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r语言quantmond
在TCGA上下载数据并且进行处理
使用
R语言
脚本对数据进行处理,将其提取为genesymbol和样本的数据,推荐看一下该博主处理数据!!真的非常详细!他
R语言
脚本在这个链接里
Red Red
·
2024-09-11 09:00
生信小技巧
r语言
数据库
R语言
-非结构化数据-文本数据读入
#2.2.2非结构化数据-文本数据读入rm(list=ls())#清空工作空间##1.读入简单文本数据###假如数据包含大量经过结构化的文本数据#只需按照读入csv等标准式数据的方法读入#例:novel=read.csv("novel.csv",fileEncoding="UTF-8")head(novel)##2.用readtable读入文本###文本数据普通读法test=read.table(
pdc31czy
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2024-09-10 22:44
R
r语言
数据分析
Coding and Paper Letter(十四)
1Coding:1.
R语言
包ungeviz,ggplot2的拓展包,专门用来作不确定性的可视化。ungeviz2.计算机图形学相关开源项目。计算机图形学光线追踪开源项目C++源码。
G小调的Qing歌
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2024-09-10 13:10
r语言
做绘制精美pcoa图_
R语言
高级绘图 — ggplot2
2)PCA的作图PCA主成分分析,可以将高维数据进行降维处理。我们的OTU表格就是典型的高维数据,可以对其进行降维处理得到主成分PC1和PC2,然后将所有样品都分解到这两个成分方向,进行散点绘图,可以直观的看出样品间的差异。首先需要一系列的统计处理,然后用ggplot2进行绘图,过程如下:#加载需要的三个包(需要先下载,再加载)>library(ade4)>library(ggplot2)>lib
weixin_39560002
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2024-09-10 06:59
r语言做绘制精美pcoa图
科研绘图系列:
R语言
扩展物种堆积图(Extended Stacked Barplot)
介绍
R语言
的扩展物种堆积图是一种数据可视化工具,它不仅展示了物种的堆积结果,还整合了不同样本分组之间的差异性分析结果。
生信学习者1
·
2024-09-09 16:10
SCI科研绘图系列
r语言
数据可视化
数据分析
科研绘图系列:
R语言
柱状图分布(histogram plot)
文章目录介绍加载R包读取数据画图介绍柱状图(BarChart)是一种常用的数据可视化图表,用于展示和比较不同类别或组的数据。它通过在二维平面上绘制一系列垂直或水平的柱子来表示数据的大小,每个柱子的长度或高度代表一个数据点的数值。柱状图非常适合于展示分类数据的分布和比较。柱状图的特点:直观比较:柱状图可以直观地展示不同类别之间的数值比较,易于理解。分类展示:数据按照类别或组别进行分组展示,每个类别用
生信学习者1
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2024-09-09 15:06
SCI科研绘图系列
r语言
数据可视化
科研绘图系列:
R语言
富集散点图(enrichment scatter plot)
介绍富集通路散点图(EnrichmentPathwayScatterPlot)是一种数据可视化工具,用于展示基因集富集分析(GeneSetEnrichmentAnalysis,GSEA)的结果。横坐标是对应基因名称,纵坐标是通路名称,图中的点表示该基因在某个通路下的qvalue,可以简单理解为不同环境下的贡献大小。加载R包导入所需要的R包,在导入前需要用户自己安装。library(readxl)l
生信学习者1
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2024-09-09 14:57
SCI科研绘图系列
r语言
数据可视化
Python-Matplotlib安装及简单使用
Matplotlib是一个Python的图形框架,类似于MATLAB和
R语言
。
riyuexingchen0909
·
2024-09-09 11:06
python
python
图形
sublime安装python库_Mac OS 轻松用 Sublime Text 3 配置Python编译环境
最近在学习数据分析相关的知识,对比Python和
R语言
在数据分析领域的优劣,Python更胜一筹。要学习Python,首先需要搭建编译环境。
weixin_39603397
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2024-09-09 06:34
在linux(ubuntu)中使用网页版的rstudio
RStudio是
R语言
集成开发环境的应用软件,RStudioServer是一个基于web访问的RStudio云端开发环境,需要安装在服务器上,支持多用户远程访问使用。
Chao_Powell_Hou
·
2024-09-08 11:46
推荐一份生物信息学入门很好的参考材料
