C语言】学生管理系统

文章目录一、定义学生信息的结构体二、主函数逻辑三、添加学生信息四、删除学生信息

paid星！亦舒！·2024-02-09 03:32

【day32】人生关键词

1.我在本讲中学到的点：1.1事不过三，项目太多了产生信息干扰，显得冗余。

武小茉·2024-02-09 02:29

人生第一篇生信SCI一作被导师抢了是一种什么样的体验？

最近有小伙伴就吐槽自己人生第一篇生信SCI一作被导师抢走了，自己作为共同第一作者排在第二位，总是担心会影响以后找工作，整天闷闷不乐的。目前的确有的导师

SCI狂人团队·2024-02-09 01:56

力扣 (LeetCode)-最大子序和,JavaScript数据结构与算法（数组）

Github来源：力扣(LeetCode)｜刷题打卡|求星星✨|给个❤️关注，❤️点赞，❤️鼓励一下作者[已开启]任务一：刷题打卡*10篇大家好，我是魔王哪吒，很高兴认识你~~哪吒人生信条：如果你所学的东西处于喜欢才会有强大的动力支撑

掘金-我是哪吒·2024-02-08 23:57

生信星球day5学习笔记-齐晓鹏

1.向量image.png2.Rsudio练习2.1读取文件命令先要搞清楚默认的路径，要不然文件找不到。X<-read.csv('doudou.txt')#读取文件colnames(X)[1]<-"bioplanet"#给左上角某一空行赋予名字2.2改好的数据框的导出与保存我估摸着以后画群落网络图必须要操作这个步骤write.table(X,file="yu.txt",sep=",",quote=

齐晓鹏·2024-02-08 23:58

生信课程笔记4-序列算法补充

早期动态规划算法比较两个序列的相似性（similarities）。编辑距离（editdistance）加权编辑距离（weightededitdistance）和相似性评分（similarityscore）最优全局比对（optimalglobalalignment）：Needleman-Wunsch算法最优局部比对（optimallocalalignment）：Smith-Waterman算法Got

果蝇饲养员的生信笔记·2024-02-08 22:23

从列表中删除元素|自学生信Python（第十六天）

了解到生物信息学要有编程基础，尤其是要会一门编程语言，例如：R语言、Python、Perl等，还要熟悉Linux系统，作为生信小白，听说Python挺简单的，于是就自学了Python，花了两天时间了解了

天明豆豆·2024-02-08 22:40

r语言svr模型_使用R语言建立一个决策树回归模型

决策树是一种简单但使用广泛的分类算法，根据目标变量的类型，决策树分为分类决策树(目标变量为因子型)与回归决策树(目标变量为连续数值型)。在这里，我们使用R建议一个回归决策树模型。决策树简单介绍对于一个分类问题，我们可能需要多个属性值来构建问题，通过回答这些问题(比如长度大于多少，宽度大于多少，重量大于多少)，有序地得到问题的答案，并重复问题到我们得到最后的分类，把上面的过程(问题、答案)有组织的组

weixin_39849888·2024-02-08 20:22

《100个基本》读书笔记1

松浦弥太郎的人生信条，我觉得，我还是从中找几个自己没有想到的，或者，自己做的不到位的来提升自己吧。一切自己负责，指责他人无济于事。一切的起因都在于自己，说服自己的关键在于自己。

真爱521·2024-02-08 20:17

【R语言入门与数据分析-2】数据的读取与写入

使用过程中发现自己的R语言基础太差了，回头补课。P28-P33所学视频：https://www.bilibili.com/video/BV19x411X7C6?

森尼啊·2024-02-08 13:15

生信星球学习小组第129期Day6-爆爆

今天以dplyr为例学习R包，可怜我的小破电脑安装不了包，只能先将文字版本整理下来dplyr包是用于数据清理的高效R包，是tidyverse的核心包之一安装和加载R包设置镜像https://mp.weixin.qq.com/s/XvKb5FjAGM6gYsxTw3tcWwoptions("repos"=c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRA

爆不了米花·2024-02-08 11:21

mysql面试题

select*from购物信息（2）表名：成绩表姓名课程分数张三语文81张三数学75李四语文56李四数学90王五语文81王五数学100王五英语49……（其他用户实验的记录大家可自行插入）给出成绩全部合格的学生信息

kaiyue8899·2024-02-08 11:36

mybatis-plus使用apply进行字符串拆分后进行包含查询

，比如是uuid这类，但是啊，但是，条件不是一个字符串，而是多个字符串，总不能直接扔进去like吧，例如有个字段存了一个学生选修的课程，选修的课程可多个，这个时候要查询，想要查询选修了历史或者语文的学生信息出来

六月的北回归线·2024-02-08 09:44

推荐频道

生信R语言