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Linux
VASP
Vasp
+phonopy 计算声子谱
来源
VASP
计算笔记-声子谱计算-知乎#phonopy可以随意打开一个conda环境进行安装,我自己安装到了wnw_pyw90上。
Wang Niewei
·
2025-01-27 04:04
笔记
VASP
6.3.2和6.4.3安装问题
在参考B站的
VASP
安装教程,运行“makeDEPS=1-j8”命令时报错在运行“makeDEPS=1-j8”之前,已做了以下修改vimakefile.include#进入makefile文件#将文件中的
江河盈满
·
2025-01-25 07:16
开源软件
mpirun -np部分决定
vasp
程序实际使用多少个节点并行
1.MPI全称是messagepassinginterface,即信息传递接口,是用于跨节点通讯的基础软件环境。它提供让相关进程之间进行通信,同步等操作的API,可以说是并行计算居家出游必备的基础库。一个MPI程序包含若干个进程。每个mpi进程都运行一份相同的代码,进程的行为由通讯域(communicationworld)和该通讯域下的id(rankid)所决定。MPI的编程方式,是“一处代码,多
[email protected]
·
2024-01-27 11:44
linux
oneAPI2024编译
VASP
报错icc Command not found
在编译安装
vasp
之前需要安装C++编译器和Intel数学库(MKL)等等,在以往旧版本的Intel编译器中集成了ICC(IntelC++Compiler)并可一直作为默认的编译器去编译
vasp
,但在最新版的
DFT计算杂谈
·
2024-01-15 17:17
服务器
ffmpeg
centos
linux
python
icc
c++
DFT新手入门:VASPKIT生成模版INCAR
新手学习
VASP
计算时一般需要自行准备好
VASP
所需要的四个输入文件:INCARPOSCARKPOINTSPOTCAR。
DFT计算杂谈
·
2024-01-15 17:43
linux
centos
运维
服务器
python
eclipse
java
GULP 案例 4:如何计算热力学性质(热容、熵、焓、自由能等)?
热力学性质一般通过第一性原理计算+准谐近似模型得到,如
VASP
+phononpy
123wxw
·
2024-01-13 22:26
gulp
晶体结构轨迹(
VASP
、LAMMPS)分析后处理程序 ISAACS
给大家推荐一个结构轨迹后处理程序ISAACS,这个后处理软件可以计算径向分布函数、均方位移、键角和结构因子等性质。计算内容:一、X射线或中子散射数据二、径向分布函数Radialdistributionfunctionsg(r)1.totalRDFsforneutronsandX-rays2.partialRDFs3.Bathia–ThorntonRDFs三、结构因子Structurefactors
123wxw
·
2024-01-12 12:24
gulp
尼日利亚:比特币合法
作者:秦晋碳链价值12月22日,据外媒报道,尼日利亚央行发布通知,为其监管范围内的金融机构与尼日利亚境内
VASP
(虚拟资产服务提供商)之间的银行业务关系提供指导。
碳链价值
·
2023-12-26 11:09
区块链
第一性原理——模拟计算
_MD模拟_FEA_ML_相图计算200余位计算工程师均来自己TOP高校及科研院所,涉及第一性原理,分子动力学,有限元,机器学习,可为催化、电池、能源、化工、生物等重多领域提供技术支持,计算软件包含,
VASP
巨蟹座守护骑士
·
2023-12-22 21:34
天玑算科研平台
模拟计算
第一性原理
分子对接——模拟计算
_MD模拟_FEA_ML_相图计算200余位计算工程师均来自己TOP高校及科研院所,涉及第一性原理,分子动力学,有限元,机器学习,可为催化、电池、能源、化工、生物等重多领域提供技术支持,计算软件包含,
VASP
巨蟹座守护骑士
·
2023-12-22 21:34
天玑算科研平台
分子对接
模拟计算
phono3py快速安装教程
phono3py是类似于Phonopy的另一款基于第一性原理计算获得材料声学性质并可后处理的功能强大的软件,在以往推送内容中也有介绍基于phono3py计算晶格热导率
