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病历质控
FastQC
质控
报告解读
直接点击.html文件,即可在浏览器中查看
质控
结果报告。总览Summary首先是Summary,这一部分是整个报告的目录,整个报告分成若干个部分。合格会有绿色的对勾,警告是黄色感叹号,不合格是红叉。
林枫bioinfo
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2021-03-31 03:31
如何计算宏基因组测序数据中来自于人基因组的污染?
KneadData是一款宏基因组测序数据
质控
的软件,其主要功能包括使用Trimmomatic对序列过滤和bowtie2比对至宿主基因组去除宿主序列。
斗战胜佛oh
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2021-03-29 17:23
单细胞36计之28---单细胞转录组数据
质控
要则
在我们拿到单细胞数据之后,第一步往往是对数据的
质控
(QualityControl),或曰数据清洗(DataClean)。虽然在
Seurat_Satija
·
2021-03-24 10:10
SGS与李佳琦所属美腕公司达成战略合作,为直播电商提供品控服务
3月11日,“新条例下直播电商的化妆品
质控
合规研讨会”在上海举办。会上,SGS中国区总裁杜佳斌与美腕公司签署合作协议,由SGS为直播产品提供品控服务。
美通社
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2021-03-13 08:00
电子商务
微软
亚马逊
iot
jqgrid
日更第34天:考试倒计时62天
2.听课《妇产科》5一小时,妇产科63.读书《哲学的故事》1–10页4.练字一篇5.背诵消化系统66.背单词20个7.完成明天的病程记录及出院
病历
10份8.完成
寸言T
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2021-03-11 15:45
让我看你 看得更清
一对老夫妻从治疗室出来,在急匆匆川流的人群中,老妈妈左手按着右手手背上的棉球,老爸爸一只手搀扶着老妈妈,另一只手拎着满满当当的方便袋(方便袋里,有很多种药,有
病历
本,有水瓶,有纸巾)。
丙由甲桂花儿
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2021-03-11 14:09
2018-8-8晨间日记
今天是什么日子起床:7点就寝:23点40天气:火热心情:心怀期待满怀热情纪念日:2018.08.08任务清单昨日完成的任务,最重要的三件事:1.007作业提交2.
病历
书写3.适度锻炼改进:注意休息,睡前不打游戏习惯养成
刘洪君V
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2021-03-11 06:52
中年危机,离我们其实并不远
她拿着
病历
咨询了多个医院,上周终于做手术了,手术进行了8个小时,
P2P投资汇
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2021-03-11 06:41
多位大咖齐聚肿瘤血液科——与郑大一附院专家面对面
三位专家亲临病房查房、会诊、查看
病历
、指导靶区、参观放疗中心,详细查看病人,指导治疗,制定下一步治疗方案。石永刚教授详细询问病史,查看患者,阅读片子,讨论病情。
肿瘤血液科
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2021-03-10 21:05
《楚城》第十八章、围魏救赵
三个月来他了解了生产等各个部门的运作,也逐渐适应了公司的流程制度,这个获得过香港质量管理金奖的企业在品
质控
制等各方面都非常完备。陈捷所在的研发
七月楚城
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2021-03-10 11:36
李鬼和李逵
在准备给一个患者办理出院的时候,我的带教老师瞄了一眼这个病人在医院过去的
病历
,发现这个病人既往患有肝硬化,而且有多次消化道出血住院病史,还有脾
掌心画化雪
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2021-03-10 11:45
DamID-seq分析(三)
质控
