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生信分析过程中这些常见文件的格式以及查看方式

在分析的过程中还会有众多中间文件的生成，如bed、bed12、sam、bam、wig、bigwig、bedgraph等，生成后我们一般会查看下内容了解文件每一列的含义，以此来决定需要提取哪些有用信息列来进行下一步分析

少奶奶的猪·2020-07-10 00:15

生信分析过程中这些常见文件（fastq/bed/gtf/sam/bam/wig）的格式以及查看方式你都知道吗？

在分析的过程中还会有众多中间文件的生成，如bed、bed12、sam、bam、wig、bigwig、bedgraph等，生成后我们一般会查看下内容了解文件每一列的含义，以此来决定需要提取哪些有用信息列来进行下一步分析

生信宝典·2020-07-09 21:45

add expires header 如何缓存以加快访问速度

m=9d78d513d9940bed03adc33f1a16a63c4e07d6347cc3975521dbc90ed5264c40347bfee17c3510738396273146b8492bbbad696f635d74f1cf8bcd0089a6c27672dd3a6f364bd95c16d248ae9f472

iteye_20137·2020-07-09 17:46

[bed]

在工作过程中，经常需要调整一些hadoop的参数配置，所以经常会遇到各种各样的问题。比如改了个配置怎么突然namenode起不来啦，加了个jar包怎么让hadoop的jvm加载啊，如何设定log目录啦等等，每次都需要仔细的查一遍启动脚本才能找到原因，费时又费力，因此专门总结了一下以便不时之需。cloudera的hadoop的启动脚本写的异常复杂和零散，各种shell脚本分散在系统的各个角落，让人很

MrTitan·2020-07-09 11:10

如何实现智能家居的网状网络?

__biz=MzU4NjMxNjA2NQ==&mid=2247484539&idx=1&sn=17a0ade996db2a5e52f13f418d7e841a&chksm=fdfc6435ca8bed236188084c8b74657ed281dc684fe9291b64124b14196b32224151c38c4252

A奉献经验·2020-07-09 10:22

分布式技术一周技术动态 2016-10-09

=1&sn=631dd8beb0dee05367765ddf1b3bc501&chksm=be4152f28936dbe4d487a9a23cf5e8a8ad9f0a727b7310288585809bed603e76

weixin_30488313·2020-07-09 09:48

Android上掌纹识别第一步：基于OpenCV的6种肤色分割源码和效果图

otsu（ostu可以参考http://blog.csdn.net/onezeros/article/details/6136770，http://wenku.baidu.com/view/05c47e03bed5b9f3f90f1ce4

心随你动·2020-07-09 08:14

【分析】CNVkit_拷贝数分析工具

Github地址2.下载相应数据去UCSCGenomeBioinformatics下载参考数据:1.物种的参考基因组序列，采用FASTA格式[必填]2.基因注释数据库，通过RefSeq或Ensembl，以BED

oddxix·2020-07-09 06:36

mongodb相关报错-----持续整理

问题1：db.res_query_field.find({id:5bed}).pretty()>[Error]SyntaxError:identifierstartsimmediatelyafternumericliteralatline1

|汾西公子·2020-07-08 23:47

ERROR ITMS-90164,ERROR ITMS-90164

[7510BED4-C82E-49AD-8D9C-98C7D1FC3740.png](http://upload-images.jianshu.io/upload_images/1485668-7a2bf94cfad01f0b.png

咔唯ios·2020-07-08 20:03

最佳下载器FDM

www.freedownloadmanager.org/zh/win1064位安装包：https://pan.baidu.com/s/1n97MEwoCS3TCJ-A9d-iziw使用：从UCSC的table下载gtf或是bed

苏牧传媒·2020-07-08 17:52

LR(1) 分析例子

例如下列文法G′为：(0)S′→S(1)S→aAd(2)S→bAc(3)S→aec(4)S→bed(5)A→e我们首先用S′→·S作为初态集的项目，然后用闭包函数和转换函数构造识别文法G′的识别活前缀的有限自动机

vincent2610·2020-07-08 12:07

基因结构图-分分钟学会

打开这个工具，它的界面如下：1.数据输入类型绘图的输入文件有四种类型的数据可选：BED:大家可以在基因组GFF文件筛选基因的这些信息，第

组学大讲堂·2020-07-08 11:04

To Bed|Hello,it’s about 30 minutes until bedtime.