/tutorials-2/这个是康涅狄格大学(UniversityofConnecticut)提供的一份教程,主要的内容包括1、生物信息学中经常用到的文件格式image.png2、linux操作系统和
R语言
的基础知识
小明的数据分析笔记本
·
2024-09-08 09:58
R语言
基础学习
R与RStudio
R语言
是数据科学和统计分析的语言,适合数据分析和数据可视化。R是开源的,拥有丰富的包(packages),可以与优化软件进行交互。
weixin_55475210
·
2024-09-06 19:54
r语言
学习
开发语言
学习小组Day5笔记--森蝶
6.表格在
R语言
中改名叫数据框7.函数或者命令不会用时,除了百度/谷歌搜索以外,用这个命令查看帮助:?read.table,调出对应的帮
松风
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2024-09-04 23:42
学习小组Day6笔记--魏麻将
注意:学生信,
R语言
必学的原因是丰富的图表和Biocductor上面的各种生信分析R包。安装和加载R
魏麻将
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2024-09-03 08:34
centos7
r语言
安装_centos7 R-4.0.2 安装
tar-zvxfR-4.0.2.tar.gzcdR-*yuminstall-ygccyuminstall-ygcc-gfortranyuminstall-ygcc-c++yuminstall-yglibc-headersyuminstall-ylibreadline6-devgfortranyuminstall-yreadline-develyuminstall-ywgetlibXt-devely
weixin_39777404
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2024-09-03 03:50
centos7
r语言安装
linux下载
R语言
失败,[已解决]CentOS7下安装rjags失败 installation of package ‘rjags’ had non-zero exit status...
问题CentOS7下安装rjags失败installationofpackage‘rjags’hadnon-zeroexitstatus详细报错>install.packages("gbs2ploidy",dependencies=TRUE)alsoinstallingthedependency‘rjags’tryingURL'https://cran.rstudio.com/src/contri
宁静致远敏
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2024-09-03 03:50
linux下载R语言失败
Centos 安装
R语言
环境 3.6
前言目前
R语言
最新版已经是4.0以上了,所以安装旧版本可以通过下载源码方式安装。
118路司机
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2024-09-03 03:19
R
CentOS
centos
r语言
python
R语言
使用rpart包构建决策树模型实战、使用prune函数按照指定复杂度对决策树剪枝、使用rpart.plot包中的prp函数可视化训练、剪枝好的决策树
R语言
使用rpart包构建决策树模型实战、使用prune函数按照指定复杂度对决策树剪枝、使用rpart.plot包中的prp函数可视化训练、剪枝好的决策树、type参数、extra参数、fallen.leaves
statistics.insight
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2024-09-02 14:39
r语言
决策树
数据挖掘
机器学习
r语言
变量长度不一致怎么办_C语言,C++常见编译错误
fatalerrorC1003:errorcountexceedsnumber;stoppingcompilation中文对照:错误太多,停止编译分析:修改之前的错误,再次编译fatalerrorC1004:unexpectedendoffilefound中文对照:文件未结束分析:一个函数或者一个结构定义缺少“}”、或者在一个函数调用或表达式中括号没有配对出现、或者注释符“”不完整等fataler
weixin_39624094
·
2024-09-02 02:46
r语言变量长度不一致怎么办
科研绘图系列:
R语言
单细胞差异基因四分图(Quad plot)
介绍在单细胞分析领域,为了探究不同分组间同一细胞类型的基因表达差异,研究者们常采用四分图(QuadPlot)作为分析工具。该图形的横轴代表比较组1,而纵轴代表比较组2。通过这种布局,四分图能够有效地展示两组间共有的差异表达基因,从而为深入理解细胞类型在不同条件下的分子特性提供直观的视角。这种可视化方法不仅揭示了组间基因表达的异同,还有助于识别可能在生物学过程或疾病发生中起关键作用的基因。加载R包导
生信学习者2
·
2024-09-02 01:45
R语言可视化
r语言
数据分析
数据挖掘
科研绘图系列:
R语言
组合堆积图(stacked barplot with multiple groups)
