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data.frame
ggplot2 + 截断y轴
patchwork)set.seed(13)options(stringsAsFactors=FALSE)name<-rep(LETTERS[1:10],3)value<-runif(30)data<-
data.frame
吴十三和小可爱的札记
·
2023-09-05 10:43
OPLS-DA的S-plot图可视化
library(testpackage)s_plot_data<-t(s_plot_data)data<-
data.frame
('Secondary_ID'=c('A1
kylin王国
·
2023-09-01 10:39
R语言
数据可视化
数据分析
r语言
开发语言
数据分析
R 基础知识:数据结构(list & factor)
这些数据结构包括弹性容器:list;有阶阶层的向量:factor;数据框:
data.frame
;二维的向量:matrix;阵列:array。
小盐罐儿
·
2023-08-31 17:21
R语言画样本不均衡组的箱线图
#导入ggplot2包library(ggplot2)#示例数据框,包含数值数据和分组信息data<-
data.frame
(Group=c(rep("GroupA",10),rep("GroupB",15
qq_27390023
·
2023-08-27 22:38
r语言
R语言常用基本函数,含实例:万字总结
目录vector:创建向量(默认填充0,空字符,FALSE)
data.frame
:可以看作由多个向量组成的表格,每个向量代表表格的一列数据sequence:创建序列(可以简写为seq)dim:获取矩阵或数组的维度信息
dulu~dulu
·
2023-08-27 10:51
R语言
前端
服务器
r语言
R语言一些小技巧
package是R的灵魂,但是分base,recommended,还有一些其他的packagebase,recommended是启动R必需的a<-installed.packages()b<-
data.frame
蓝天_乎乎
·
2023-08-24 15:50
R 第七章tibble
>library(tidyverse)>atibble(+x=1:5,+y=1,+z=x^2+y+)#Atibble:5x3xyz11122215331104411755126>>x=1:5>y=1>
data.frame
liyin_d64b
·
2023-08-23 14:27
R语言08-R语言中数据框和矩阵相关函数
数据框相关函数:
data.frame
():用于创建数据框。str():查看数据框的结构。head(),tail():查看数据框的前几行或后几行。nrow(),ncol():获取数据框的行数和列数。
丰。。
·
2023-08-22 21:15
R语言
r语言
矩阵
开发语言
【ggplot2】不同方法画half -小提琴图
geom_ploygon:画出密度多边形(难度:**)gghalves画出half效果(难度:*)geom图层语法(难度:***)image.png实践模拟数据set.seed(20160229)my_data=
data.frame
caokai001
·
2023-08-21 00:23
怎么对数据框中的列划分区间
dt<-data.table(x=c(1:200),y=rnorm(200))dens<-density(dt$y)df<-
data.frame
(x=dens$x,y=dens$y)probs<-c(0.1,0.25,0.5,0.75,0.9
多克托刘
·
2023-08-19 09:35
R语言相关性分析
1.R语言自带函数cor(data,method="")可以快速计算出相关系数,数据类型:
data.frame
如
data.frame
为:zz,绘图如下:a.singleprotein:线性回归画法1.ggplot
MJades
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2023-08-15 15:17
学习小组Day6笔记--李斯亭
cheatsheets/网站下载tidyr一个数据处理包,把数据处理成标准统一的数据框下载安装install.packages("tidyr")library(tidyr)数据框基础bioplanet<-
data.frame
李斯亭
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2023-08-15 09:54
R语言生存分析算法的简单组合
<-rexp(n,rate=0.1)status<-rbinom(n,size=1,prob=0.7)var1<-rnorm(n)var2<-rnorm(n)var3<-rnorm(n)data1<-
data.frame
weixin_49320263
·
2023-08-15 08:15
机器学习
r语言
R语言实现计算净重新分类指数(NRI)和综合判别改善指数(IDI)
1、非生存资料:广义线性模型library(PredictABEL)#数据集data1<-
data.frame
(a=rnorm(n=1000,me
weixin_49320263
·
2023-08-15 08:45
模型评价
r语言
数据挖掘
R_DATACAMP10 Cluster Analysis in R分类分析
Calculatingdistancebetweenobservations计算两点间距离lims(x=c(-30,30),y=c(-20,20))应用于ggplot中,可以设置图标坐标轴的范围dist(two_players)dist(
data.frame
一条很闲的咸鱼
·
2023-08-14 14:54
数据框筛选和GO富集的小操作
比如下面这个数据框#gene是我随机抽取的基因library(tidyverse)library(clusterProfiler)library(org.At.tair.db)