分析:https://www.jianshu.com/p/e0bfa7b75ccbmapping:https://www.jianshu.com/writer#/notebooks/30869589
liu_ll
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2021-03-06 17:02
DamID-seq分析笔记(二)
第一步:https://www.jianshu.com/p/e0bfa7b75ccbQ:进行去接头及
质控
之后,接下来把readsmapping回基因组,这里我用的是Bowtie2,为什么选择用bowtie2
liu_ll
·
2021-03-06 17:50
最后一眼看您,我的母亲(原名《痛苦的回忆》)
这在我意料中,因为我偷看了母亲的
病历
,母亲不识字,任由他们糊弄,其实心里也是很清楚的,就是人们说的不治之症;也出乎我的意料,没有想到她老人家这么快就离开了人世。
雅迪希
·
2021-03-03 15:55
NGS reads去重知多少
在生信分析学习的初期,我们只需要跑通数据分析的整个流程即可,对于数据的
质控
和相应的参数没有深入探讨,但随着深入的学习,一些细节问题必须要注意(可能对结果造成非常大影响)。
Peter_iris
·
2021-03-02 10:08
健健康康无病无灾就是最大的幸运了
2019-04-29@银桑图片发自App姐姐是个保险从业人员,为了帮助客户核保,她从深圳到广州的医院帮客户打印
病历
。而姐夫担心怀有身孕的姐姐一个人过去会不安全,就派我陪她同去。
银桑Ishtar
·
2021-02-17 06:04
《自控力》总结
我要做,是前额灰
质控
制的,晚睡,分心,都会让你选择做更容易的事冥想5分钟,专注呼吸,可以增强早上列一个清单ch25分钟走走有助于恢复早睡,我不要:那些阻止你睡觉的事情
尼大玛
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2021-02-14 13:25
DNA甲基化数据分析全流程
2021-01-01更新简单记录一下平时的分析过程和RNA-seq前期流程类似--
质控
、去接头、比对参考基因组、排序后期就是要提取甲基化位点,包括CpG、CHG、CHH三种context,H代表非G位点
生信摆渡
·
2021-02-05 19:58
[实战1] Polycomb associates genome-wide with a specific RNA polymerase II variant, and regulates me...
sratoolkit--prefetch][得到fastq格式的测序数据----sratoolkitfastq-dump]fastq数据的质量控制----fastqc;trim_galore多参数比对以及
质控
shine_9457
·
2021-02-05 15:13
腰间盘突出 意外险免责
我心里咯噔一下,这快过年了客户还好吧严不严重去没去医院
病历
怎么写的…?一系列的专业问题一时间竟没了重点,心里那种幸好幸好买了意外险的小确幸却一直贯通始终,因为这份保单可以抵御一定程度的风险。
Tina_thanks
·
2021-02-04 08:30
基因组重测序分析干货
###一般从测序公司拿到的下级数据有rawdata,或者经过
质控
之后的cleandata,格式为fq。参考基因组及注释文件gff从网上下载。分析流程如尾图所示。
纤蹄马
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2021-01-25 11:12
PP历险记
坐在电脑前身着白大褂的大夫手握着
病历
报告,气定神闲地看着我说。“手术?”即使早已经做好了心理预期却还是一时间揪了心。脑补出唯一那次挺着大肚子躺在冰冷的条凳上满心忐忑地迎接新生命的到来。
时慧慧爱物
·
2021-01-23 07:12
疫情之下
还好这个小城里还没听说有确诊
病历
。那十九人都是乡镇的。只是潜在的危险仍然存在。昨天就有人说有的小区被封了,今天又有小区限制出行。公交还有下面的客车都停了。
雲朵
·
2021-01-16 04:02
医生的
病历
和女人的心,哪一样更难懂?
????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????AnnReadable?????????????????????????????????????????????????????????????????
