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ascp
Aspera的安装与使用 ---配合prefetch下载SRA数据
更新:使用方式:个人直接使用一下命令进行下载#还有个改进方式是制定文件下载的位置,否则默认在~/ncbi文件夹里面prefetch--
ascp
-path"/home/HWP/.aspera/connect
宁静的胡杨
·
2020-03-11 18:06
prefetch 使用
此外,也可设置aspera,Ex:prefetch-tascp-a"/opt/aspera/bin/
ascp
|/opt/aspera/bin/asperaweb_id_dsa.op
YX_Andrew
·
2020-03-06 14:17
2020-01-17 【转录组】一、下载SRA、安装并使用fasterq-dump(SRA to fastq)
下载sra,最新版prefetch已不支持aspera,原因是ncbi数据存储已改成云模式,
ascp
并不支持,速度没优势prefetch--option-file~/data/mmussr.txt-O~
my_derek
·
2020-01-27 23:15
来吧,加速你的下载
刘小泽写于19.5.3软件环境原始数据一般是以SRR格式存放,这个文件一般都要几个G,于是下载器首选
ascp
,但是直接使用
ascp
下载又需要配置一些参数,对于新手来说,最好是能提供一个ID,然后直接就下载
刘小泽
·
2020-01-04 02:15
NCBI下载SRA数据
安装AsperaConnect后,prefetch优先使用
ascp
方式下载。我简单的比较一番,fastq-dump平均下载速度大概100kb/s,
ascp
能达到10M/s。
砖头机的灵感
·
2019-11-03 11:00
生信分析 - 常用命令 - 持续更新
001.SRA数据下载:准备ID:/vol1/srr/SRR672/005/SRR6728405分别为**SRR号头/SRR号最后一位/SRR号下载:
ascp
-v-QT-l400m-P3300
abysw
·
2019-10-17 09:00
aspera 使用(简版)
系统:ubuntu18.0环境:miniconda3软件安装:condainstall-chccaspera-cli下载数据:通过SSH连接:
ascp
-v-k1-T-l200m-i~/miniconda3
mitoheng
·
2019-08-02 15:32
Aspera下载SRA文件
Aspera用法如下:Usage:
ascp
[参数]目标文件保存路径一、Aspera下载一个SRA文件Step1:建立Seqs文件夹保存下载序列mkdir~/SeqsStep2:下载SRA文件到Seqs文件夹
晓明_再出发
·
2019-04-28 12:08
NCBI NR文件下载和批量md5检验
【1】Aspera下载NCBI数据单个文件下载命令:
ascp
-i"C:\Users\Administrator\AppData\Local\Programs\Aspera\AsperaConnect\etc
nmkiby
·
2019-03-29 20:20
培训中常见报错整理_生信技能树_Amy Cui
更新提示aspera安装aspera安装后,prefetch下载速度会很快,就像你冲了会员一样的快~安装方法见:这里image.png这个报错很常见,原因是还没添加环境变量的command,虽然你看到
ascp
Amy_Cui
·
2019-03-16 16:44
A机器scp一个文件到B机器 无需密码
用户为例进行设置1、先删除之前的配置(两台机器都要操作)rm-rf~/.ssh2、生成ssh的公钥和私钥(两台机器都要操作)ssh-keygen-trsa-P''-f~/.ssh/id_rsa3、先将从机器
Ascp
呕吼哈嘿
·
2018-05-23 16:49
ascp
下载ebi ncbi数据库大文件
ascp
下载ebincbi数据库大文件在技能树论坛里看到有人说
ascp
可以下载宽带满速,就百度了一下,但是发现ncbi的正常可用,ebi的已经不能用了,所以更新一下。
zd200572
·
2017-08-22 16:54
aspera connect使用的问题
asperaconnect使用的问题:为何
ascp
老是报错?网络的问题?
