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利用clusterProfiler进行富集分析

前言:微博参与话题#给你四年时间你也学不会生信#主要参考：GEO数据挖掘小尝试：（三）利用clusterProfiler进行富集分析Y叔开发的R包clusterProfiler的确是最好用的，没有之一,

谢俊飞·2023-12-30 07:33

WPF中解决内存泄露的几点提示与解决方法

一直以来用WPF做一个项目，但是开发中途发现内存开销太大，用ANTSMemoryProfiler分析时，发现在来回点几次载入页面的操作中，使得非托管内存部分开销从起始的43.59M一直到150M，而托管部分的开销也一直持高不下

君子居易·2023-12-30 06:47

SQL server Profiler的使用

在SQLservermanagementstudio中的工具下选择SQLserverProfiler对sql进行过滤

wangqiaowq·2023-12-30 03:20

Android 布局分析工具（二）Layout Inspector使用

使用AndroidProfiler

颖字传说·2023-12-30 02:26

JProfiler for Mac/win中文版：Java性能分析工具的首选

JProfiler是一款功能强大的Java性能分析工具，它可以帮助开发人员快速定位和解决应用程序中的性能问题。无论是在开发阶段还是在生产环境中，JProfiler都能提供全面的性能分析和优化功能。

财源广进129·2023-12-30 00:54

R语言ggplot2做柱形图展示富集分析的结果

如果是研究比较多的物种，可以直接使用R语言包clusterProfiler做富集分析当然是最好，最后可以很少的代码拿到很漂亮的结果图。

小明的数据分析笔记本·2023-12-27 11:01

JVM CPU Profiler技术原理及源码深度解析

JVMCPUProfiler技术原理及源码深度解析研发人员在遇到线上报警或需要优化系统性能时，常常需要分析程序运行行为和性能瓶颈。

CoderChronicle·2023-12-26 22:48

Unity检测AssetBundle是否循环依赖

usingSystem.Collections;usingSystem.Collections.Generic;usingUnityEngine;usingUnityEditor;publicclassDependProfiler

Dongo2·2023-12-26 20:01

memory_profiler python 代码内存性能分析

安装pipinstallmemory_profiler使用#在需要分析内存性能的函数前面添加修饰符@profiler@profiler@profiler(precision=4,stream=open(

哦豁灬·2023-12-24 08:20

华为手机androidstudio打开profiler app崩溃

今天在使用鸿蒙系统华为调试app时，使用profiler来监控性能。但是刚打开profiler几秒钟就崩溃了。

寒冷de星空·2023-12-23 17:03

SpringBoot应用的性能优化

可以使用诸如SpringActuator、JProfiler、VisualVM等工具来监控应用的性能指标，如响应时间、内存使用情况、线程状态等。三、性能优化点数据库

程序员升仔·2023-12-22 11:12

clusterProfiler模式物种的GO与KEGG功能富集与注释

支持的20个模式物种列表如下：|Package|Maintainer|Title|Index||org.Hs.eg.db|BioconductorPackageMaintainer|GenomewideannotationforHuman|3||org.Mm.eg.db|BioconductorPackageMaintainer|GenomewideannotationforMouse|5||or

Seurat_Satija·2023-12-21 14:10

猿小羽·2023-12-20 17:14

快速处理EDI数据映射：知行EDI Profiler 操作指南

为解决上述问题，我们的研发人员攻坚克难，开发出知行EDIProfiler！旨在打破信息壁垒，让用户如鱼得水般快速、高效、准确的完成EDI报文的映

知行EDI·2023-12-20 11:53

转录组分析(11) - GO/KEGG富集分析(3)

对于没有Org.Db的非模式生物，由于某些原因不制作Org.Db，然后利用clusterProfiler做富集数据格式##Annotation_GO.xlsxGene.IDBiological.PathwayBP.DescriptionMolecular.FunctionMF.DescriptionCellular.ComponentCC.Descriptiongene