VASP
+phono3py:快速计算晶格热导率和声子寿命理论到实践
DFT计算杂谈
·
2023-12-05 02:26
linux
phonopy快速安装教程
它提供了
VASP
的Wien2k接口用来计算原子受力。它的主要功能有:计算声子色散谱;计算声子态密度,包括分立态密度;晶体热力学性质,包括自由能,热容量,熵。
DFT计算杂谈
·
2023-12-05 02:26
linux
CentOS7实体机安装以及部分问题处理方法
经验分享笔者以往一直是在自己的笔记本电脑上安装了一个VMware虚拟机,然后在虚拟机内部安装一个CentOS7系统,并以此为基础安装软件如
vasp
、ShengBTE等并进行简单任务的计算,以此来达到练习效果
DFT计算杂谈
·
2023-12-05 02:25
centos
服务器
p2p
bash+
vasp
+vaspkit能量应变计算弹性常数
脚本分享计算理论弹性常数常用的方法是应力应变,而另一种方法是根据能量变化,对平衡晶格结构施加小应变。能量-应变法对应于弹性刚度张量由总能量对应变的二阶导数导出。一般来说,应力应变法需要更高的计算精度才能达到与能量应变法相同的精度。然而,能量应变法需要的变形比后者小得多。能量应变法比应力应变法具有更小的应力敏感性,而且该方法已经在VASPKIT程序中实现。独立弹性常数的数目取决于晶体的对称性。对称性
DFT计算杂谈
·
2023-12-05 02:25
vasp
vaspkit
linux
DFT新手教程:
VASP
中ISIF取值设置
新手初学
VASP
计算时首先接触到的就是结构优化的计算任务。
DFT计算杂谈
·
2023-12-05 02:53
centos
linux
运维
服务器
python
纯干货:解读输出文件 |
VASP
零基础实用教程
前面的教程对
VASP
计算的输入文件进行了细致讲解,包括各种计算的INCAR文件的关键参数设置注意事项,KPOINTS文件的k点选取原则,如何生成赝势文件以及对应元素赝势的选取规则。
朱老师讲VASP
·
2023-11-10 02:40
DFT计算
理论计算
科学实验
学习
纯干货:差分电荷密度 |
VASP
零基础实用教程
前面的教程介绍了
VASP
的输入文件的准备和输出文件的解读,以及建立模型的方法,相信大家通过结合前面的教程并不断地练习一定可以很快的掌握
VASP
计算的基本技能。
朱老师讲VASP
·
2023-11-10 02:40
理论计算
DFT计算
科学实验
学习
纯干货:电子局域函数 |
VASP
零基础实用教程
上一篇教程我们讲解了差分电荷密度的含义以及其计算和处理方法,大家根据教程里面的例子多加练习,如果有疑问可以通过邮件联系我。本章教程我们主要来和大家讲解一下电子局域函数(ELF)的概念用途以及计算处理方法。根据维基百科定义,电子局域函数是对在给定点且具有相同自旋的参考电子的邻域中找到电子的可能性的度量。从物理上讲,这表示可测量参考电子的空间局部化程度,并为多电子系统中电子对概率的映射提供一种方法。这
朱老师讲VASP
·
2023-11-10 02:10
科学实验
理论计算
DFT计算
学习
纯干货:
VASP
计算常用小程序介绍 |
VASP
零基础实用教程
我们通过
VASP
进行理论计算时,合理准备输入文件是至关重要的一步,输入文件中的计算参数的设定决定了计算结果是否准确合理,因此,想要得到符合预期的结果,就需要准确合理的准备的输入文件。
朱老师讲VASP
·
2023-11-10 02:10
理论计算
DFT计算
科学实验
学习
纯干货:k点的选择及注意事项 |
VASP
零基础实用教程
通过前面的教程,相信大家对于
VASP
的输入文件已经有了一个比较直观的了解了,前面的教程针对于INCAR和POTCAR分别做了比较深入的讨论,但是没有对POSCAR和KPOINTS进行更加详细的介绍,POSCAR
朱老师讲VASP
·
2023-11-10 02:37
理论计算
DFT计算
科学实验
学习
纯干货:
VASP
简介及计算前期准备工作 |
VASP
计算零基础实用秘籍
VASP
(ViennaAb-initoSimulationPackage)作为目前最流行的计算软件之一,在科研界用户甚广,大势所趋,高水平的文章需要理论计算来助力,更多的科研工作者选择功能强大,性能稳定
朱老师讲VASP
·
2023-11-08 18:40