Tobed,是一个睡觉闹钟，它会定时提醒你睡觉，杜绝熬夜。首先你需要告诉它，你的名字，以及你的年龄，顺便告诉它你每天想在什么时候起床。当然，它会给你一个周末时光，让你享受难得的睡懒觉时光。爱屁屁只要一个菜单按钮，你可以在这里改变起床时间，设置睡眠时间，进入休假时光。所有的一切都在这朵蓝天白云间，在无数星星和硕大的月亮的监视下完成。爱屁屁会根据你的年龄建议睡眠时间，在工作生活时段是，它会告诉你还要过

凶残的小木木·2020-07-08 03:14

嘉兴环球公馆 X-bed平台上运营现房即买即收益

嘉兴环球公馆X-bed平台上运营现房即买即收益公寓热线：158-5033-5827（同V信）售楼处小杨现房发售，后顾无忧环球公馆，现房发售，即买即交房，即买即办产证。

月河印巷·2020-07-07 19:39

第一个Java程序

雪_晟·2020-07-07 02:57

Apache 默认字符集影响浏览器自动选择页面字符编码问题！

转自:hi.baidu.com/hasiz/blog/item/6fcad8b45bed83718bd4b2d7.html今天先把自己的网页修改成UTF-8编码，首先做了一个测试页，结果发现不论我怎样设置测试页

Lutx·2020-07-06 23:38

flutter 仿微信朋友圈发布图片

：PhotoFrame(imagesShow:_imagesShow)；_imagesShow=[{id:60,image:https://www.tricklen.com/publicImage/1bed62c0e9e

ChenyiMX·2020-07-06 21:11

The MRC database dictionary之FAM库（ familiarity 熟悉程度）

breakfast657afternoon655clothes652bedroom646dad646girl645radio644book643newspaper641water641big640canada638bed636comes636try636night636sun635paper635notice634large634bag634car634expensive633better633a

_我走路带风·2020-07-06 17:20

css样式实现炫彩字体

font-family:"黑体";color:#8c888b;background:-webkit-linear-gradient(45deg,#70f7fe,#fbd7c6,#fdefac,#bfb5dd,#bed5f5

不言而喻i·2020-07-06 11:47

物信息学数据格式的习题(blast/blat/fa-fq/sam-bam/vcf/bed/gtf-gff)，收集这些格式的说明书。

VCF格式文件的shell小练习原文链接首先使用bowtie2软件自带的测试数据生成sam/bam文件，还有vcf文件代码如下：mkdir-p~/biosoftcd~/biosoftwgethttps://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.shbashMiniconda3-l

天涯清水·2020-07-06 04:16

GWAS | 全基因组关联分析 | PLINK | 实战 | 统计遗传学

首先必须了解plink的三种格式：bed、fam和bim。（注意：这里的bed和我们genome里的区域文件bed完全不同）plink需要的格式一般可

weixin_34409703·2020-07-06 01:13

java对象的初始化过程

TCA·2020-07-05 14:31

【绘分享『英文启蒙规划师』训练营】第四课高频词作业

这是最近才看的绘本《Abedforpets》，比如这一句话Petsgetfedontheredbedintheden就出现了7个高频词，分别为：get,on,the,red,bed,in,the。

Hi我是Coco·2020-07-05 08:35

周检视 2月11-17(02.17-2018)

今天开始改变：一起照相、一起运动、订一个目标实现.图片发自App图片发自App2.bed：【1】看《和平饭店》电视剧晚睡，没完成早睡。早晨照样早起，所以身体很累。【2】对社科基金填写比较疏忽。

聪明的月亮·2020-07-05 04:19

正则表达式负向前瞻

例如正则表达式/bed(?!room)/只能匹配后面不跟字串"room"的字串"bed",如字串"bedrock"等，且子串"room"并不作为匹配的结果返回。

lt3487928·2020-07-04 22:21

按位与按位或按位异或运算

时是在项目中一般是整页刷新页面还是请求后局部刷新页面释舷乔Sg54Jj50H胖稚诶颈姥邮《http://baobao.baidu.com/article/e1c3aafbd8c23c92ab387173bed545a9

com19871221·2020-07-04 13:08

CNVkit的使用

流程图问题1：我们应该用哪个bed？

素还真_cf26·2020-07-04 11:23

HDU 1402 快速傅里叶变换(FFT)实现高精度乘法

http://blog.csdn.net/ljhandlwt/article/details/51999762https://wenku.baidu.com/view/79162aa1bed5b9f3f90f1ca8

Nicetomeetu-·2020-07-04 05:11

bamtobed/bedgraph

ref:bamtobed—bedtools2.27.0documentation安装：BEDtools使用：bamtobed:bamToBed-ixxx.bam>xxx.bed-bedpeWriteBAMalignmentsinBEDPEformat

苏牧传媒·2020-07-04 04:46

正则表达式正向前瞻

例如，正则表达式/bed(?=room)/只能匹配子串"bedroom",而子串"room"并不作为匹配结果返回，以进行后续处理。同样正则表达式/Windows(?