健康界
·
2021-01-15 00:00
转录组测序2-测序数据
质控
RNAseq涉及到原始数据,数据
质控
,基因组比对,差异基因鉴定,差异基因功能富集分析,重要基因如转录因子激酶的靶基因预测等,我们用10讲的时间,全面讲解转录组测序报告,及在上百个项目中遇到的近百个常见问题
纪伟讲测序
·
2021-01-02 12:03
RNASeq
参考:https://tiramisutes.github.io/2018/12/04/ref-RNA-seq.html一、
质控
1.fastqcfastqcrawdata/*.fq.gz-ofastqc-t32.1trim_galoretrim_galore-q25
wanghaihua888
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2020-12-28 17:20
【转录组03】报错分析&数据
质控
和过滤
exit1是退出的意思忽视输入的报错,重定向在日志文件,不是报错【error】image.pngimage.png转录组分析总流程image.png数据
质控
背景知识数据量的统计方式image.pngsra
呆呱呱
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2020-12-15 17:40
微生物组数据学习笔记
人宿主约25000基因,人肠道菌约2-3million基因,species通常大于160种[1]流程:样本--数据--
质控
--分析扩增子(Markergene
曲凉不见
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2020-12-10 14:38
2020-12-8晨间日记
一边听网课一边写
病历
!先把框架结构搭建起来!细节再粘贴复制改一改,比如时间!修正添加!还有出与入,大与首!单子都先粘上,顺序先排上!模板这个东西一边用一边建不要特意去建特意去找,手头没有的就先搁着,
辽远的边疆
·
2020-12-08 22:44
Docker封装生物信息学lncRNA流程
一.流程介绍后续会开发lncRNA、smallRNA、circRNA流程首先是lncRNA流程,主要分析模块为:测序数据
质控
;序列比对分析;转录本组装;lncRNA分析;表达量分析;表达量差异分析;lncRNA
儒雅随和王小板
·
2020-12-08 15:30
基于区块链的医疗记录存储系统研究与开发
EMR(电子
病历
)记录了患者在医院治疗过程中产生的原始数据,已经普遍应用到各大医疗中心。但现有系统大都将数据保存在中央数据库中,这种中心化存储模式面临着信息安全、数据共享等问题。
QQ3447673281
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2020-11-26 20:35
区块链毕业设计
谁在外面说话
谁在外面说话我是一名小镇医院的疼痛科医师,一个人坐在一个宽敞明亮的办公室里埋头写
病历
。
一地萧瑟
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2020-11-26 07:52
分级诊疗、
病历
质控
、医保控费,隐私计算与医疗结合可以这么玩?
此前在新基建数据要素国家政策的指引下,大数据的应用范围和程度都在快速上升。顺应趋势,11月16日,第十四届创业周暨全球创业周中国站“数据价值如何流通?”隐私计算专题大会圆满落幕。大会以隐私安全计算下数据和计算的互联互通为切入点,探寻数据价值如何流通、如何保证数据流通中各方数据的安全等一系列问题。翼方健数联合行业内经验丰富的前辈们,对这一领域下的隐私计算问题进行了探讨。2020年风口犹在,数据价值流
算力智库
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2020-11-19 20:33
隐私计算
算力
利用 BERT 模型解析电子
病历
项目原始地址项目地址本项目改编自此Github项目,鸣谢作者。问题描述我们希望能从患者住院期间的临床记录来预测该患者未来30天内是否会再次入院,该预测可以辅助医生更好的选择治疗方案并对手术风险进行评估。在临床中治疗手段常见而预后情况难以控制管理的情况屡见不鲜。比如关节置换手术作为治疗老年骨性关节炎等疾病的最终方法在临床中取得了极大成功,但是与手术相关的并发症以及由此导致的再入院情况也并不少见。患者
Alfred_lv
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2020-11-13 11:56
机器学习
人工智能
自然语言处理
python
开启
他在地球待了5年,他的主治医生在睡梦中惊醒,凌晨2点要继续研究他的
病历
,
戴红霞
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2020-11-09 22:44
RNA-Seq数据分析流程
文章目录RNA-seq数据分析流程相关软件安装下载数据sra转fastq格式数据
质控
数据
质控
,过滤低质量reads,去接头比对首先下载参考基因组及注释文件,建立索引比对sam文件转bam为bam文件建立索引
高美玲
·
2020-11-03 13:43
生信学习
linux
生物信息学
RNAseq转录组分析流程:fastp+hisat2+samtools+featureCounts+DESeq2
使用工具fastp(
质控
),hisat2(比对),samtools(sam文件转bam文件),featureCounts(count计数),DESeq2(差异分析)环境配置使用conda配置环境,安装fastp
