Sentieon

关于sentieon的几点补充说明

sentieon的特点sentieon是一款商业版call变异的软件。call变异的软件很多，为什么sentieon能商业化（据说价格还很贵），主要有两个特点准、快。

六六_ryx·2024-01-22 16:45

Sentieon | 每周文献-Clinical Trial-第十一期

临床试验系列文章-1标题（英文）：Investigationofproduct-derivedlymphomafollowinginfusionofpiggyBac-modifiedCD19chimericantigenreceptorTcells标题（中文）：输注piggyBac修饰的CD19CAR-T细胞后产物衍生性淋巴细胞瘤的研究发表期刊：Blood作者单位：澳大利亚悉尼维斯米德医院等发表年

chSNP·2023-12-18 19:54

Sentieon | 每周文献-Long Read Sequencing（长读长测序）-第七期

长读测序系列文章-1标题（英文）：PrecisionFDATruthChallengeV2:Callingvariantsfromshortandlongreadsindifficult-to-mapregions标题（中文）：PrecisionFDA真相挑战第二版：利用短读长和长读长在难比对区域进行变异检测发表期刊：CellGenomics作者单位：美国国家标准与技术研究院材料测量实验室、美国食

chSNP·2023-12-04 20:20

Sentieon | 每周文献-Liquid Biopsy-第十期

液体活检系列文章-1标题（英文）：CopynumberprofilingofcirculatingfreeDNApredictstransarterialchemoembolizationresponseinadvancedhepatocellularcarcinoma标题（中文）：循环游离DNA的拷贝数分析可预测晚期肝癌的经动脉化疗栓塞反应发表期刊：MolecularOncology作者单位：福

chSNP·2023-11-21 09:02

Sentieon | 应用教程: 使用DNAscope对HiFi长读长数据进行胚系变异检测分析

介绍本文描述了使用Sentieon®DNAscope进行PacBio®HiFi数据胚系突变检测。PacBio®HiFi技术产⽣质量值超过Q20的高质量长读段，平均长度在10-25kb之间。

chSNP·2023-07-21 14:43

Sentieon | 每周文献-Agrigenomics-第四期

农业系列文章-1标题（英文）：Genomicfootprintsofsorghumdomesticationandbreedingselectionformultipleenduses标题（中文）：高粱驯化的基因组足迹和多种最终用途的育种选择发表期刊：《MolecularPlant》作者单位：中国科学院植物研究所植物资源重点实验室等发表年份：2022文章地址：https://doi.org/10.

毅硕科技·2023-07-14 13:24

Sentieon | 每周文献-Tumor Sequencing-第三期

肿瘤测序系列文章-1标题（英文）：Therelationshipbetweengeneticcharacteristicsandclinicalcharacteristicsandtheefficacyof131Itherapyinchildrenandadolescentswithlocallyadvancedormetastaticdifferentiatedthyroidcancer标题（中

毅硕科技·2023-07-14 13:54

Sentieon安装时 jemalloc error 解决办法

背景Sentieon建议使用jemalloc来改善Sentieon应用程序中的内存管理和整体性能，尤其是Sentieonbwa-mem。

毅硕科技·2023-07-14 13:54

生信在线讲座：Sentieon--基于机器学习的多组学分析

在二月份DahShu免费线上讲座中，我们将聚焦生物信息基因测序领域，邀请了来自硅谷的明星创业公司–基因测序数据软件Sentieon高级数据科学家胡晋南博士(Dr.FrankHu)同我们分享Sentieon

毅硕科技·2023-07-14 13:53

【GATK加速】如何用天河2号超级计算机跑基因数据分析，详细使用步骤

我们以一款商用NGS组装和比对工具Sentieon来演示整个过程：1、拿到超算发的VPN账户，使用Hil

毅硕科技·2023-07-14 13:23

【GATK加速】替换BWA/GATK/Mutect2，Sentieon软件肿瘤体细胞突变检测分析指南-系列1（WES or WGS）

前言本文介绍了两种体细胞变异检测pipeline：TNscope：使用Sentieon特有的算法，拥有更快的计算速度和更高的计算精度，对临床基因诊断样本尤其适用；TNhaplotyper2：匹配Mutect2

毅硕科技·2023-07-14 13:52

Sentieon | 每周文献-Epidemiology-第五期

流行病学系列文章-1标题（英文）：RareVariantsinInbornErrorsofImmunityGenesAssociatedWithCovid-19Severity标题（中文)：与Covid-19严重程度相关的免疫基因先天性缺陷的罕见变异发表期刊：《FrontiersinCellularandInfectionMicrobiology》作者单位：华大基因、华中科技大学同济医学院附属协和

毅硕科技·2023-07-14 12:15

Sentieon软件介绍

下载Sentieon软件公司成立于2014年7月，总部位于美国硅谷的山景城(MountainView)。团队成员具有多年的信号处理，大规模数据挖掘，和高性能计算的经验。

chSNP·2023-04-13 05:24

NGS的变异检测高效工具Sentieon使用体验

安装以目前的20180806为例，下载并解压缩wgethttps://s3.amazonaws.com/sentieon-release/software/sentieon-genomics-201808.06

xuzhougeng·2021-06-05 12:15

基因变异筛选工具-Alamut Focus

Alamut-基因变异处理一站式软件方案在NGS分析过程中，前期GATK/BWA、Sentieon等基因变异检测软件获取变异文件后，需要标记每个变异的临床影像，再结合表型探索并寻找致病变异，最终出具相关报告

chSNP·2021-04-04 00:40

call SNP from wheat RNA_seq

S2.png代码如下，这个流程是根据sentieon提供的流程稍加改动而来，这里不再对每一步进行解释，请见谅，另外注意参考基因组要使用染色体分开的那个，直接整条染色体>500Mb,软件不支持：#!

Neal_Bio·2019-11-04 19:19

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