科学实验
理论计算
学习
纯干货:计算错误集锦及解决方法 |
VASP
零基础实用教程
通过上次的教程,相信大家已经做好
VASP
计算的前期准备,准备开始跃跃欲试了。
朱老师讲VASP
·
2023-11-08 18:40
理论计算
科学实验
学习
纯干货:赝势的选择 |
VASP
计算入门教程,真的超级有用
VASP
软件是基于贋势和平面波基组的第一性原理密度泛函计算程序。
朱老师讲VASP
·
2023-11-08 18:40
理论计算
科学实验
DFT计算
学习
纯干货:准备输入文件 |
VASP
零基础保姆级指南
通过前面的介绍,相信朋友们对
VASP
计算已经有了一个比较清晰的认识了。今天的教程主要来讲解一下如何准备
VASP
计算的输入文件以及一些参数设置的注意事项。
朱老师讲VASP
·
2023-11-08 18:01
理论计算
科学实验
学习
MATLAB-wannier90_hr.dat后处理以及紧束缚能带拟合(晶体规范)
初次接触
vasp
,在学习的过程中发现没有完整的关于wannier画能带的Matlab程序,经过三周的学习编写了后处理wannier90_hr.dat的Matlab代码。
Wang Niewei
·
2023-11-08 08:21
matlab
开发语言
HSE 计算电子性质
由于目前广泛使用的软件是
VASP
,而
VASP
是很难使用GW方法计算带隙的,所以这里主要讲用杂化泛函(HSE)的方法计算带隙。HSE的理论实际是很简单的,大家可以自己找找资料,实在不懂的话,可以联系我。
哇小侠
·
2023-11-05 06:08
算法
人工智能
【
VASP
】POTCAR文件
【
VASP
】POTCAR文件POTCAR文件的介绍qvasp生成POTCARvaspkit生成POTCAR再来认识一下各种赝势如何区分US、PAW、LDA、GGA、PW91前言一、4个常用的输入文件INCAR
何为xl
·
2023-10-27 02:15
VASP
服务器
linux
【
VASP
】QVASP 的使用
【
VASP
】QVASP的使用QVASP的介绍Qvasp安装使用、测试和算例ELF电荷局域函数计算输入文件简述QVASP的介绍下载地址:https://sourceforge.net/projects/qvasp
何为xl
·
2023-10-27 02:40
VASP
linux
VASP
5.4.4 保姆级安装全过程 (附带vaspkit)
1.准备好安装包
VASP
5.4.42.
VASP
安装前的准备InstallGNUCompilersudoapt-getinstallmakebuild-essentialg++gfortranInstallrequiredVASPlibraries
萌新待开发
·
2023-10-26 01:02
ง
工具
ว
linux
服务器
vasp
VASP
计算能带
首先静态电子自洽SYSTEM=TiSe2#Startparameterforthisrun:PREC=AccurateISTART=0ICHARG=2NCORE=4KPAR=4#IonicRelaxation#SYMPREC=1.0E-2IBRION=-1ISIF=2NSW=0EDIFFG=-1.0E-2POTIM=0.25IVDW=1#LVDW_EWALD=.TRUE.#NWRITE=0#Ele
多米尼克2049
·
2023-10-15 22:44
【
VASP
】KPOINTS文件介绍
【
VASP
】KPOINTS文件介绍一、KPOINTS的两种结构第一种结构:(非对称)第二种结构:(高对称)二、关于KPOINTS设置的一些经验三、KPOINTS的选取前言一、4个常用的输入文件INCAR
何为xl
·
2023-10-15 13:13
VASP
Linux
linux
【
VASP
】POSCAR文件
【
VASP
】POSCAR文件前言一、4个常用的输入文件INCAR、POSCAR、POTCAR、KPOINTSINCAR:计算任务类型是什么?怎么计算?KPOINTS:包含了倒易空间点网格的坐标和权重。
何为xl
·
2023-10-15 13:11
VASP
服务器
linux
win10-Linux子系统科学计算性能测试
今天在win10下重新装了一下子系统Ubuntu-18.04,测试了一下
vasp
计算的速度,发现与直接用centos系统还是有很大差别,差了一半了!!