半夜一更·2023-12-19 07:15

使用JProfiler分析OOM系统快照

当你阅读这篇文章的时候，内心基本是急躁的。但是我从来不多说废话直接上干货。1当收到公司系统邮件/短信告警的时候。二话不多说先上服务器。2先通过top-c查看当前服务器进程并记录当前消耗cpu最高线程的pid。发现当前线程pid为744的使用率最高。2然后通过下面的命令到处jvm内存快照jmap-dump:formart=b.file=java_pid_744.hprof744(java_pid_7

Dkodak·2023-12-18 16:38

R语言学习之GO富集分析结果可视化（柱状图、网络图）

读取genesymbollibrary(clusterProfiler)library(org.Hs.eg.db)input<-read.table("gene.csv",sep=",",header=

佐博伊森·2023-12-17 07:19

Graphics Profiler 使用教程

GraphicsProfiler使用教程1.工具简介：2.Navigation介绍2.1.打开安装好的GraphicsProfiler。

yaoming168·2023-12-17 04:51

Unity Animator cpu性能测试

使用工具：UnityProfiler.Unity版本：unity2019.4.40f1测试环境：手机测试过程：没有挂在Animator时：Enable状态：Play状态：挂载Animator，但处于disable

幽满谷·2023-12-16 12:52

Unity Memory Profiler 一点记录

1、在编辑器模式下运行，所有在工程里的资源都会被统计进去2、删掉这些资源后，资源没有被统计了3、从Assetbundle中Load出GameObject，但不实例化，也是会进入内存的。所以如果遇到渲染率为0的情况，可能是因为在内存池里，但是没有被渲染，这是内存池的一个弊端翻译搜索复制

Moyiii·2023-12-15 19:34

react内置组件之＜Profiler＞＜/Profiler＞

1、作用：Profiler是React提供的一个内置组件，用于帮助你检测并分析React应用中的性能瓶颈。它可以帮助你了解组件渲染所花费的时间，并提供有关哪些组件需要进行优化的信息。

秃头的小毛驴·2023-12-14 15:38

09.JVM核心知识点-Java第一阶段

HotSpot新生区--老年区--永久区(JDK8元空间)GC算法JVM--jvm垃圾收集（标记-清除,复制，标记-整理，分代）算法出现OOM(OutOfMemoryError)故障可以通过内存快照分析工具Jprofiler

天堂比不过家乡啦·2023-12-06 12:29

Java的dump文件分析及JProfiler使用

Java的dump文件分析及JProfiler使用1dump文件介绍从软件开发的角度上，dump文件就是当程序产生异常时，用来记录当时的程序状态信息（例如堆栈的状态）,用于程序开发定位问题。

NPE~·2023-12-06 12:19

App内存优化

背景介绍内存是大问题但缺乏关注压实骆驼的最后一个稻草（堆栈溢出）2.内存问题内存抖动：锯齿状、GC导致卡顿内存泄露：可用内存减少、频繁GC内存溢出：OOM，程序异常二、优化工具选择1.工具选择MemoryProfiler

宝宝也要写博客·2023-12-06 10:07

【寒武纪（6）】MLU推理加速引擎MagicMind，最佳实践（一）

MagicMind依赖示例C++编程模型sample_ops/sample_add算子操作混合精度部署多模型部署单模型多实例部署多卡部署最佳实践1、性能指标吞吐率延时工具mm_run性能优化2内存工具Profiler

Hali_Botebie·2023-12-04 23:08

Android 内存泄漏

内存泄漏1，使用adb命令：adbshelldumpsysmeminfo包名，查看当前activity数量2，使用AS中Profiler进一步问题排查，点击DumpJAVAheap导出堆分配常见内存泄漏的情况

