MMseqs2

MMseqs2蛋白质序列快速高效比对工具

先看仓库：soedinglab/MMseqs2:MMseqs2:ultrafastandsensitivesearchandclusteringsuite(github.com)无论哪个工具软件，无论你是否熟悉
小果运维·2023-12-03 06:32

Linux下安装Foldseek并从蛋白质的PDB结构中获取 3Di Token 和 3Di Embedding

0.说明：Foldseek是由韩国国立首尔大学(SeoulNationalUniversity)的MartinSteinegger(MMseqs2和Linclust的作者)开发的一款用于快速地从大型蛋白质结构数据库中检索相似结构蛋白质的工具
@ZyuanZhang·2023-11-22 07:15

Nat Methods｜一个快速搜索工具能让所有人都能进行蛋白质结构预测

ColabFold通过将MMseqs2的快速同源搜索与AlphaFold2或RoseTTAFold相结合，提供了蛋白质结构和复合物的加速预测。Cola
weixin_4528312·2023-08-24 05:04

PSP - 使用 MMseqs2 工具快速搜索蛋白质序列数据库 (GMGC)

欢迎关注我的CSDN：https://spike.blog.csdn.net/本文地址：https://spike.blog.csdn.net/article/details/131934642MMseq2是非常强大和高效的生物信息学软件，可以在极短的时间内对大规模的核苷酸和蛋白质序列进行搜索和聚类。主要特点有：使用一种新颖的序列比对算法，可以在保持高灵敏度的同时，大幅提高搜索速度。它可以比BLA
SpikeKing·2023-07-28 18:41

PSP - MMseqs2 编译最新版本源码 (14-7e284) 支持 MPI 功能 MSA 快速搜索

欢迎关注我的CSDN：https://spike.blog.csdn.net/本文地址：https://spike.blog.csdn.net/article/details/131966061MPI(MessagePassingInterface)是用于并行计算的标准化和可移植的消息传递接口，可以在分布式内存的多台计算机上运行并行程序。MPI标准定义一些库函数的语法和语义，这些函数对于编写可移植
SpikeKing·2023-07-28 18:40
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