Blas

Windows本地化运行NCBI blast+

一、软件安装：下载软件包https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/安装选择指定的路径，如本人的C:\software\NCBI
谢俊飞·2022-08-08 21:20

TensorFlow 中的 Conv2DOp

TensorFlow中的2D卷积主要依赖外部库，如cuDNN、cuBLAS、ROCm和hfp/libxsmm，仅DeepConv2D为源码实现。
图波列夫·2022-08-06 07:35

1.cuBLAS开发指南中文版--简介

cuBLAS开发指南中文版cuBLAS的API参考指南，CUDA基本线性代数子程序库(CUDABasicLinearAlgebraSubroutine)。
扫地的小何尚·2022-08-05 20:56

安装mlxtend_无法pip安装scipy、mlxtend和数学库

当我尝试pipinstallscipy和mlxtend时，会出现以下错误：NotFoundError:nolapack/blasresourcesfound当我尝试安装math时，会出现以下错误：UsingcachedMath
Jeffrey Zhuang·2022-08-02 07:04

MPI学习笔记（二）：矩阵相乘的两种实现方法

mpi矩阵乘法（C=αAB+βC）最近领导让把之前安装的软件lapack、blas里的dgemm运算提取出来独立作为一套程序，然后把这段程序改为并行的，并测试一下进程规模扩展到128时的并行效率。
惊小呆520·2022-07-25 20:00

python 服务器批处理得到PSSM矩阵的问题

目录1.在linux上安装psiblast2.下载并编译用于比对的大型蛋白质数据库3.获取PSSM矩阵1）单条蛋白质序列的处理方法2）批处理获取的方法参考文献：1.在linux上安装psiblast最好新建一个
·2022-07-21 14:23

m在VBLAST协作MIMO系统分部使用LDPC,Turbo,卷积三种信道编译码进行误码率matlab仿真

目录1.算法描述2.部分程序3.部分仿真图预览4.源码获取方式1.算法描述从上面的结构可知，整个卷积编码的结构可由CRC校验，卷积编码，打孔组成，其中打孔的作用就是讲卷积编码后的码率变为所需要的码率进行发送。这里，我们采用如下的数据帧方式进行：首先，每次发送的数据长度为：221，进行CRC校验之后为253，然后通过卷积编码之后的长度为512，注意，这里对于213卷积编码，需要将编码前的数据自动加3
我爱C编程·2022-07-16 20:02

SCENIC-转录因子分析

在做分析之前你应该看一下这篇文献，看看别人做了什么scenic分析《Single-cellRNAsequencinghighlightstheroleofinflammatorycancer-associatedfibroblastsinbladderurothelialcarcinoma
汪汪队队长_莱德·2022-07-08 09:18

CUDA学习（十三）cublas学习

cublas是cuda的一个线性代数库，cublas_api.h声明了关于线性代数的函数，自己边看边记录一下，以备以后用简单总结一下：cublas只是简单的矩阵运算，只有几个函数涉及的解方程的内容，有一个地方提到了
zhouzhouasishuijiao·2022-06-18 15:52

最新CUDA环境配置(Win10 + CUDA 11.6 + VS2019)

.1.前言本篇文章的软件环境为:Windows10CUDA11.6VS2019CUDA是目前做人工智能,深度学习等方向的必备工具库.由CUDA衍生出的加速工具很多,如:cuDNN,TensorRT,cuBLAS
扫地的小何尚·2022-06-12 07:37

微软将通过Windows Update提供新的杀毒软件

微软公司6日宣布,将通过WindowsUpdate免费提供杀毒软件MaliciousSoftwareRemovalTool,11日正式开始.目前为止,微软已经免费提供了针对Blaster,Mydoom,
stiwin·2022-06-10 12:16

电子时代的烦恼

1.SoundBlaster前段时
悠悠小新·2022-06-02 00:53

物种内共线性分析——思路以及踩坑总结（二）

物种内共线性分析(MCScanX+BLAST+TBtools)数据要求：做物种内共线性分析的话主要需要的是全基因组序列、cds或pep序列、gff3/gtf序列三者缺一不可。
生信技术·2022-05-28 01:23