呓曲流觞·2023-12-04 22:19

MongoDB 慢查询分析

也可以在客户端调用db.setProfilingLevel(级别)命令来实时配置，Profiler信息保存在system.profile中。

雨中中人·2023-12-04 13:35

React如何检查组件性能

可以使用Profiler来查看组件的渲染速度Profiler的基本使用需要将标签包裹在需要检查渲染速度的组件外部需要绑定id属性，该属性是唯一标识，用于区分其他Profiler需要onRender函数，

田本初·2023-12-04 01:19

ubuntu20.04编译安装qt5.14.2和qtcreator4.12.0

编译qt5.14.2本来编译安装的是qt5.15.2，编译安装ok，一切就绪，安装qtcreator安装后一直报错，“以下插件有错误，无法载入：QmlDesignerQmlProfiler，插件初始化失败

l550802356·2023-12-03 05:41

病理纹理特征提取利器——CellProfiler教程-安装说明

Bilibili：https://space.bilibili.com/542601735入群讨论请加vhochzeitstorte请注明“核磁共振学习”公众号：美好事物中转站公众号“美好事物中转站”回复“CellProfiler

有Li·2023-12-03 00:24

SQL Server Profiler使用方法

简介SQLServerProfiler的中文意思是SQLServer事件探查，一个Sql的监视工具，可以具体到每一行Sql语句，每一次操作，和每一次的连接。

程序二次开发·2023-12-02 20:07

2021-03-12 R语言之安装R与R Studio 以及 clusterprofiler R包

1、安装R先安装R语言，到官网https://www.r-project.org/，点击downloadR，选择镜像China的随便一个，选择downloadRforWindows，选择installRforthefirsttime，选择最新版本，一般就是第一行，DownloadR4.0.4forWindows，下面也有perviousrelease旧版本，下载旧版本版本一般只需要选择R-版本号-

1f9e79f37c42·2023-12-02 13:09

Java 进阶 06 —— JVM 垃圾回收算法

具体过程MAT与JProfiler的GCRoots溯源获取dump文件垃圾清除阶段标记-清除算法（Mark-Sweep）背景执行过程复制算法（Copying）背景核

超级码力Honng·2023-12-02 03:40

Jprofiler分析性能调优--远程连接服务器服务

java性能监控工具，调优工具，因为现在用IDEA编辑器的比较多，所以选择使用Jprofiler。可以在IDE中安装插件，直接使用监控方式启动。

所执者唯己·2023-12-01 23:42

Java开发分析 JProfiler 14中文 for Mac

JProfilerMac版新增功能已添加用于传出请求的HTTP探测。同步和异步调用都是测量的。

xiaoyubulubulu·2023-12-01 14:16

mac调试android studio,Mac系统下AndroidStudio真机调试

一、首先将android手机通过USB数据线连接Mac，获取设备的ProductID，这里提供两种获取方式：打开终端输入：system_profilerSPUSBDataType，获取如下信息:ProductID

古明地幔·2023-12-01 12:43

代码优化

优化总思路方法：找出程序中执行缓慢或占用内存较大的地方进行优化——程序内部循环重复调用、调用第三方库最该被优化；途径：经验查找；VisualC++内置的性能工具profiler来找出程序中消耗最多内存的地方

froginhot·2023-12-01 07:49

JVM —— 内存泄漏判断（JProfiler）

文章目录JVM——内存泄漏判断（JProfiler）基本定义JProfiler安装IDEA插件JProfiler实战模拟内存泄漏修改JVM启动项启动项启动程序（非JProfiler）总结JVM——内存泄漏判断

弗兰克扬·2023-11-30 10:41

游戏开发性能优化经验总结

Analyze最后再尽可能将问题逐个解决–Solve游戏开发中一定是先做工具，进行Profile，再进行优化，所以，说优化就不得不再扯一下Profile常见的工具有一些是引擎和IDE自带的，比如Unity自带的Profiler

lz201234·2023-11-30 08:56

R语言ggplot2绘制Y轴截断柱形图

有时候做柱形图如果其中某一两个数值非常大，作图的时候其他柱子就非常低，看起来就不是很美观，其中一种办法是对Y轴进行截断，如果单纯使用ggplot2的代码实现起来还是相对比较麻烦的，Y叔（ggtree/clusterProfiler