WuYankang
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2020-10-29 19:00
WGS分析笔记(1)—— 原始数据以及
质控
更新于2020.10.27二代测序方式分为三种:singleread单端测序paired-endread双端测序mate-pairread配对测序虽然有三种方式,但是大多数数据(包括本课题)为双端测序,至于三者之间的差别、优缺点以及适用场合可以自行搜索。接下来讲的内容都是基于双端测序的。测序仪原始下机的数据我们称为rawdata,二代测序是将DNA片段打断了再测的,每个测序片段我们称为read,质
十三而舍
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2020-10-27 19:12
二代测序组装
Step1:
质控
ReadQualityControl#了解数据,包括reads类型、reads数量、read质量、GC含量、可能的污染和其他问题#然后决定是否对数据进行去接头、去标签、过滤低质量序列操作
纵春水东流
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2020-10-21 12:48
爸爸的伤感 -
现在他知道了,原因是爸爸吃的药是美国进口的药品,在赤峰新城附属医院住院,户口所在地有特殊门诊报销,爸爸的病属于特殊门诊报销范围之内,所以爸爸去复印
病历
。其实爸爸是
大道至扑
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2020-10-11 14:42
D143
20171108【幸福三朵玫瑰】昨日3朵玫瑰1.早起✅2.阅读✅3.寻找课程今日3朵玫瑰1.早起2.阅读3.补
病历
【幸福实修60天目标】1.接纳父母,每天做父母臣服2.让自己柔软放松下来,关注时自己,每天半小时冥想
叶青丁当妈
·
2020-10-11 05:26
单细胞RNA系列专题之一:单细胞RNA测序中
质控
之重要细节 (下篇)
那么在做这些工作之前的
质控
,关乎到整个分析的成败。这篇文章我就继续给大家讲讲单细胞
质控
的那些事儿。单细胞分析整体流程我们先来简单了解一下整个单细
生信阿拉丁
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2020-10-10 21:30
医院就诊卡接口规范(业务:016)
二、输入参数交易码(见上表交易代码)交易日期交易时间操作员编号(终端编号)患者
病历
编号更正身份证号三、输出参数业务编号返回值:0成功,其他失败错误描述信息本次交易流水
曦航老袁
·
2020-10-10 19:33
孕产妇危急重症评审要求
1.休克2.凝血功能障碍3.心搏骤停4.先兆子痫5.子痫抽搐6.昏迷7.脑出血8.发绀9.少尿、无尿10.各位主管医生注意:对以上
病历
进行全科、全院、全区讨论,要求留下产检门诊
病历
附在出院
病历
后面。
梧桐山医生
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2020-10-10 16:44
QA与QC的区别
QC:QualityControl,品
质控
制,产品的质量检验,发现质量问题后的分析、改善和不合格品控制相关人员的总称。
oo水桶oo
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2020-10-10 16:21
【学习总结】产科12楼——每天迎接新生命
整洁明亮产科12楼温馨舒适的病房早上7:30,产科护士们早已穿戴整齐在岗位上忙碌着,晨间护理,整理
病历
资料
湖南省直中医院健康管理中心
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2020-10-10 12:54
现在想来还是会笑不成声
“你确定你们都知道怎么写
病历
表吗”“知道”“知道,好”“1712病房的刘先生是怎么得到子宫颈癌的?”噗哈哈哈哈(ಡωಡ)hiahiahia这刻,底下人的人笑成一片,还有电脑屏幕前的我。
今天你是否也和我一样
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2020-10-10 11:45
另一个我
此时是秋天的下午两点半,阳光正好微风轻柔的从窗户外吹进来,哗啦啦的卷起桌子上的
病历
单。医生手里的咖啡还没凑到嘴边,脸上的表情怔了一怔。“我真的没说谎。”女孩嘟起嘴巴,委屈的低着头。
寻盏灯
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2020-10-10 07:36
生命的三个层次
标签:恐惧、焦虑、贪婪、自私、愤怒、冷漠、羞愧、内疚、自责、悲伤、轻狂、傲慢、自以为是第二层开始了舍外求内,逐步脱离部分物
质控
制,有意识的选择放下一些,开始回归到身体本质层面,明白身体是修行的根
相逢一笑307
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2020-10-10 06:10
学习看病
八月底的时候再来,更新
病历
,准备病休。想到这就开心了。听了罗说的情况,她学校也有二十几岁、三十几岁……就病休的,看来,关键还是得找人。今天在学校举行全镇的“青年教师说课比赛”,我弃权了。
xi_2018
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2020-10-09 22:05
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