OkidoGreen·2020-07-04 04:01

RSS订阅新浪微博

api.prprpr.me/weibo/rss/{微博博主的uid}获取uid：进入博主的微博主页，控制台执行/uid=(\d+)/.exec(document.querySelector('.opt_box.btn_bed

鸭梨山大哎·2020-07-02 11:23

Rxjava+Retrofit

转载并感谢作者：RxJava与Retrofit结合的最佳实践http://gank.io/post/56e80c2c677659311bed9841Retrofit+RxJava完美封装http://www.jianshu.com

alialiali·2020-07-02 11:21

Flash制作卷轴水墨画展开动画效果

先看下效果吧：制作步骤：1、新建一个默认大小的Flash文档，用矩形工具画一个矩形，轮廓宽度为2，填充色为#BED0BF。[img]/uploads/allimg/080903/10

iteye_6762·2020-07-02 04:33

8.12

fromDOCS_NORMAL_REPORT_RECtleftjoinv_his_pats_dischargedont.patient_id=d.patient_id2selectt.patient_id,d.patient_name,v.bed_no

小FFF·2020-07-01 22:27

linux 如何查找命令的路径

http://hi.baidu.com/longredhao/item/911356ea2d8bed3687d9deedlinux下，我们常使用cd,grep,vi等命令，有时候我们要查到这些命令所在的位置

cocoasprite·2020-07-01 20:41

kubernetes部署dashboard

kubectlversionClientVersion:version.Info{Major:"1",Minor:"17",GitVersion:"v1.17.0",GitCommit:"70132b0f130acc0bed193d9ba59dd186f0e634cf

cbmljs·2020-07-01 19:40

对“对倪光南院士关于文档格式国际标准之争观点的不同看法”的不同看法

《对倪光南院士关于文档格式国际标准之争观点的不同看法》原文地址：http://blog.sina.com.cn/u/4dce9bed010008yl废话不说了，这篇文章的问题之处列在下面：1、“微软并没有寻求标准的单一化

捏造的信仰·2020-07-01 15:12

布罗茨基213 行的诗歌，体验诗人间的百年万里的对话。

ElegytoJohnDonneJohnDonnehassunkinsleep...Allthingsbesidearesleepingtoo:walls,bed,andfloor—allsleep.Thetable

Hippocrene·2020-06-30 23:17

公主在床Princess Celestia is in your bed

原文地址：https://www.fimfiction.net/story/212626/princess-celestia-is-in-your-bed作者：ocalhorn译者：龙舌兰图片发自App

龙舌兰的香气·2020-06-30 20:54

bamdst: bam文件深度统计

下载安装gitclonehttps://github.com/shiquan/bamdst.gitcdbamdst/make安装完成之后出现了可执行文件使用先看看example/里面有些啥有一个bed区域文件和

presentlife·2020-06-30 02:17

wig、bigWig和bedgraph文件详解

bam或者bed格式的文件主要是为了追踪我们的reads到底比对到了参加基因组的什么区域，而UCSC规定的这几个文件格式(wig、bigWig和bedgraph)用处不一样，仅仅是为了追踪参考基因组的各个区域的覆

超级无敌大蜗牛·2020-06-30 00:53

修改最新IOS QQ地理位置发送

[403F8BED-DA18-48DE-9BDB-136284918D28.jpg](http://upload-images.jianshu.io/upload_images/416783-28fe7feaa42c9378

crean·2020-06-29 21:33

Python 列表(list)的使用

更新元素四、删除元素五、求list长度六、连接列表七、截取列表八、复制列表一、创建listmyList=[2,3,1,5,6,8]print(myList)#可以存储不同类型元素myList1=['ab','bed

107国道道长·2020-06-29 09:10

bedgraph, wig, bigwig 学习之bedGraphToBigWig 报错（End coordinate......）

1：bedgraph主要是来源于bed文件，包含了bed文件的信息.UCSCbedgraph的

liu_ll·2020-06-28 21:02

Microsoft Office 2019 中文版下载

3.51GBSHA1：d850365b23e1e1294112a51105a2892b2bd88eb9SHA256：f5bea5517a3879792c39127db77aa7e766b4a9897bf52bed0c7e5dc70ccbc3f8

weixin_34220963·2020-06-28 14:21

Jenkins Slave 通过JNLP 的方式访问Master IP 总是127.0.0.1

解决办法，重启机器可能是我以前用的jenkinsurl是127.0.0.1然后是缓存什么没有释放掉所致Agentforwin12Jenkinsproject9a7f3c0e8bed2742eceba49eb806327b88085f973bf782e231ccc061bee4ddf5win12

weixin_34005042·2020-06-28 09:41

Android内存优化 -- 内存管理 onTrimMemory

__biz=MzIxNjc0ODExMA==&mid=2247484311&idx=1&sn=1fe0416bed4137dd45c6e9c153bb14f4&chksm=97851ab6a0f293a0cde28ff6d1091b2232e1758e9845a05549d01c62f412def742985d642630&

Passon_Fang·2020-06-28 09:49

iOS10的适配问题

__biz=MzA3NzM0NzkxMQ==&mid=2655358043&idx=1&sn=a1433f4bed139ea18dccf625fde9fe3c&chksm=84e24173b395c8657776918340eb76b694b770bde044b64e6fd5c10301936a118fb8c33aadca

你真的懂吗·2020-06-28 05:46

R语言微博评论爬虫练习

1.随意选个热点微博2.参考R微博数据分析http://blog.sina.com.cn/s/blog_9bed162b0102wu1w.htmlR语言实现代码devtools::install_github

weixin_30289831·2020-06-27 15:12

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