BioPerl

Bioperl的安装以及使用npm安装

2020-02-19首先登陆上bioperl官网https://metacpan.org/release/BioPerl注：以下都是在我的env下进行一、Bioperl安装1、进度对应模块儿（需要安装的东西

暮色下的烟波澜·2024-01-12 08:44

简单命令安装Bio::Perl模块

在网上搜了好几个教程下载安装Bioperl，结果一顿操作，全部失败，然后去bing上搜索英文教程，就找到一行命令，轻松解决链接：https://www.biostars.org/p/436784/cpanmBio

郝永超M1racle·2023-11-01 06:43

Bioperl安装

安装condainstall-cbiocondaperl-bioperl安装完成如果不能正常调用bioperl出现Can‘tlocateBio/Perl.pmin@INC等报错，则需要配置一下@INC。

bio_橡树·2023-02-01 07:17

在ProtParam 批量预测蛋白序列理化性质参数

此外直接用Bioperl写脚本也可以，Biopython不确定是否可以。

EZ·2022-02-03 09:51

BioPerl--SeqIO

Bio::SeqIO处理fasta和fastq文件(2012-07-0511:12:41)转载▼标签：bioperlseqio分类：BioinformaticsBioperl里提供的Bio::SeqIO包可以帮助我们很方便地处理fasta和fastq等文件。====================Fasta格式====================>ago18rsv3_1119439||21TC

海骆驼·2020-08-18 03:45

windows系统中安装perl模块（package）的几种方法

虽然以前有装过bioperl，但没什么感觉，也不知道是怎么搞的就装起来了，可装SpreadsheetParseExce和SpreadsheetWriteExcel就没那么好运了，网上找

jiuyizhizhu·2020-07-16 01:42

安装Bioperl最基本模块Bio::SeqIO

Bioperl就像个大柜子，里面存放各种模块。Bio::SeqIO是Bioperl最基本的模块，本文介绍其在CentOS7-64bit下的安装方法。

zhanyongjia_cnu·2020-07-12 19:39

根据id提取fasta序列

Perl脚本练习bioperl读入写出fasta要求根据序列ID，从fasta文件中提取目标序列并输出数据序列IDfasta文件思路以序列ID为键，构建哈希用bioperl读入fasta，获得序列id如果

ruby912·2020-07-11 22:08

Bioperl的安装（一）

bioperl就是相当于一个大柜子，里面有各种关于生物信息分析的perl脚本，功能非常强大。但是由于不是一个安装包，可以一键安装，所以安装的过程有点点麻烦。

高锦-生信·2020-07-11 07:47

生物信息神奇网站系列（十七）：Bioconductor Workflows

bioconductor是R语言一种重要的项目，是专门利用R处理生物数据，类似于biopython与bioperl等，不过Bioconductor功能更加强大，不只是辅助处理一些生物数据。

基因学苑·2020-01-05 12:40

使用pfam-scan进行预测

condacreate-npfam_scan##可新建一个环境，用于安装pfam-scan$sourceactivatepfam_scan$condainstallpfam_scanpfam_scan依赖bioperl

鬼面行者·2019-12-16 08:56

Bio::DB::GenBank, Bio::SeqIO

bioperl(http://bioperl.org/)模块使用--生物信息学中用的模块功能：根据核酸的gi号自动从GenBank中提取FASTA格式的序列，可以多序列提取。#!

twc829·2016-05-24 16:00

去掉特定长度的短序列&取motif上下游一定长度的序列

上下游一定长度的序列（含motif）假如我要取每个序列中motif为“AAAA”及其上下游10个碱基的序列片段，并输出位置信息，请问如何编程处理第一个问题，除去 < 50 bp 的序列，可以直接用 bioperl

·2015-11-12 19:34

如何检查BioPerl是否正确安装

检验是否安装了bioperl的两

·2015-03-31 18:00

Beijing Perl Workshop 2009

聚会全程听下来，非常的开阔视野，在perl的世界也有像mason这样的web框架，号称是perl中的php,也有关于基于perl的信息抽取，专利搜索相关的专题，还有关于基于bioperl的lightingtalk

·2009-09-22 12:00

BioJava安装入门

和生物信息学沾边的编程语言浩如烟海，BioPHP、BioJava、BioPerl、BioPython、BioRuby等等……据Bioinformatics.org上最新的投票显示（http://www.bioinformatics.org

阿浊I·2009-04-23 09:00

601 Daily Scrum - Tim

601DailyScrum-Tim昨晚熬夜到3点半，加上今天一个白天，终于昨晚了bioperl的程序做完了这边的LegacyAnalysis还没动，小组卡在我这里了组委会的需求又变更了，看来需求变更就像税收和死亡一样是不可避免的

BlackStone SOA Group·2006-06-02 01:00

Bioperl简介

Bioperl简介 Bioperl最近已经到了1.0版,先说bioperl.org,该组织正式成立于1995年,在此之前已经作为非正式的团体存在那很多年,现在他已经形成了一个国际性的开发者的协会

Python, Java, Life, etc·2005-02-18 06:00

推荐频道