介绍通常堆积图的X轴表示样本,样本可能会存在较多的分组信息,通过组合堆积图和样本标签分组信息,我们可以得到一张能展示更多信息的可发表图形。加载R包knitr::opts_chunk$set(warning=F,message=F)library(tidyverse)library(cowplot)library(patchwork)导入数据数据可从以下链接下载(画图所需要的所有数据):百度云盘链接
生信学习者2
·
2024-09-02 01:45
R语言可视化
r语言
数据可视化
科研绘图系列:
R语言
雷达图(radar plot)
介绍雷达图,又称为蜘蛛网图或星形图,是一种以多轴方式显示数据的图表。它通常用于显示多个定量变量的值,这些变量被表示为从中心点向外延伸的轴。每个轴代表一个变量,而每个变量的值则通过从中心向外延伸的距离来表示。雷达图可以直观地展示多个变量之间的相对大小和关系。雷达图的特点:多维数据比较:可以同时比较多个变量,看它们在不同维度上的表现。综合评价:用于综合评价一个或多个对象在多个方面的表现。趋势分析:可以
生信学习者2
·
2024-08-31 22:25
R语言可视化
r语言
数据可视化
科研绘图系列:
R语言
饼图(pie chart)
介绍饼图是一种常用的数据可视化图表,它通过圆形的扇形区域来展示数据的比例关系。每个扇形的面积大小与其所代表的数据量成正比,从而直观地显示各部分在整体中所占的比重。特点:直观性:通过不同大小的扇形,可以直观地看到各个部分的相对大小。易于理解:圆形的分割使得人们容易理解各部分的相对比例。适合展示比例:特别适合展示各部分在整体中的比例关系。说明的问题:部分与整体的关系:显示每个部分在整体中所占的百分比。
生信学习者2
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2024-08-31 22:25
R语言可视化
r语言
数据可视化
科研绘图系列:
R语言
径向柱状图(Radial Bar Chart)
介绍径向柱状图(RadialBarChart),又称为雷达图或蜘蛛网图(SpiderChart),是一种在极坐标系中绘制的柱状图。这种图表的特点是将数据点沿着一个或多个从中心向外延伸的轴来展示,这些轴通常围绕着一个中心点均匀分布。特点:极坐标系统:数据点不是在直角坐标系中展示,而是在极坐标系中,围绕一个中心点。多维度数据展示:可以同时展示多个变量的数据,每个变量对应一个轴。视觉集中:所有数据点都围
生信学习者2
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2024-08-31 22:55
R语言可视化
r语言
数据可视化
科研绘图系列:
R语言
基础图形合集
R语言
在可视化方面具有极大的优势,因其本身就是统计学家为了研究统计问题开发的编程语言,因此极力推荐使用
R语言
可视化数据。
生信学习者2
·
2024-08-31 22:55
R语言可视化
其他
r语言
1区9+非肿瘤纯生信,逻辑清晰易懂,机器学习筛选关键基因的纯生信也可以发高水平期刊,抓紧上车!
两种相关疾病联合分析,包括非肿瘤结合非肿瘤,非肿瘤结合肿瘤或者非肿瘤结合泛癌分析4基于分型的非肿瘤生信分析5单细胞结合普通转录组生信分析目前非肿瘤生信发文的门槛较低,有需要的朋友欢迎交流研究概述:本研究首先使用
R语言
在三个基因表达
生信小课堂
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2024-08-30 17:58
R语言
基础-文档检索与环境配置-2019-06-29
R帮助函数`help.start()`,打开帮助文档首页`help.search("foo")`或`??foo,`以foo为关键词搜索本地帮助文档,`?Startup`查看与R有关的启动文件信息;`example("foo")`,函数foo的使用示例(引号可以省略)`RSiteSearch("foo")`,以foo为关键词,查询整个http://search.r-project.org网站的包,例
天涯清水
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2024-08-30 15:00
R语言
交互式绘图echarts4r包--3D深探
表面datadplyr::mutate(z=sin(x*x+y*y)*x/3.14)data|>e_charts(x)|>e_surface(y,z,wireframe=list(show=FALSE))|>e_visual_map(z)3维柱状图v<-LETTERS[1:10]matrix<-data.frame(x=sample(v,300,replace=
「已注销」
·
2024-08-29 15:19
r语言可视化
数据可视化
可视化
r语言
开发语言
6章2节:认识birthwt数据集,EpiDisplay和Gmodels扩展包的应用
在
R语言
的广泛应用领域中,数据集的选择与理解起着至关重要的作用。它既为学习
R语言
奠定了基础数据,又为我们开展统计分析和模型构建提供了强有力的支持。
数据科学和人工智能兴趣组
·
2024-08-29 13:33
用R探索医药数据科学
r语言
临床数据科学
统计学
数据科学
birthwt
数据集
gmodels
扩展包
epiDisplay
扩展包
跟着Cell学单细胞转录组分析(十二):转录因子分析
转录因子分析也是单细胞转录组常见的分析内容,
R语言
分析一般采用的是SCENIC包,具体原理可参考两篇文章。
KS科研分享与服务
·
2024-08-28 18:02
在B站看到有人提问说安东尼戴维斯的数据比邓肯好,画个图来比较下
