Linux下安装Foldseek并从蛋白质的PDB结构中获取 3Di Token 和 3Di Embedding
0.说明:Foldseek是由韩国国立首尔大学(SeoulNationalUniversity)的MartinSteinegger(MMseqs2和Linclust的作者)开发的一款用于快速地从大型蛋白质结构数据库中检索相似结构蛋白质的工具,可以用于计算两个蛋白之间的结构相似性,可以用于蛋白质结构比对,也可以与MMseqs2和Linclust结合实现基于结构对蛋白质聚类。本文的目的在于利用Fold