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LUNA16
【3D 图像分割】基于 Pytorch 的 VNet 3D 图像分割6(数据预处理)
由于之前哔站作者整理的
LUNA16
数据处理方式过于的繁琐,于是,本文就对
LUNA16
数据做一个新的整理,最终得到的数据和形式是差不多的。但是,主要不同的是代码逻辑比较的简单,便于理解。
钱多多先森
·
2023-10-31 20:14
人工智能(AI)医学影像
pytorch
人工智能
计算机视觉
VNET
LUNA
LIDC-IDRI
肺结节3D图像分割-VNet(一)
1、
LUNA16
数据集1.1Luna16数据集介绍简介:来自于公开的LIDC/IDRI数据集。该数据集剔除了LIDC/IDRI数据集中切片厚度大于2.5mm的扫描数据,共产生了888套CT。
繁星_993
·
2023-10-31 08:49
肺结节
3d
计算机视觉
深度学习
LUNA16
调查报告
1.开发计算机算法去优化肺癌筛查的紧迫性肺癌是全球癌症相关死亡的主要原因.美国已在肺癌高危人群实行低剂量CT扫描式的肺癌筛查,预计其他的国家也会这样做.在CT肺癌筛查时,数百万的CT扫描将被分析,这个对放射科医生来说是一个巨大的负担.因此开发计算机算法来优化筛选是很有意义的.2.肺结节检测在肺癌筛查中站着重要地位在用CT扫描去做肺癌筛查分析时,肺结节检测是重要的第一步,这可能代表或可能不代表早期肺
一入DL深如海
·
2023-10-26 04:28
Deep Learning With Pytorch - 数据预处理,以导入
LUNA16
数据集为例
导入大型数据集并不是一份轻松的工作在JupyterNotebook中导入
LUNA16
数据集导入可能用到的第三方库:
LUNA16
存放路径:用pandas读取candidates.csv;读取annotations.csv
鹅毛在路上了
·
2023-08-29 16:17
#
ML/DL
深度学习
pytorch
人工智能
nnDetection复现
Luna16
附模型
前提概要:淘论文发现nnDetection框架对肺结节的检测效果挺好,便跑了跑复现了下,作者诚不欺人,确实挺好,并附上我依据文档训练的模型。复现步骤:1.安装cuda11.4,cudnn8.2.42.创建虚拟环境condacreate-npy38python=3.83.安装pytorchpipinstalltorchtorchvisiontorchaudio--extra-index-urlhtt
贰の⑩次方
·
2023-02-02 09:27
nnDetection
python
人工智能
[自用,未完待续]图像分割网络之mask-rcnn的基础知识汇总
我从一个项目了解到了maskrcnn,后期又将其运用到了医学肺部图像
LUNA16
中。感谢各位大佬的文章与想法(以下链接标注了文章来源及作者),也欢迎大家也与我在CSDN上交流。
RENeast
·
2023-01-10 16:13
python
人工智能
python
深度学习
V-net实例-数据处理
https://github.com/menjingru/vnetb站链接:https://b23.tv/dgFY3TY数据描述记录肺结节类3D数据处理数据集:LUNA16+对应的一个模板数据观察数据:
LUNA16
Linaaa~
·
2022-12-29 00:38
v-net
python
开发语言
肺实质分割
1、自适应阈值分割实验用图源自
LUNA16
数据集,首先对原始图像采用自适应阈值分割。原理就不细讲了,比较简单。
风潇子
·
2022-12-26 16:23
科研狗的日常之肺结节分割
python
opencv
计算机视觉
Deeplung代码复现(二)
Luna16
数据集一共subset0-subset9十个子集,使用9个
fighting_!