作为
R语言
数据可视化爱好者,当然得找到邓肯和安东尼戴维斯的数据来可视化比较一番了数据来源https://www.basketball-reference.com/今年是安东尼戴维斯的第10个赛季,赛季刚刚开始
小明的数据分析笔记本
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2024-08-28 17:08
R语言
使用timeROC包计算存在竞争风险情况下的生存资料多时间AUC值、使用cox模型、并添加协变量、可视化存在竞争风险情况下的生存资料多时间ROC曲线
R语言
使用timeROC包计算存在竞争风险情况下的生存资料多时间AUC值、使用cox模型、并添加协变量、可视化存在竞争风险情况下的生存资料多时间ROC曲线目录
R语言
使用timeROC包计算存在竞争风险情况下的生存资料多时间
statistics.insight
·
2024-08-28 13:22
r语言
开发语言
数据挖掘
机器学习
R语言
机器学习 KNN 2个例子
代码的写法,参考来源是这本书:MachineLearningwithR,2ndEdition.pdf相关的资源我已经上传了,包括代码,数据,以及这行本书。下载链接–免积分下载。https://download.csdn.net/download/waterHBO/896756871.第一个例子,代码和过程,全部来自书上#我根据书中第三章KNN的内容来做的。#第3章,KNN,K-NearestNei
waterHBO
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2024-08-28 05:57
r语言
机器学习
开发语言
明天开课 |
R语言
专题班(直播:2023.6.17~6.21)
茗创科技专注于脑科学,涵盖(EEG/ERP,fMRI,结构像,DTI,ASL,FNIRS)等,欢迎留言讨论及转发推荐,也欢迎了解茗创科技的脑科学课程,数据处理服务及脑科学工作站销售业务,可添加我们的工程师(微信号MCKJ-zhouyi或17373158786)咨询。★课程简介★R是用于统计分析、绘图的语言和操作环境。R是属于GNU系统的一个自由、免费、源代码开放的软件,它是一个用于统计计算和统计制
茗创科技
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2024-08-27 19:48
开源的即时聊天解决方案Papercups
概览Papercups是一款开源的实时客户支持工具,它使用Elixi
r语言
构建,为注重客户数据隐私和安全性的公司提供了一个自托管的解决方案。
辣码甄源
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2024-08-27 17:43
精品开源应用分享
开源
github
信息与通信
R 语言学习教程,从入门到精通,R 绘图饼图(22)
1、R绘图饼图
R语言
提供来大量的库来实现绘图功能。饼图,或称饼状图,是一个划分为几个扇形的圆形统计图表,用于描述量、频率或百分比之间的相对关系。
知识分享小能手
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2024-08-27 15:03
数据分析
大数据
学习心得体会
r语言
学习
开发语言
python
大数据
绘图
统计学
R语言
dplyr过滤指定字符的行
过滤df数据框中,Class列中,含有字符"a",“b”,"c"的行df1%filter(Class%in%c("a","b","c"))
不懂python不懂R
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2024-08-26 14:45
R语言
r语言
R语言
中theme的调整技巧汇总-持续更新
1.如何扩充图片的上右下左位置的空白区域:unit(c(1.1,1,0.4,0.5),“cm”)表示使用厘米作为单位设置各个方向的边距,c(1.1,1,0.4,0.5)对应的顺序是:上、右、下、左。theme(plot.margin=unit(c(1.1,1,0.4,0.5),"cm"))#增加上方的空白2.如何调整图例中tick的颜色#修改图例的刻度颜色p1<-p1+guides(fill=gu
不懂python不懂R
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2024-08-26 13:09
R语言
r语言
R语言
代码中文乱码解决方法尝试
一、Rstudio相关设置改成UTF-8【Tools→GlobalOptions→Defaulttextencoding】二、Rstudio:File→Reopenwithencoding→选择UTF-8三、数据文本要更改为UTF-8编码,工具notepad++,操作:Encoding→ConverttoUTF-8,保存,参考四、读取数据时,在read.csv或其他读取函数中,添加读取文件编码的参
月亮月亮要去太阳
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2024-08-26 07:56
r语言
开发语言
R 语言学习教程,从入门到精通,R MySQL 连接使用(21)
R语言
读写MySQL文件需要安装扩展包,我们可以在R到控制台输入以下命令来安装:install.packages("RMySQL",repos="https://mirrors.ustc.