vasp
计算耗时对比。
373Kice
·
2023-10-08 07:39
vasp
系列 002. 通过 vaspkit 生成的 BNAD.dat 数据文本计算有效质量
1.背景现在使用
vasp
软件计算,基本都是用vaspkit数据后处理工具。vaspkit工具有计算有效质量的功能,但是需要重新计算能带。
yong1585855343
·
2023-09-27 06:47
VASP
有效质量
Python
经验分享
Python 脚本通过 vaspkit 生成的能带数据文本 BAND.dat 计算有效质量
计算理论解释:https://blog.csdn.net/yong1585855343/article/details/1098233000.环境anaconda(Python3版本)1.
vasp
计算能带
yong1585855343
·
2023-09-27 06:47
Python
python
VASP
系列001. 高通量计算 Python 库 pymatgen 安装和一些使用(用 pymatgen 画 HSE 能带的细节和输出图片字体的简单调整)
一、安装0.作者Author:Zhi-YongChenSource:Experienceoffailuredate:09.25.2020注意:截至今天,可以安装日期前的最新版1.系统windows72.环境anaconda3.7安装最新版即可,网址:https://www.anaconda.com注意:需要设置添加到系统路径C++14或以上安装VisualStudio2015或以上Windows1
yong1585855343
·
2023-09-27 06:17
Python
python
6月16日一同探讨PWmat—MLFF机器学习在分子动力学中的应用
机器学习在分子动力学中的应用日期和时间2022年6月16日/14:00星期四(线上)讨论方向1.理论背景特征的产生线性模型VV模型KFNN模型KFDP模型2.实际操作数据预处理如何处理PWmat格式的分子动力学数据如何处理
VASP
龙讯旷腾
·
2023-09-20 09:55
量子力学
物理学
机器学习
分子动力学LAMMPS、MS、Gaussian、
VASP
培训课程
中国管理科学研究院职业资格认证培训中心分子动力学模拟被广泛用于生命科学、化学工程、物理、医药、材料科学等领域。由于传统实验需要大量的人力物力而且耗时,而计算机模拟的方法省时省力,能有效提高科研效率;目前,分子动力学模拟能在很大程度上进行预测指导实验,因此模拟与实验的对照是将来研究的主要方向之一。分子动力学模拟作为一种理想的计算机模拟方法,可以用来模拟两相之间的相互作用,也是对计算和实验的补充。应广
西山布衣
·
2023-09-19 16:55
VASP
计算问题小结
VASP
计算问题小结本文转载自博主一个人就是一个叠加态,有部分删减修改,文中对相关概念方法做了详细的总结,留坑待填...1.第一原理计算的一些心得1.第一性原理第一性原理其实是包括基于密度泛函的从头算和基于
一个有奔头的小硕士
·
2023-08-10 08:36
vasp
算表面吸附流程_
VASP
实例分析表面吸附计算
本文主要为了记录在学习
Vasp
计算过程中如何设置INCAR中的一些参数,并不着重讲解其含义,详见可自行到
vasp
官网查阅。
又可乐
·
2023-07-20 21:19
vasp算表面吸附流程
基于
vasp
计算材料红外与Raman光谱信息
使用方法一:获取材料raman活性信息代码链接:
VASP
/Sibulk-VASPatmaster·raman-sc/
VASP
·GitHub前置计算材料的振动频率和介电常数等,参考INCAR如下:SYSTEM
CAE320
·
2023-06-08 05:21
java
数学建模
开发语言
VASP
报错指南
totaldrift太大的问题在做一个结构的弛豫的时候遇到了这个问题totaldrift:19.93455134.6170802.916653一般这个都是接近0的,之前也一直以为它是上面力的总和。在我这个例子里,无论力和压力收敛的再好,这个totaldrift始终很大,非常困扰。从vaspwiki上还有冲浪得到的结果来看,他们提出的方法包括增加截断能增大FFT网格(NGXF)关掉实空间投影LREA
多米尼克2049
·
2023-04-14 01:44
vasp
进行结构优化,报错