·
2022-11-27 23:32
医学图像
python
深度学习(代码)
深度学习
python
实战:使用Faster R-CNN完成肺结节检测(
LUNA16
)(1)/
LUNA16
数据集初探
官方网站比赛共分为两个部分结节区域检测:确定每个疑似结节的区域,并给他们一个概率值假阳性减少:对提取出的区域进行分类,类别为是或者不是一个真实结节
LUNA16
数据集数据集的由来
LUNA16
由LIDC-IDRI
黑夜里游荡
·
2022-11-27 23:58
深度学习
计算机视觉
机器学习
pytorch
深度学习
LUNA16
结节可视化及世界(CT)坐标与体素(图像)坐标的转换
这个是关于DCM的医学坐标系的一些背景知识,本文将在此基础上做些补充。DICOM医学图像读取涉及到的医学坐标体系_sunyao_123的博客-CSDN博客_dicom坐标系关于坐标名称,看了许多博文,有像素坐标,真实坐标,体素坐标,图像坐标,世界坐标搞得一头雾水。本文中CT坐标指的是设备拍摄时的坐标,单位为mm。图像坐标指的是转化为numpy后的坐标,单位为单位1。自己的理解世界坐标应该是CT坐标
CHENxiaoni_
·
2022-11-27 23:22
python
python
开发语言
CT影像中肺结节自动检测算法的验证、比较和组合:The
LUNA16
challenge
因此,我们建立了
LUNA16
挑战赛,这是一个使用最大的公开可用的胸部CT扫描参考数据库LIDC-IDRI数据集的自动结节检测算法的客观评估框架。在LUNA1
镜中隐
·
2022-11-03 14:57
大数据
二、肺癌检测-LUNA数据集下载和介绍
一、数据集下载step1:登陆
LUNA16
官网,链接为:Home-GrandChallengestep2:点击网站左侧【download】,进入下载页面。
wxyczhyza
·
2022-11-03 14:37
#
肺癌检测
人工智能
LUNA数据集
Candidate Generation and
LUNA16
preprocessing
在这个kernel中,我们将讨论有助于更好地理解问题陈述和数据可视化的方法。我还将提供有用的资源和信息的链接。此脚本是用Python编写的。我建议人们在桌面上安装anaconda,因为here提到了它的优点。本教程中用于读取,处理和可视化数据的库是matplotlib,numpy,skimage和pydicom.。图像大小(z,512,512),其中z是CT扫描中的切片数量,取决于扫描仪的分辨率。
weixin_33969116
·
2022-09-08 04:43
人工智能
python
数据结构与算法
[毕设自用]图像分割之肺部肺结节医学影像数据集
LUNA16
的基础知识汇总
我的毕业设计是用深度学习方法处理
LUNA16
,实现肺结节的分割。感谢各位大佬的文章与想法(以下链接标注了文章来源及作者),也欢迎大家也与我在CSDN上交流。
RENeast
·
2022-06-09 07:37
python
人工智能
python
平安科技
LUNA16
冠军方法解析
数据预处理。作者对肺区进行预处理得到128*128*128的立方体,然后使用多尺度策略,生成两个尺寸的小立方体:36*48*48和20*36*36。从整个肺部区域收集小立方体,进入两个分类网络,获得不同的结节视野大小来预测整体结果。针对正负样本不平衡的问题,将正样本进行数据增强,从三个维度进行90度、180度、270度的翻转。网络。作者采用了三维的FPN(特征金字塔网络),FPN是何凯明团队17年
Carrie_Hou
·
2022-02-06 18:00
LUNA 2016 数据集详解
LUNA2016数据集详解
LUNA16
数据集的由来LUNA2016数据集来自2016年LUngNoduleAnalysis比赛,这里是其官方网站。
zsddragon
·
2020-08-26 16:19
肺结节检测
利用DSB2017冠军开源代码为
LUNA16
生成mask
代码地址:https://github.com/lfz/DSB2017先展示下生成的mask与真实masksubset9subset8subset7subset6subset5subset4subset3subset2subset1上面的图片是从subset1~subset9中随机选取的切片,左边为生成的mask,右边为groundtruth,效果相当不错,不过仍有瑕疵,比如说subset3的ma
weixin_30266885
·
2020-08-26 14:37
DSB2017第一名代码尝试运行(记录自用)(二)
1.将天池数据也像
luna16
