OPLS-DA

生信学习笔记1：学习如何用OPLS-DA分析代谢组数据（从入门到掌握）

偏最小二乘法（PLS）和正交偏最小二乘法（OPLS）是统计模型，用于寻找两组数据矩阵之间的关系。它们广泛应用于化学计量学、生物信息学、经济预测等领域。偏最小二乘法（PLS）偏最小二乘法是一种多变量分析方法，主要用于找到两组数据（通常是预测变量集和响应变量集）之间的线性关系。在PLS模型中，从预测变量的数据集中提取出几个主成分（潜变量），并尝试使这些潜变量尽可能多地解释响应变量的方差。这使得PLS特
盲人骑瞎马5555·2024-02-01 12:18

在线作图丨数据降维方法③——正交偏最小二乘方判别分析（OPLS-DA）

OPLS-DA是在PLS-DA的基础上，进行了正交变换的矫正，可以滤除与分类信息无关的噪
维凡生物·2024-01-27 17:34

OPLS-DA的S-plot图可视化

OPLS-DA的S-plot图，横坐标表示主成分与代谢物的协方差，纵坐标表示主成分与代谢物的相关系数，越靠近右上角和左下角的代谢物表示其差异越显著，红色的点表明这些代谢物的VIP值大于等于1，蓝色的点表示这些代谢物的
kylin王国·2023-09-01 10:39

R实战 | OPLS-DA（正交偏最小二乘判别分析)筛选差异变量(VIP)及其可视化

而OPLS-DA（正交偏最小二乘判别分析）结合了正交信号和PLS-DA来筛选差异变量。本分析主要用于代谢组学中差异代谢物的筛选。
木舟笔记·2023-08-26 22:50

OPLS-DA分析

美格基因·干货学习｜一文读懂OPLS-DA分析-知乎(zhihu.com)官方教程ropls:PCA,PLS(-DA)andOPLS(-DA)formultivariateanalysisandfeatureselectionofomicsdata
Young.Dr·2023-06-14 23:39

个人博客文章合集

不定期更新链接：博客文章合集：data.table学习笔记ggplot2分面填充色与字体大小ggplot2画箭头ggplot2坡度图iTOL修饰进化树NMDS分析OPLS-DA在R语言中的实现PCA和PERMANOVA
研究僧小蓝哥·2023-04-15 19:52

R实战 | OPLS-DA（正交偏最小二乘判别分析)筛选差异变量(VIP)及其可视化

而OPLS-DA（正交偏最小二乘判别分析）结合了正交信号和PLS-DA来筛选差异变量。“本分析主要用于代谢组学中差异代谢物的筛选。
木舟笔记·2022-04-17 10:52

代谢组学精华汇总

代谢组学的介绍代谢组学那些事儿代谢组数据处理代谢组学数据分析的统计学方法综述典型机器学习算法在代谢组学数据分析中的应用和比较代谢组学数据处理非靶向代谢组学数据处理的基本流程代谢组学生物信息分析的那些事儿一文看懂主成分分析运用ROC曲线筛选生物标志物的策略关于筛选标记物筛选差异代谢产物通常基于OPLS-DA
FarmerJohn·2020-08-22 01:15

SIMCA的OPLS-DA相关

3.做三组之间的OPLS-DA时，3D图有的数据拟合出来的坐标是
WY_Share·2020-07-08 07:52
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