bob601450868
·
2016-01-20 21:00
ascp
Oracle EBS:
ASCP
截获工作台发放的PR
工作台发放的计划单可以自动转成请购单,实际上系统的功作就是将发放的计划单通过系统自动启动PO模块中的"导入申请"这个请求,将计划单插入至po_requisitions_interface_all这个接口表中,转成已批准的PR。 http://www.dezai.cn/Blog/article.asp?id=325 因为之前作过lotus与ERP的接口集成(由OA下需求抛
·
2015-11-02 13:30
oracle
Oracle EBS:PO 采购 来源补充规则的设置
PO中的供应商来源补充规则对MRP,
ASCP
均有比较大的影响 Step1.切换到PO模块或职责,选择组织 Step2.选择菜单项中的 供应来源->来源补充规则
·
2015-11-02 13:22
oracle
Oracle EBS:
ASCP
学习
ASCP
与MRP的差异 MRP
ASCP
核心目标 物料 物料,产能,计划 规划程序 单纯种 多线程,多整体
·
2015-10-30 14:41
oracle
使用aspera从NCBI下载大数据
使用aspera从NCBI下载大数据
ascp
-hUsage:
ascp
[OPTION]SRC...DEST SRCtoDEST,ormultipleSRCtoDESTdir SRC,DESTformat
以致宏大,以致高远
·
2013-05-17 10:00
业余码农南瓜的第一篇博客
接下来的任务就是静下心来搞技术,技术主要是两个方面:一个是工作所在
ASCP
,一个是业余感兴趣的MySQL的存储引擎。
donald_ascp
·
2012-12-20 18:26
博客
南瓜
What is Oracle
ASCP
?
OracleAdvancedSupplyChainPlanning(
ASCP
)isacomprehensive,Internet-basedplanningsolutionthatdecideswhenandwheresupplies
pan_tian
·
2012-08-06 16:00
oracle
exception
Access
optimization
Numbers
Types
What is Oracle
ASCP
?
Oracle Advanced Supply Chain Planning (
ASCP
) is a comprehensive, Internet-based planning solution that
xitong
·
2012-08-06 16:00
oracle
What is Oracle
ASCP
?
Oracle Advanced Supply Chain Planning (
ASCP
) is a comprehensive, Internet-based planning solution that
wsql
·
2012-08-06 16:00
oracle
What is Oracle
ASCP
?
Oracle Advanced Supply Chain Planning (
ASCP
) is a comprehensive, Internet-based planning solution that
xitong
·
2012-08-06 16:00
oracle
ASCP
中是要计算mtl_supply的数据
1、当请购单创建、审批后,mtl_supply的变化 a.当创建完请购单,MTL_SUPPLY为空 b.当审批后,mtl_supply中产生一条数据,supply_type_code=REQ c.当请购单审批后,请购头与请购行存入MS.REQ_HEADER_ID, MS.REQ_LINE_ID,此时MS.SUPPLY_TYPE_CODE=REQ 2、当PO创建、审批后,mtl_su
wsql
·
2012-08-03 17:00
scp
ASCP
中是要计算mtl_supply的数据
1、当请购单创建、审批后,mtl_supply的变化 a.当创建完请购单,MTL_SUPPLY为空 b.当审批后,mtl_supply中产生一条数据,supply_type_code=REQ c.当请购单审批后,请购头与请购行存入MS.REQ_HEADER_ID, MS.REQ_LINE_ID,此时MS.SUPPLY_TYPE_CODE=REQ 2、当PO创建、审批后,mtl_su
xitong
·
2012-08-03 17:00
scp
ASCP
中是要计算mtl_supply的数据
1、当请购单创建、审批后,mtl_supply的变化a.当创建完请购单,MTL_SUPPLY为空b.当审批后,mtl_supply中产生一条数据,supply_type_code=REQc.当请购单审批后,请购头与请购行存入MS.REQ_HEADER_ID,MS.REQ_LINE_ID,此时MS.SUPPLY_TYPE_CODE=REQ2、当PO创建、审批后,mtl_supply的变化a.当请购单
pan_tian
·
2012-08-03 17:00
Date
header
table
interface
transactions
Forms
ASCP
中是要计算mtl_supply的数据
1、当请购单创建、审批后,mtl_supply的变化 a.当创建完请购单,MTL_SUPPLY为空 b.当审批后,mtl_supply中产生一条数据,supply_type_code=REQ c.当请购单审批后,请购头与请购行存入MS.REQ_HEADER_ID, MS.REQ_LINE_ID,此时MS.SUPPLY_TYPE_CODE=REQ 2、当PO创建、审批后,mtl_su
xitong
·
2012-08-03 17:00
scp
Oracle
ASCP
和MRP有啥区别
这个问题,可以简单地说,是
ASCP
比MRP(或SCP)强在哪?正好看到个贴子,说
ASCP
能计算替代物料,而MRP不能,除此之外,还讲了许多诸如
ASCP
技术如何先进之类。
rfb0204421
·
2012-07-23 11:00
oracle
优化
制造
服务器
图形
产品
Oracle EBS:
ASCP
学习
ASCP
与MRP的差异MRPASCP核心目标物料物料,产能,计划规划程序单纯种多线程,多整体范围单一模式多模式物料一个层级上,不考虑替代料多层级,考虑替代料有限产能不支持支持决策支持不支持支持绩效指标无有
eastjazz
·
2011-03-24 01:00
多线程
oracle
制造
产品
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