2022-05-24如何设计QPCR引物

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/第一步：准备所要设计引物的基因序列第二步：打开blastn选项图片.png图片.png图片.png第三步：找到自己研究的物种，点击序列所属的accession
麦冬花儿·2022-05-25 10:00

CentOS7 单节点和多节点 HPL测试

前置工作：安装OpenBLAS;安装Mpich(可参考首页博客)官网下载压缩包到/opt目录cd/opt&&wgethttps://www.netlib.org/benchmark/hpl/hpl-2.3
InaRwi·2022-05-22 10:00

python ctm 关联主题模型_玩转python主题模型程序库gensim

其中scipy还需要安装BLAS和LAPACK这2个包，所以说依赖的库非常
weixin_39731456·2022-05-21 07:19

[译文] 为什么GEMM是深度学习的核心 | Why GEMM is at the heart of deep learning

它是BLAS（基本线性代数子程序）库的一部分，该库最早创建于1979年，在我开始尝试优化神经网络之前，我从未听说过它。
NoNNus·2022-05-17 11:03

nvidia驱动卸载与安装

完全卸载驱动：sudoapt-get--purgeremovenvidia*sudoaptautoremoveToremoveCUDAToolkit:sudoapt-get--purgeremove"*cublas
庄王·2022-05-15 07:55

全面的基因组特征定义了人类胶质母细胞瘤基因和核心通路

这次分享的是来自癌症基因组图谱计划(TCGA)研究网络在2008年发表在nature(IF:49.962,2020)上的文章Comprehensivegenomiccharacterizationdefineshumanglioblastomagenesandcorepathways
亦是旅人呐·2022-05-10 16:55

利用r语言实现DNA双序列全局比对（Needleman-wunsch算法)

序列比对实验报告一．实验内容1.利用序列比对线上工具做序列比较2.Blast线上工具使用3.使用r语言实现Needleman-Wunsch算法二．实验目的1.掌握序列比对线上工具使用2.掌握双序列比对算法
七禾叶瓣·2022-05-09 00:23

ubuntu彻底卸载Nvidia显卡驱动

卸载显卡驱动1.执行卸载sudoapt-get--purgeremovenvidia*sudoaptautoremove2.如果也要卸载CUDA：sudoapt-get--purgeremove"*cublas
普通网友·2022-05-05 07:33

spark MLlib机器学习算法库

其中底层基础包括spark的运行库、矩阵库、和向量库，向量接口和矩阵接口是基于Netlib和BLAS/LAPACK开发的线性代数库Breeze;算法库包括分类、回归、聚类、
eyexin2018·2022-05-05 07:07

Day7_测序知识

测序过程和原理测序原理：一代测序（Sanger测序）：（1）目前一代测序在验证序列（就是平时送公司测序返回来自己blast的那些）以及验证基因组组装完整性方面都是金标准。
萱_1014·2022-05-03 16:18

OSError: libcudart.so.9.0: cannot open shared object file: No such file or directory

发现此时运行程序还是报一样的错误，则进行步骤二步骤二：检查/usr/local/cuda-9.0/lib64下是否有libcublas.so.9.0如果有，终端输入:sudoldc
HeyMrYu·2022-04-30 07:16

dlopen和 dlsym的使用方式

考虑以下情况，比如我们要用cublas这个库的sgemm函数。#include"cublas.h"intmain(){cublas::Mata,b;cublas::sgemm(a,b);}我
s.feng·2022-04-23 21:04

cublasSgemmBatched使用说明

背景在GPU进行计算的时候，很多时候都需要利用cublas的API,常用的API有两个：cublasSgemm和cublasSgemmBatched,使用过MKL的可能觉得很熟悉，连参数都是一样的，但是这里有一比较坑的地方是
s.feng·2022-04-23 21:04

cuBLAS矩阵乘法

cuBLAS是cuda封装好的一个数学库，头文件为，其中的矩阵乘法函数是我们做深度学习绕不开的函数，下面是一个常用的函数，后面又有扩展，但是核心函数使用逻辑一样。
s.feng·2022-04-23 21:03