知识分享小能手
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2024-08-25 05:19
学习心得体会
大数据
数据分析
r语言
学习
mysql
开发语言
大数据
android
数据分析
科研绘图系列:
R语言
多分组箱线图(grouped boxplot)
介绍分组箱线图(GroupedBoxplot)是一种用于展示不同组别数据分布情况的统计图表。它将箱线图(Boxplot)按照不同的类别或组别进行分组,使得可以同时比较多个组别的数据特征。箱线图本身是一种标准化的显示数据分布的方法,它能够展示数据的中位数、四分位数以及异常值。箱线图的主要元素包括:中位数线:箱线图中的中位数值,表示数据的中心位置。上四分位数箱线:从上四分位数到中位数的区域。下四分位数
生信学习者2
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2024-08-23 09:45
R语言可视化
r语言
开发语言
R语言
使用caret包构建xgboost模型(xgbLinear算法)构建回归模型实战、通过method参数指定算法名称、通过trainControl函数控制训练过程
R语言
使用caret包构建xgboost模型(xgbLinear算法)构建回归模型实战、通过method参数指定算法名称、通过trainControl函数控制训练过程目录
R语言
使用caret包构建xgboost
statistics.insight
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2024-08-22 14:50
R语言入门课
算法
r语言
回归
机器学习
数据挖掘
基于
R语言
遥感随机森林建模与空间预测
随机森林作为一种集成学习方法,在处理复杂数据分析任务中特别是遥感数据分析中表现出色。通过构建大量的决策树并引入随机性,随机森林在降低模型方差和过拟合风险方面具有显著优势。在训练过程中,使用Bootstrap抽样生成不同的训练集,并在节点分裂时随机选择特征子集,这使得模型具备了处理高维和非线性数据的能力。随机森林对噪声和异常值具有鲁棒性,其预测结果通过对多棵树的集成投票或平均获得,减少了单个异常对结
weixin_贾
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2024-08-22 05:23
统计
语言类模型
分布式
R语言
microeco:一个用于微生物群落生态学数据挖掘的R包(构建microeco对象。
R语言
microeco:一个用于微生物群落生态学数据挖掘的R包。主要功能R6类;分类群丰度图,维恩图,Alpha多样性,Beta多样性,差异丰度分析,环境数据分析,零模型分析,网络分析,功能分析。
还是要前进啊
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2024-03-18 20:30
R语言
r语言
数据挖掘
机器学习简介
有味写在前面在年前将要进行靶向代谢组学测定的样品送去公司,随之想想,还有一个半月的时间数据才会回来,那么这段时间是不是可以先学习下分类数据如何分析呢(PS:因为数据是属于分类性质的),所以不久前买的一本书——《机器学习与
R语言
Dayueban
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2024-03-18 12:00
R语言
安装包tidyverse时,报Error: package or namespace load failed for ‘tidyverse’ 错误
R语言
再安装tidyverse包时,宝如下的错误:>library(tidyverse)#操作Error:packageornamespaceloadfailedfor‘tidyverse’inlibrary.dynam
石榴花专场
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2024-03-13 06:26
servlet
r语言
数据挖掘
数据分析
R语言
及其开发环境简介
R语言
及其开发环境简介
R语言
历史
R语言
来自S语言,是S语言的一个变种。S语言由贝尔实验室研究开发,著名的C语言、Unix系统也是贝尔实验室开发的。
luohaha66
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2024-03-11 02:56
R
常规
r语言
R语言
统计学书记推荐
https://learningstatisticswithr.com/lsr-0.6.pdf图片发自App
热衷组培的二货潜
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2024-03-10 21:59
跟着Nature Communications学作图:
R语言
ggplot2绘制带有条纹的分组柱形图
论文Pan-Africangenomedemonstrateshowpopulation-specificgenomegraphsimprovehigh-throughputsequencingdataanalysishttps://www.nature.com/articles/s41467-022-31724-3本地pdfs41467-022-31724-3.pdf论文中公布了大部分图的数据,
小明的数据分析笔记本
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2024-03-10 17:29
python可以构建sem模型_结构方程模型(SEM)可用于微生态研究及
R语言
实现
导读结构方程模型(StructuralEquationModeling,SEM)是一种能基于变量之间的协方差矩阵分析多变量之间结构关系的多元统计分析方法,也被称为协方差结构模型。该方法是因子分析和多元回归分析的结合,可用于分析被测变量与潜在变量之间的结构关系,替代多重回归、通径分析、因子分析、协方差分析等分析方法。结构方程模型能在一次分析中估计多个相互关联的变量之间的依赖关系而受到研究者的青睐。早
weixin_39650139
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2024-03-10 05:00
python可以构建sem模型
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