数据一样预处理成clean.npy以及label.npy。2.调整路径,并把数据随机分成3部分1088个ct,300个ct,300个ct。
镜中隐
·
2020-08-26 13:09
深度学习
关于医疗影像的mhd和dcm格式图像的读取和坐标转换
本篇博客主要对近年来大赛(
Luna16
,kaggle,天池)中使用的肺部图像的读取和坐标转换进行整理,如果有错误,欢迎批评指正,谢谢。
zyc2017
·
2020-08-17 18:04
医疗图像
全卷积神经网路【U-net项目实战】LUNA 2016 数据集详解
文章目录1.LUNA2016数据集详解2.mdh数据格式详解3.python读取mdh的方法4.annotations.csv坐标转换5.LUNA16数据集肺结节显示1.LUNA2016数据集详解
LUNA16
Li xiang007
·
2020-07-28 22:47
#
U-Net
DICOM医学图像读取涉及到的医学坐标体系
DICOM医学图像读取涉及到的医学坐标体系这篇博文简单介绍一下在处理
luna16
提供的医学图像中涉及到的关于坐标部分的知识,水平有限,只是个人理解,如果有误,还望多多指教。
sunyao_123
·
2020-07-13 14:12
DICOM医学图像
医学图像预处理
顺便说一句,
LUNA16
的数据已经处理成HU值,真是很人性化了。
K.SHI
·
2020-07-13 00:54
医学图像
基于深度学习的肺部CT影像识别——采用U-net、3D CNN、cGAN实现肺结节的检测(零)
文章目录写在前面背景及内容安排肺结节检测系列索引Reference写在前面本系列博客是我的部分本科毕业设计内容,基于
LUNA16
数据集[1]\color{#0000FF}{[1]}[1]对肺结节检测过程中的候选结节提取
liuz_notes
·
2020-07-09 08:02
目标检测
LUNA16
数据集肺结节显示亲测
ps主要是基于该博主https://home.cnblogs.com/u/wzyuan/feed/blog/2.html的
LUNA16
数据集系列上的亲测为更加小白的我一样。
镜中隐
·
2020-07-07 23:06
深度学习
实战:使用yolov3完成肺结节检测(
Luna16
数据集)及肺实质分割
实战:使用yolov3完成肺结节检测(
Luna16
数据集)yolov3是一个比较常用的端到端的目标检测深度学习模型,这里加以应用,实现肺结节检测。
NotFound1911
·
2020-07-07 20:18
自学
将自己的dcm数据制作成
LUNA16
数据集提供数据样式。
一个CT序列在
LUNA16
数据集主要是由一个mhd文件一个raw文件以及一个或多个csv文件(以一个为例不做那么多区分(3mm以下不做处理等))。
镜中隐
·
2020-07-05 06:48
深度学习
“智医助理”噱头>实用性?详解科大讯飞医疗新布局
在国际权威的肺结节检测大赛
LUNA16
中刷新世界纪录,真的代表科大讯飞在医学影像领域实现了“超车”吗?今天带您细看科大讯飞的医疗新布局。
52AI人工智能
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2020-06-29 19:24
kaggle肺癌预测挑战赛之Kernels评价排名第一的预处理教程(翻译)
幸运的是,我参加了
luna16
比赛并作为我的大学的计算机辅助诊断课程的一部分,所以我有一定的工作经验去处理这些文件。
一入DL深如海
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2020-02-25 16:26
Luna16
数据集
Luna16
数据集中结节的判定标准为四名放射科专家中至少有三名认定该结节半径大于3mm。因此在
一一|一一一亅
·
2019-05-07 08:13
关于SimpleITK
随着最近几大肺部图像处理相关的竞赛的推出,如
LUNA16
、KaggleDataScienceBowl,AI领域的科研人员对肺部CT图像变得越来越熟悉,尤其是DICOM序列,以及这些竞赛官方所提供的mhd
iamcfb_
·
2019-01-22 20:15
TianCHi/
LUNA16
/Kaggle lung cancer肺结节数据集特征比较
现在网上能够找到的关于肺结节的比赛有TianCHi/
LUNA16
/Kaggle这三家。三个网站论坛上都有很多关于肺结节识别与检测的源码。作为一名新手,我准备先大致了解这三个网站提供的数据的异同。
寻找如意
·
2018-04-13 11:21
深度学习
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