R语言学习日记

【机器学习与R语言】1-机器学习简介

1.基本概念机器学习：发明算法将数据转化为智能行为数据挖掘VS机器学习：前者侧重寻找有价值的信息，后者侧重执行已知的任务。后者是前者的先期准备过程：数据——>抽象化——>一般化。或者：收集数据——推理数据——归纳数据——发现规律抽象化：训练：用一个特定模型来拟合数据集的过程用方程来拟合观测的数据：观测现象——数据呈现——模型建立。通过不同的格式来把信息概念化一般化：一般化：将抽象化的知识转换成可用

苹果酱0567·2024-09-15 09:43

R语言标准普尔500指数Garch(1,1)模型

一、例3.3标准普尔500指数的月超额收益率，从1926年开始，共792个观察值，如图所示。记rt为超额收益率，rt的样本ACF和rt2的样本PACF。在间隔为1，3时有少许序列相关性，但主要特征是平方序列显示的强烈线性相关性。例题建立garch(1,1)模型的过程：（1）应用arma(p,q)模型消除数据的线性依赖（2）在arma(p,q)模型基础上，建立garch(1,1)模型（3）改进g

ronghuilin·2024-09-14 22:51

R 地图绘制-比例尺与指北针

ggplot绘制mapR语言可以进行数据分析，也可以进行地图绘制，而且非常简洁，快速。

jamesjin63·2024-09-14 21:30

学习小组Day4笔记--王英芳

R语言基础准备工作电脑用户名需要是英文R基础，Rstudio人性化界面资源Rfordatasciencechapter1下载RandRstudio给自己一个全新的R语言环境R是什么一种变成语言，统计计算和绘图的环境

一万万万万·2024-09-13 19:51

R语言基础笔记

起因:今天不知道要写什么。把之前的笔记复制一下。代码开头，导入:#清除系统变量rm(list=ls())#隐藏警告信息:options(warn=-1)#把当前目录，设置为工作目录。library(rstudioapi)current_folder_path0.0&ideology<10.0)分组聚合，类似groupby()df2<-aggregate(df1KaTeXparseerror:Exp

waterHBO·2024-09-13 15:38

R语言包AMORE安装报错问题以及RStudio与Rtools环境配置

在使用R语言进行AMORE安装时会遇到报错，这时候需要采用解决办法：'''AMORE包安装，需要离线官网下载安装包：Indexof/src/contrib/Archive/AMORE(r-project.org

卡卡_R-Python·2024-09-13 14:29

生态位宽度计算&可视化展示（R语言）

生态位宽度是指物种（或其它生物单位）在群落中所利用的各种不同资源的总和。物种的生态位越宽，该物种的特化程度就越小，倾向于泛化种（generalistspecies）；物种的生态位越窄，倾向于是一个特化种（specialistsspecies）。本篇所使用为生态位宽度指数即**Levins的生态位宽度指数。**（除此之外也有用shannon指数）#安装并加载必要的包if(!requireNamesp

光疏介质·2024-09-12 17:12

R语言多项逻辑回归-因变量是无序多分类

因变量是无序多分类资料（＞2）时，可使用多分类逻辑回归（multinomiallogisticregression）。使用课本例16-5的数据，课本电子版及数据已上传到QQ群，自行下载即可。某研究人员欲了解不同社区和性别之间居民获取健康知识的途径是否相同，对2个社区的314名成人进行了调查，其中X1是社区，社区1用0表示，社区2用1表示；X2是性别，0是男，1是女，Y是获取健康知识途径，1是传统大

医学和生信笔记·2024-09-12 09:22

Protocol Buffer编译器安装

该站点上的大多数示例代码都使用protocolbuffer语言（proto3）的版本3。protocolbuff

雪域迷影·2024-09-12 03:22

R语言自学笔记-2内置数据集

#b站视频——R语言入门与数据分析#内置数据集#固定格式的数据（矩阵、数据框或一个时间序列等）#统计建模、回归分析等试验需要找合适的数据集#R内置数据集，存储在，通过help(package="datasets

实验室长工·2024-09-12 00:36

在TCGA上下载数据并且进行处理

使用R语言脚本对数据进行处理，将其提取为genesymbol和样本的数据，推荐看一下该博主处理数据！！真的非常详细！他R语言脚本在这个链接里

Red Red·2024-09-11 09:00

R语言-非结构化数据-文本数据读入

#2.2.2非结构化数据-文本数据读入rm(list=ls())#清空工作空间##1.读入简单文本数据###假如数据包含大量经过结构化的文本数据#只需按照读入csv等标准式数据的方法读入#例：novel=read.csv("novel.csv",fileEncoding="UTF-8")head(novel)##2.用readtable读入文本###文本数据普通读法test=read.table(

pdc31czy·2024-09-10 22:44

Coding and Paper Letter（十四）

1Coding:1.R语言包ungeviz，ggplot2的拓展包，专门用来作不确定性的可视化。ungeviz2.计算机图形学相关开源项目。计算机图形学光线追踪开源项目C++源码。