data.frame
(gene
城管大队哈队长
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2023-08-14 04:40
横表变为竖表
library(tidyr)from=c("O1","O2","O3")D1=c(7,7,2)D2=c(3,2,0)D3=c(9,8,2)D4=c(3,2,10)df=
data.frame
(from,D1
mayoneday
·
2023-08-02 14:57
ggplot2绘制散点图进阶(一)
散点图参数调整数据产生利用rnorm()函数产生符合正态分布的随机数,
data.frame
()函数形成数据框。arnorm(150,mean=2,sd=10)#ab2*a+rnorm(100,
生信分析实验室
·
2023-07-27 04:22
R 基础知识:数据结构(
data.frame
& matrix & array)
我们可以运用
data.frame
()函数手动创造数据框,让我们建立一个很简单的数据框叫做great_nba_teams,这个数据框有队名、胜场数、败场数、是否获得总冠军与球季。
小盐罐儿
·
2023-07-24 22:54
PlotEnrichDotPlot ggplot2画图拆解
returnheatcolorsofgivenlengthGetMyHeatCols50){ht.col25){results<-results[1:25,]my.cols<-my.cols[1:25]}df<-
data.frame
Young.Dr
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2023-07-21 22:54
r
R语言寻找数据集缺失值位置
R语言寻找
data.frame
缺失值位置前言代码及解释后续的一些观察与处理前言R语言中并没有现成函数给出缺失值所在的位置,函数is.na()返回一个与原数据同型的逻辑“矩阵”(不一定是矩阵类型),现在我们自行编写一个函数用来寻找缺失值的具体位置
_唯欣主义
·
2023-07-14 13:12
R语言
r语言
学习
GRanges
在GRanges内部可以使用IRanges构建序列位置信息,速度比
data.frame
快许多基础操作一个单独的ranges对象可以有多个intervals,我们可以对其中的每一个intervals进行操作也可以对
nnlrl
·
2023-06-13 23:51
R学习第三天
一维是向量二维是矩阵创建数组array(数据,各维度最大值,维度命名)前两个dim向量格式最后一个dimnames是list格式读取数组中的值数组名[],可以是数字或维度的名称二、数据框不同列可以不同数据类型但列得统一
data.frame
会飞的海尔
·
2023-06-09 07:15
r股票数据接口读取CSV文件
r股票数据接口C++代码二、读取CSV文件1、读取csv文件应使用read.csv()函数read.csv("path");2、csv文件被默认加载为数据帧,即
data.frame
格式
l2接口
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2023-06-07 01:51
r股票数据接口
r语言
python
写代码时遇到的小问题
解决方法很简单:m<<-
data.frame
()##只需要把这个对象设置为全局变量即可###########################bedtools是一个很
哈哈哈_很高兴
·
2023-04-21 18:08
ggplot2:在一幅图中插入另外一幅图
需求我用ggplot2做了两幅图:柱形图library(ggplot2)df<-
data.frame
(x=LETTERS[1:10],y=10:1)dfggplot()+geom_bar(data=df
小明的数据分析笔记本
·
2023-04-18 06:23
矩阵转为ggplot2画图的数据格式
在使用ggplot2画图时,如果拿到的数据是NxN的,那么画图很不方便,需要转换成行列名称为新的列的标识下面的代码提供了转换的方法M1<-
data.frame
(matrix(1:25,nrow=5,dimnames
seqyuan
·
2023-04-17 11:23
R可视化学习-- (8) 环形柱状图
数据创建处理Category=paste0("category","_",1:9)Percent<-c(81,77,70,69,69,68,62,62,61)Result<-
data.frame
(Cate
凯凯何_Boy
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2023-04-15 02:07
R语言ggplot2作图的两套配色方案备选
这个不管了,啥产品自己也买不起哈哈哈,第一眼见到感觉配色确实很好看,如果应用到我们的科研数据可视化里应该也不错image.png把颜色摘下来做个柱形图看看library(ggplot2)df<-
data.frame
小明的数据分析笔记本
·
2023-04-14 04:21
ggplot2画分组蜜蜂图
构建数据data=
data.frame
(TN=sample(c("Tumor","Normal"),300,replace=T),variable=sample(c("g1","g2","g3"),300
旭日_太阳的后裔
·
2023-04-11 22:51
R语言字符串处理——一列中多种特殊字符的替换和拆分
代码library(dplyr)library(tidyr)dat%
data.frame
()##删除符号wordstoremove%as_tibble()%>%separate_rows(cleanaggregation
小八四爱吃甜食
·
2023-04-11 02:35
r语言
开发语言
R data-masking
>mtcars[mpg==21,]Errorin`[.