MKL库矩阵乘法

此示例是利用Intel的MKL库函数计算矩阵的乘法，目标为：\(C=\alpha*A*B+\beta*C\)，由函数cblas_dgemm实现；其中$A$为$m\timesk$维矩阵，$B$为$k\timesn
GeoFXR·2022-04-21 18:00

Win10 编译运行Fortran77程序，开发环境搭建

有个朋友说我讲的blas中的fortran语法有个地方不正确，非说他自己的理解是对的——怎么肯能，f77都看了十几年了。
Eloudy·2022-04-19 12:25

Molecular Cell | 增强子RNA通过影响染色质环结构来调控脑胶质瘤的发生

恶性脑胶质瘤是成年和儿童群体脑部的主要肿瘤之一，患有胶质母细胞瘤（glioblastoma，GBM）（恶性脑胶质瘤的主要类型）的病人的生存周期一般不会超过15个月。
Biogive·2022-04-14 10:21

Rb(redis blaster)，一个为 redis 实现 non-replicated 分片的 python 库

Rb，redisblaster，是一个为redis实现非复制分片(non-replicatedsharding)的库。
为少·2022-04-07 10:00

Rb(redis blaster)，一个为 redis 实现 non-replicated 分片的 python 库

Rb，redisblaster，是一个为redis实现非复制分片(non-replicatedsharding)的库。
为少·2022-04-07 10:00

NUMPY 在不同平台上（AMD/INTEL）以及使用不同 BLAS 库的速度测试

在amd平台下，使用condainstallnumpy会默认安装numpy+openblas。
luohaha66·2022-03-28 15:16

C语言中dlopen和dlsym的使用方式详解

考虑以下情况，比如我们要用cublas这个库的sgemm函数。#include"cublas.h"intmain(){cublas::Mata,b;cubl
·2022-03-27 13:46

quartus找不到硬件USB-blaster及驱动无法安装，解决方法

quartus找不到硬件USB-blaster及驱动无法安装，解决方法Windows无法安装USB-Blaster解决办法：1、进入，计算机–>>设备管理器。
一只大喵咪·2022-03-19 06:08

Android 12(S) 图形显示系统 - BufferQueue/BLASTBufferQueue之初识（六）

题外话你有没有听见，心里有一声咆哮，那一声咆哮，它好像在说：我就是要从后面追上去！写文章真的好痛苦，特别是自己对这方面的知识也一知半解就更加痛苦了。这已经是这个系列的第六篇了，很多次都想放弃了，但最终还是坚持下来了，因为我真的好像搞懂这一块。1前言前面一篇文章中，我们已经介绍了createSurface的流程，也在SurfaceFlinger中去创建了图层layer，但一直没有看到bufferqu
二的次方·2022-03-15 13:00

BlastBufferQueue 原理解读

一、重点API功能介绍Google针对新的同步机制，在BBQ对象JAVA层面设计了一系列功能接口，列举功能更新较大几个接口：setNextTransaction(@NullableSurfaceControl.Transactiont)提供用于下一次缓冲区要更新的事务。BBQ不会立即提交此事务，通过该接口将下一帧的提交控制在调用者手中，调用者可以将其用于更高级别的同步。mergeWithNextT
大天使之剑·2022-03-10 22:21

10X单细胞空间（RNA、ATAC、Spatial）联合分析剖析类风湿关节炎中炎症相关滑膜成纤维细胞的异质性及其驱动因素

只好在时间的道路留下一些标记，回头看时，知道自己曾经来过今天又是单细胞空间占据身心的一天，分享的文献在HeterogeneityofInflammation-associatedSynovialFibroblastsinRheumatoidArthritisandItsDrivers
单细胞空间交响乐·2022-03-04 11:48