G小调的Qing歌·2024-09-10 13:10

r语言做绘制精美pcoa图_R语言高级绘图 — ggplot2

2)PCA的作图PCA主成分分析，可以将高维数据进行降维处理。我们的OTU表格就是典型的高维数据，可以对其进行降维处理得到主成分PC1和PC2，然后将所有样品都分解到这两个成分方向，进行散点绘图，可以直观的看出样品间的差异。首先需要一系列的统计处理，然后用ggplot2进行绘图，过程如下：#加载需要的三个包(需要先下载，再加载)>library(ade4)>library(ggplot2)>lib

weixin_39560002·2024-09-10 06:59

Python爬虫基础总结

学习日记目录学习日记一、关于爬虫1、爬虫的概念2、爬虫的优点3、爬虫的分类4、重要提醒5、反爬和反反爬机制6、协议7、常用请求头和常用的请求方法8、常见的响应状态码9、url的详解二、爬虫基本流程三、可能需要的库四

醉蕤·2024-09-10 03:07

科研绘图系列：R语言扩展物种堆积图（Extended Stacked Barplot）

介绍R语言的扩展物种堆积图是一种数据可视化工具，它不仅展示了物种的堆积结果，还整合了不同样本分组之间的差异性分析结果。

生信学习者1·2024-09-09 16:10

科研绘图系列：R语言柱状图分布（histogram plot）

文章目录介绍加载R包读取数据画图介绍柱状图（BarChart）是一种常用的数据可视化图表，用于展示和比较不同类别或组的数据。它通过在二维平面上绘制一系列垂直或水平的柱子来表示数据的大小，每个柱子的长度或高度代表一个数据点的数值。柱状图非常适合于展示分类数据的分布和比较。柱状图的特点：直观比较：柱状图可以直观地展示不同类别之间的数值比较，易于理解。分类展示：数据按照类别或组别进行分组展示，每个类别用

生信学习者1·2024-09-09 15:06

科研绘图系列：R语言富集散点图（enrichment scatter plot）

介绍富集通路散点图（EnrichmentPathwayScatterPlot）是一种数据可视化工具，用于展示基因集富集分析（GeneSetEnrichmentAnalysis,GSEA）的结果。横坐标是对应基因名称，纵坐标是通路名称，图中的点表示该基因在某个通路下的qvalue，可以简单理解为不同环境下的贡献大小。加载R包导入所需要的R包，在导入前需要用户自己安装。library(readxl)l

生信学习者1·2024-09-09 14:57

Python-Matplotlib安装及简单使用

Matplotlib是一个Python的图形框架，类似于MATLAB和R语言。

riyuexingchen0909·2024-09-09 11:06

sublime安装python库_Mac OS 轻松用 Sublime Text 3 配置Python编译环境

weixin_39603397·2024-09-09 06:34

听书稿 day27 学习日记

【你的昵称】清卿【最核心的一个问题】听书稿的思维导图如何构建【谈谈你的感想】大多数书都是围绕一个关键问题来写的，我们写听书稿的时候也要围绕这个关键问题来构建文章的大纲。常见的书籍有以下四类，分别有比较成功的听书稿案例。第一类是传授方法类书籍，这类书籍包括两种：一种是直接传授方法，通常采用并列结构写作，在传授方法的同时也可以适当讲述原因和道理。第二种是原理和方法一起讲，这类书籍一般采用“先说原因，后

恰逢秋风起·2024-09-09 04:40

在linux（ubuntu）中使用网页版的rstudio

RStudio是R语言集成开发环境的应用软件，RStudioServer是一个基于web访问的RStudio云端开发环境，需要安装在服务器上，支持多用户远程访问使用。

Chao_Powell_Hou·2024-09-08 11:46

R语言基础学习

R与RStudioR语言是数据科学和统计分析的语言，适合数据分析和数据可视化。R是开源的，拥有丰富的包（packages），可以与优化软件进行交互。

weixin_55475210·2024-09-06 19:54

鸿蒙 HarmonyOS学习日记 Day 2 界面开发、布局

文章目录一、界面开发1、代码书写方式2、界面开发-布局思路3、组件的属性方法4、文字溢出省略号、行高5、Image图片组件6、输入框与按钮四、综合实战-华为登录五、svg图标六、布局元素的组成二、单位问题一、界面开发1、代码书写方式1、代码块在build()方法中书写，在右侧预览中查看效果2、界面开发-布局思路1、ArkUI(方舟开发框架)说明：是一套构建鸿蒙应用界面的框架构建页面的最小单位就是“