data.frame
`(mtcars,mpg==21,):object'mpg'notfound>mtcars[mtcars$mpg==21,]mpgcyldisphpdratw
BeeBee生信
·
2023-04-10 19:01
r语言中的或怎么表示什么不同_R语言中$是什么意思
通常我们的
data.frame
,list.向量等用$就可以。S4也有例如,有个维恩包Vennerable:S4类型,想取得里面IntersectionSets,信息必须用@符号。
weixin_39860583
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2023-04-10 17:42
r语言中的或怎么表示什么不同
【R】画图实践
32.pheatmap修改颜色bar王鹏提供代码library(pheatmap)GO_dat%mutate(total=up+down)dat2###Step1:显示加和结果ggplot(data=
data.frame
caokai001
·
2023-04-08 12:29
理解回归分析--机器学习与R语言实战笔记(第四章)
library(car)data("Quartet")str(Quartet)##############################'
data.frame
':11obs.of6variables:
zd200572
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2023-04-07 06:01
R语言 | 第一部分:数据预处理
1.创建数据集/矩阵【
data.frame
数据框、matrix矩阵、array数组】#数据框:将字段以列合并在一起。
数据驱动实践
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2023-04-06 09:32
fasta文件更改header
把它转化为
data.frame
后面问题就迎刃而解gtf文件是为了提取chr,start,end等信息,gtf文件读取需要安装rtracklayer包rm(list=ls())modify_fa%filter
落寞的橙子
·
2023-04-02 04:20
R语言数据框
data.frame
行和列求和方法
widgets<-c(179,153,183,153,154)gadgets<-c(167,193,190,161,181)thingys<-c(182,166,170,171,186)daily.prod<-
data.frame
czliutz
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2023-04-01 19:26
R
r语言
【R画图学习13.2】散点图---抖动散点图和蜂群图
y<-round(rnorm(1000),1)df<-
data.frame
(y=y,group=sample(c("G1","G2","G3","G4","G5"),size=1000,replace=
jjjscuedu
·
2023-04-01 16:50
数据处理 | R-tidyr包
#载入所需的R包library(dplyr)library(tidyr)#测试数据集widedata<-
data.frame
(person=c('A','B','C'),grade=c(5,6,4),score
生信补给站
·
2023-04-01 01:30
预测一下明年的国家线
用R建立一个回归模型看一看明年学硕、教育学的国家线建立数据框gjx<-
data.frame
(year=c(2017,2018,2019,2020,2021,2022),grade=c(310,320,325,331,337,351
ks_c
·
2023-03-31 18:40
clusterprofiler包进行GO与KEGG富集分析
/DEGs_filter.csv',header=T,row.names=1)gene<-DEG$Entrezidgenelist<-
data.frame
(DEG$Entrezid,DEG$log2FoldChange
twistti
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2023-03-29 04:28
r语言
数据库
R-基础-个案数据框、汇总数据框、交叉频数表互转
#个案数据框,本质上是
data.frame
数据类型class(iris)#[1]"
data.frame
"head(iris)#Sepal.LengthS
松鼠敲果壳
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2023-03-28 09:44
肿瘤干细胞相关性+药物敏感性
打分越接近1,干细胞程度越强,分化程度越低表达数据文件需要limma包,corrplot包遇到了困难,在用t进行转置时,他自动把我的小横线转换成点了,我就研究了好几个小时都不知道咋整,看果子的帖子说是
data.frame
小森的生统笔记
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2023-03-28 09:38
R: stair ggplot
library(plotly)library(ggplot2)d=
data.frame
(x=c(1,2,4,5,7,8,9),y=c(1,2,3,5,6,7,9))ggplot(data=d,mapping
小白菜学生信
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2023-03-25 21:40
R和SPSS计算的卡方值和p值不一样,WHY
有下面这个数据分A和B两组人群下面4行是不同疾病患病数image.png#首先我们建立一个dataframedat<-
data.frame
(low=c(13,7,21,6),high=c(77,22,21,71
蓝天_乎乎
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2023-03-23 18:55
GPL文件 一个探针对应多个symbol 整理成
data.frame
【已解决】
比如,10073_s_at——DDR1;10073_s_at——MIR4640;1053_at——RFC2……上代码:symbola=
data.frame
(probe=selectAnno$probe,
yadandb
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2023-03-23 16:32
R语言ggplot2作图小技巧:柱形图如何让y轴的起始点不是0
答案是在coord_cartesian(ylim=c(5,10))函数里设置y坐标的范围library(ggplot2)dat<-
data.frame
(x=LETTERS[1:10],y=10)ggplot
小明的数据分析笔记本
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2023-03-21 02:18
R: calculate prevalence
target),]n_row=nrow(tmp)rate=c()for(iin3:529){rate=c(rate,nrow(tmp[tmp[,i]>0.0001,])/n_row)}out_china=
data.frame
小白菜学生信
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2023-03-20 00:38
bioconductor入门——第三弹
首先我们需要引入一个新的函数DataFrame,它与
data.frame
类似,但是它的列变量可以是任何类型,比如IRanges。
鹿无为
·
2023-03-18 21:21
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