基因家族的鉴定-基于windows系统上的本地blast

基因家族的鉴定-基于windows系统上的本地blast基因组的序列提取，详情请看我之前的教程https://www.jianshu.com/p/211a262aebc4下面讲如何在windows系统上用
啊辉的科研·2022-03-02 10:09

MShadow中的表达式模板

表达式模板是Eigen、GSL和boost.uBLAS等高性能C++矩阵库的核心技术。本文基于MXNet给出的教程文档来阐述MXNet所依赖的高性能矩阵库MShadow背后的原理。
shuo-ouyang·2022-02-27 19:00

听说你还在用viroBlast搭建本地Blast网站？快换成美美哒SequenceServer！

写在前面刚开始整数据库的时候，用过viroBlast搭建Blast服务，详见用viroblast搭建本地blast网站-(jianshu.com)最近之前的数据库课题准备收收尾整出去，完善相关功能的时候
老饕_Ljw·2022-02-23 21:55

chrome 使用gpu 加速_DLI每周一课|用CUDA C的GPU加速库加速应用程序（新人有礼）

您将完成三个练习，包括如何：使用cuBLAS加速基本矩阵乘法通过向先前的cuBLAS调
weixin_39535701·2022-02-23 07:14

CUDA加速计算的基础C/C++

CUDA可以毫不费力地大幅加速应用程序，具有适用于DNN、BLAS、图形分析和FFT等更多运算的高度优化库生态系统，
帝王铠·2022-02-23 07:41

增生性类风湿关节炎的滑膜成纤维细胞如何抗住ferroptosis？

我是小燕同学，今天为大家分享一篇关于“TNF拮抗剂促使CIA小鼠滑膜成纤维细胞对ferroptosis敏感”研究的文章，题目为“TNFantagonistsensitizessynovialfibroblaststoferroptoticcelldeathincollagen-inducedarthritismousemodels
爱笑的女孩儿·2022-02-21 18:35

灾难新闻 7-1

1.TwelvepeopledieincoalmineblastinNWChina2.Report:BlastincoalmineinTurkey3.Eveninearthquake-readyJapan
江南_fyjk·2022-02-19 17:06

BUG|CUBLAS_STATUS_NOT_INITIALIZED

问题：TensorFlowdevice(/device:GPU:0)->(device:0,name:GeForceGTX1080Ti,pcibusid:0000:02:00.0,computecapability:6.1)2017-12-1210:06:06.255762:Itensorflow/core/common_runtime/gpu/gpu_device.cc:1152]Creatin
Brlat·2022-02-19 12:59

子宫内膜癌circRNA数据分析（重分析）

3·DESeq2用于差异表达分析4·BlastN用于比较在线数据库（circbase）上的信息以获得保守或者新鉴定circRNA5·Targetscans用于
547可是贼帅的547·2022-02-17 18:03

如何鉴赏 西班牙画家、雕塑家 巴勃罗·鲁伊斯·毕加索 的画稿(立体画派创始人)

（教名：PabloDiegoJoséFranciscodePaulaJuanNepomucenoMaríadelosRemediosCiprianodelaSantísimaTrinidadClitoBlascoyPicassoLópez
加刘景长·2022-02-16 00:24

文献阅读专题

IntegrativeanalysisofgeneexpressionandDNAmethylationthroughone‐classlogisticregressionmachinelearningidentifiesstemnessfeaturesinmedulloblastoma
Bio_Learner·2022-02-14 20:13

Windows版Tensorflow显存不足解决方案 (2017-07-23 00:24:27)

在Windows版Tensorflow运行的时候提示错误：failedtocreatecublashandle:CUBLAS_STATUS_ALLOC_FAILED在官方Github上找到一个解决方案创建
沧海一声笑的DIY宇宙·2022-02-14 19:25
上一页 12 13 14 15 16 17 18 19 下一页
按字母分类： ABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVWXYZ其他