林钟雪·2024-09-05 21:54

JS学习日记

reduce函数作用：将数组变成一个数值eg:leta1=[1,2,3,4,5,6]//计算a1中各元素的和functionf1(x,y){returnx+y}leta2=a1.reduce(f1)console.log(a2)forEach函数作用：将数组的每个元素传递给回调函数(遍历整个数组)leta=[1,2,3,4]letsum=0functioncheck(item){sum+=item

zero.cyx·2024-09-05 16:47

学习日记

话题：经常焦虑怎么办？1、焦虑是对过去种种有放不下的执念和对未来的种种担忧，过好当下，消除焦虑，未来是无数的当下组成。2、真诚的人才有影响别人的力量，同气相求，人都希望和高层次人学习交往，人的能量是会交换的，能量会从高的地方流向低的地方，当我们和比自己能量高的时候就会舒服。3、天女散花的时候在罗汉的身上会沾着在菩萨身上不会沾着？4、学会放手，一个人没有办法事必躬亲，这样容易委屈抱怨，学会让别人去发

天边那朵彩霞·2024-09-05 02:51

Python学习日记（Page.8）

今日整理以便日后查看。如有错误欢迎指出。今天聊一下while循环语句。格式：while条件:条件满足时，做的事情1条件满足时，做的事情2条件满足时，做的事情3......案例：题目为求1累计加到100的和i＝1sum＝0whilei＜＝100sum+＝ii+＝1print("1到100的和为：%d"%sum)

空手套不到_白狼·2024-09-05 01:08

学习小组Day5笔记--森蝶

6.表格在R语言中改名叫数据框7.函数或者命令不会用时，除了百度/谷歌搜索以外，用这个命令查看帮助：?read.table，调出对应的帮

松风·2024-09-04 23:42

Laravel小程序学习日记2018-07-10

有那么一个星期没有写日记了，因为答应了Sheldon15号前完成小程序的学习，很多东西都来不及总结，但是由于有vuejs的基础，wepy的使用是比较清楚的。今天为什么记录主要有1个原因，就是我在laravel小程序课程里面提交的修改被合并了，这次不是一两个错字那么简单，是一个小方法，这里截图庆祝一下。投稿小记录在wepy里面异步函数更新数据，一定要在后面加个this.$apply()

Purson·2024-09-04 18:31

学习小组Day6笔记--魏麻将

注意：学生信，R语言必学的原因是丰富的图表和Biocductor上面的各种生信分析R包。安装和加载R

魏麻将·2024-09-03 08:34

centos7 r语言安装_centos7 R-4.0.2 安装

tar-zvxfR-4.0.2.tar.gzcdR-*yuminstall-ygccyuminstall-ygcc-gfortranyuminstall-ygcc-c++yuminstall-yglibc-headersyuminstall-ylibreadline6-devgfortranyuminstall-yreadline-develyuminstall-ywgetlibXt-devely

weixin_39777404·2024-09-03 03:50

linux下载R语言失败,[已解决]CentOS7下安装rjags失败 installation of package ‘rjags’ had non-zero exit status...

问题CentOS7下安装rjags失败installationofpackage‘rjags’hadnon-zeroexitstatus详细报错>install.packages("gbs2ploidy",dependencies=TRUE)alsoinstallingthedependency‘rjags’tryingURL'https://cran.rstudio.com/src/contri

宁静致远敏·2024-09-03 03:50

Centos 安装R语言环境 3.6

118路司机·2024-09-03 03:19

R语言使用rpart包构建决策树模型实战、使用prune函数按照指定复杂度对决策树剪枝、使用rpart.plot包中的prp函数可视化训练、剪枝好的决策树

R语言使用rpart包构建决策树模型实战、使用prune函数按照指定复杂度对决策树剪枝、使用rpart.plot包中的prp函数可视化训练、剪枝好的决策树、type参数、extra参数、fallen.leaves

statistics.insight·2024-09-02 14:39

OHIF Viewer医学影像学习日记

前言：OHIFViewer一个开源的，基于Web的，医学影像查看器。项目文档GitHub项目大概流程：我们下载OHIFViewer项目运行打包，发布到服务器，然后暴露访问地址；再由后端提供返回固定格式json的接口，完整路径例如：http://www.baidu.com/#/viewer?url=http://www.your.com/apiv1/dicom/analysis/studies把此链