1.过程报错:WARNINGinEDDRMM:calltoZHEGVfailed,returncode=841如下图并且优化了30多离子步后,报下面错误,程序结束,没有显示优化完成。curvature:0.00expectdE=0.891-320dEforcontlinesearch0.480-320ZBRENT:fatalerrorinbracketingpleasererunwithsmall
不练出腹肌不改名-
·
2023-04-05 10:55
vasp理论计算
算法
VASP
几何优化INCAR文件简单介绍
GlobalParametersSystem=siliconISTART=1(Readexistingwavefunction;ifthere)ISPIN=2(SpinpolarisedDFT默认值1-nonspin)MAGMOM=INO*1(ISPIN=2时,MAGMOM=原子个数*1;非线性磁性系统MAGMOM=3*原子个数*1)#ICHARG=11(Non-self-consistent:G
光电碰碰
·
2023-04-05 10:54
vasp
vasp
学习之笔记
一、分子几何结构优化1、输入文件INCARSYSTEM=H20ISTART=0ICHARG=2PREC=NormalLREAL=.F.IBRION=2ISIF=2NSW=100POTIM=0.5EDIFFG=-0.05ENCUT=400eVNELM=60EDIFF=0.1E-04LCHARG=.F.LWAVE=.F.ISMEAR=0SIGMA=0.2ALGO=FastKPOINTSmeshauto
儒雅的顶破天
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2023-04-05 10:52
其他
VASP
计算非线性磁矩和磁各向异性能(自旋轨道耦合)小结
非线性磁矩计算:1)计算非磁性基态产生WA.VECAR和CHGCAR.文件。2)然后INCAR中加上ISPIN=2ICHARG=1或11!读取WA.VECAR和CHGCAR.文件LNONCOLLINEAR=.TRUE.MAGMOM=注意:①对于非线性磁矩计算,要在x,y和z方向分别加上磁矩,如MAGMOM=100010!表示第一个原子在x方向,第二个原子的y方向有磁矩②在任何时候,指定MAGMOM
CAE320
·
2023-04-05 10:52
分子模拟
VASP
磁性
磁矩
自旋轨道
磁各向异性
程序怎么启动
vasp
_
vasp
指月录(五):INCAR初步
Vasp
手册上关于INCAR的标签共计有356个,合周天大衍岁星轮转之数,当然我们实际上可能会触及到并需要了解的标签少不过七八个,多不过三四十个,而且触类旁通,一法破法法皆破,而且在实际操作中的【出
是呵呵
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2023-04-05 10:20
程序怎么启动vasp
在一个程序中什么算是亮点_
VASP
计算问题小结
本文转载自博主一个人就是一个叠加态,有部分删减修改,文中对相关概念方法做了详细的总结,留坑待填...1.第一原理计算的一些心得1.第一性原理第一性原理其实是包括基于密度泛函的从头算和基于Hartree-Fock自洽计算的从头算,前者以电子密度作为基本变量(霍亨伯格-科洪定理),通过求解Kohn-Sham方程,迭代自洽得到体系的基态电子密度,然后求体系的基态性质;后者则通过自洽求解Hartree-F
weixin_39873208
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2023-04-05 10:18
在一个程序中什么算是亮点
vasp
手册_
VASP
个人笔记(二) INCAR参数设置(详细)
INCAR文件是
VASP
程序最为核心的输入文件,也是四个主要输入文件中最为复杂的一个,其作用是指示
VASP
程序需要算什么,以什么样的方式方法进行计算,以及精度的控制等等。
weixin_39637363
·
2023-04-05 10:17
vasp手册
VASP
ERROR:the following files does not exit POSCAR
当出现这种上述问题时,解决办法(1)不要存在type类型的空格(2)先打开POSCARwq保存一下再dos2unixPOSCAR一下,如下图
欣欣丫呀
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2023-04-05 10:39
vasp
python
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