小明的数据分析笔记本·2023-11-30 03:37

一次脚本测试的内存增长问题

Profiler工具分析将执行100的hprof和500次的hprof文件分别导入AndroidStudio的Profiler中。可以看到“0

lzyang朝阳·2023-11-27 18:43

SQL server 2008 R2安装好之后没有SQL server profiler

一些人在安装好SQLserver2008r2或者从empress升级到enterprise或者开发版之后没有SQLserverprofiler功能，如果需要加装则应该找到自己的安装文件（部分网上下载的exe

影孓·2023-11-27 14:26

java hprof文件_mat工具MemoryAnalyzer进行分析java内存溢出hprof文件

服务端程序报错后会生成hprof文件，我们可以通过mat工具MemoryAnalyzer进行分析下载地址：http://www.eclipse.org/mat/downloads.php说明：查看HPROF快照JProfiler

weixin_39716877·2023-11-27 10:01

性能优化中使用Profiler进行内存泄露的排查及解决方式

文章目录一、前言二、内存泄露的排查方式三、参考链接一、前言对于常规意义上的线程使用要及时关闭，数据库用完要及时关闭，数据用完要及时清空等等这里不再赘述，但是在开发中总会有不熟悉的api，开发进度过快，开发人员粗心等等原因导致内存泄露。可以使用leakcanary(参考链接:https://square.github.io/leakcanary/)内存检测处理，或者使用lint(参考链接:https

Mr_Tony·2023-11-26 13:22

JVM-07-垃圾回收概述和相关算法

具体过程代码演示MAT与JProfiler的GCRoots溯源MAT介绍获取du

迷雾总会解·2023-11-26 10:07

性能优化中使用Profiler进行页面卡顿的排查及解决方式

文章目录一、前言二、页面卡顿的排查方式1、耗时操作的监控2、页面卡顿的监控三、参考链接一、前言程序的优化在做过线上bug处理，布局层级优化，项目依赖库版本更新，重复库合并，删除未使用的资源，删除冗余的库，避免因为一个类而引入一个库的问题，leakcanary(参考链接:https://square.github.io/leakcanary/)内存检测处理，lint(参考链接:https://dev

Mr_Tony·2023-11-26 05:43

金仓数据库KingbaseES数据库开发指南（4. 面向应用程序的PL/SQL开发）

单元概述¶4.1.4.创建PL/SQL子程序和包¶4.1.5.更改PL/SQL子程序和包¶4.1.6.删除PL/SQL子程序和包¶4.1.7.从SQL语句调用存储的PL/SQL函数¶4.2.PL/SQLProfiler

沉舟侧畔千帆过_·2023-11-25 09:40

Unity 打印安卓apk报错的调试log

2.unity3d环境设置：【File】|【BuildingSettings】开启必备选项（只是控制台看log，其他非必选；如果要连接unity的profiler必须开发选项都选）：DevelopmentBuild

.卡·2023-11-24 18:31

SQL Server Profiler工具使用说明

一、SQLProfiler工具简介SQLProfiler是一个图形界面和一组系统存储过程，其作用如下：图形化监视SQLServer查询；在后台收集查询信息；分析性能；诊断像死锁之类的问题；调试T-SQL

xxc1605629895·2023-11-24 13:01

使用 SQL Server Profiler 跟踪数据库

使用SQLServerProfiler跟踪数据库如果我们的数据库应用系统中，存在有大量表，视图，索引，触发器，函数，存储过程，sql语句等等，又性能低下，而我们又要对其优化，那该怎么办？

5-7-0·2023-11-24 13:47

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