刘斩仙的笔记本·2024-09-02 13:58

r语言变量长度不一致怎么办_C语言，C++常见编译错误

fatalerrorC1003:errorcountexceedsnumber;stoppingcompilation中文对照：错误太多，停止编译分析：修改之前的错误，再次编译fatalerrorC1004:unexpectedendoffilefound中文对照：文件未结束分析：一个函数或者一个结构定义缺少“}”、或者在一个函数调用或表达式中括号没有配对出现、或者注释符“”不完整等fataler

weixin_39624094·2024-09-02 02:46

科研绘图系列：R语言单细胞差异基因四分图（Quad plot）

介绍在单细胞分析领域，为了探究不同分组间同一细胞类型的基因表达差异，研究者们常采用四分图（QuadPlot）作为分析工具。该图形的横轴代表比较组1，而纵轴代表比较组2。通过这种布局，四分图能够有效地展示两组间共有的差异表达基因，从而为深入理解细胞类型在不同条件下的分子特性提供直观的视角。这种可视化方法不仅揭示了组间基因表达的异同，还有助于识别可能在生物学过程或疾病发生中起关键作用的基因。加载R包导

生信学习者2·2024-09-02 01:45

科研绘图系列：R语言组合堆积图（stacked barplot with multiple groups）

介绍通常堆积图的X轴表示样本，样本可能会存在较多的分组信息，通过组合堆积图和样本标签分组信息，我们可以得到一张能展示更多信息的可发表图形。加载R包knitr::opts_chunk$set(warning=F,message=F)library(tidyverse)library(cowplot)library(patchwork)导入数据数据可从以下链接下载（画图所需要的所有数据）：百度云盘链接

生信学习者2·2024-09-02 01:45

陪孩子备战高考第一百八十九天

我希望能一直坚持下去，我也要改变一下，认真检查孩子学习日记的内容，把每天的学习内容都落实到位，让孩子将每天学习的知识点一点点储备起来，最后在高考中绽放自己！加油吧！

想入非非的棋子·2024-09-01 19:08

Python学习日记（Pag.7）

拿猜数字的案例说一下判断语句的嵌套。如有错误欢迎指正。题目：要求如下：1.数字随机产生，范围为1-102.有3次机会猜测数字，通过三层嵌套判断实现3.每次都猜不中的话，会提示猜大了还是小了示例：importrandomnum=random.randint(1,10)#随机生成1-10以内的数字guess_num=int(input("您所猜测的数字是:"))ifguess_num==num:pri

空手套不到_白狼·2024-09-01 08:24

【优胜行动派️学习日记】

[打卡宝宝]：魏萍[打卡日期]：2019/05/28[学习内容]：高效能人士的十个习惯[学习笔记]：12.心境平和，踏实走好每一步人情淡漠，物欲横流，这是我们这个社会的现实。很多时候，我们的内心都为外物所蒙蔽，浮躁占领了我们心灵的领地，在不断摇摆的现实面前很多人就像漂在水上的浮萍或者是长在墙头的艾草，外界稍有变化，他们就跟着动摇，不知道自己要去向何方，走向何处。于是，在人生中留下许多遗憾：在学业上

键萍·2024-08-31 23:47

科研绘图系列：R语言雷达图（radar plot）

介绍雷达图，又称为蜘蛛网图或星形图，是一种以多轴方式显示数据的图表。它通常用于显示多个定量变量的值，这些变量被表示为从中心点向外延伸的轴。每个轴代表一个变量，而每个变量的值则通过从中心向外延伸的距离来表示。雷达图可以直观地展示多个变量之间的相对大小和关系。雷达图的特点：多维数据比较：可以同时比较多个变量，看它们在不同维度上的表现。综合评价：用于综合评价一个或多个对象在多个方面的表现。趋势分析：可以

生信学习者2·2024-08-31 22:25

科研绘图系列：R语言饼图（pie chart）

介绍饼图是一种常用的数据可视化图表，它通过圆形的扇形区域来展示数据的比例关系。每个扇形的面积大小与其所代表的数据量成正比，从而直观地显示各部分在整体中所占的比重。特点：直观性：通过不同大小的扇形，可以直观地看到各个部分的相对大小。易于理解：圆形的分割使得人们容易理解各部分的相对比例。适合展示比例：特别适合展示各部分在整体中的比例关系。说明的问题：部分与整体的关系：显示每个部分在整体中所占的百分比。